RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560333.1

PDE8A-212, Transcript of phosphodiesterase 8A, humanhuman

TSL 3

Gene PDE8A, Length 543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8A-212ENST00000560333 CYSLTR1Q9Y271 337 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE8A-212ENST00000560333 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE8A-212ENST00000560333 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE8A-212ENST00000560333 H7C423 109 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE8A-212ENST00000560333 LELP1Q5T871 98 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE8A-212ENST00000560333 ERASQ7Z444 233 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE8A-212ENST00000560333 OR10D4PQ8NGN7 298 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE8A-212ENST00000560333 TIMM17AQ99595 171 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE8A-212ENST00000560333 TMEM243Q9BU79 118 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE8A-212ENST00000560333 C1orf43Q9BWL3 253 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE8A-212ENST00000560333 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PDE8A-212ENST00000560333 FGF6P10767 208 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE8A-212ENST00000560333 S100A2P29034 98 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE8A-212ENST00000560333 TCTAP57738 103 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE8A-212ENST00000560333 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE8A-212ENST00000560333 BAALCQ8WXS3 180 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE8A-212ENST00000560333 IFI27L1Q96BM0 104 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE8A-212ENST00000560333 AMELXQ99217 191 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE8A-212ENST00000560333 LINC00588Q9Y4M8 146 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE8A-212ENST00000560333 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE8A-212ENST00000560333 A0A1B0GUV1 79 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE8A-212ENST00000560333 LINC01549A6NIU2 74 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE8A-212ENST00000560333 G0S2P27469 103 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE8A-212ENST00000560333 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PDE8A-212ENST00000560333 GAGE6Q13070 117 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE8A-212ENST00000560333 TMEM141Q96I45 108 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE8A-212ENST00000560333 SCGB3A1Q96QR1 104 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE8A-212ENST00000560333 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE8A-212ENST00000560333 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa6.82□□□□□ -1.32
PDE8A-212ENST00000560333 ATP5LO75964 103 aa6.82□□□□□ -1.32
PDE8A-212ENST00000560333 NPSP0C0P6 89 aa6.82□□□□□ -1.32
PDE8A-212ENST00000560333 MPV17L2Q567V2 206 aa6.82□□□□□ -1.32
PDE8A-212ENST00000560333 Q6ZUT4 128 aa6.82□□□□□ -1.32
PDE8A-212ENST00000560333 WFDC10BQ8IUB3 73 aa6.82□□□□□ -1.32
PDE8A-212ENST00000560333 SPANXA1Q9NS26 97 aa6.82□□□□□ -1.32
PDE8A-212ENST00000560333 HSPB8Q9UJY1 196 aa6.82□□□□□ -1.32
PDE8A-212ENST00000560333 RBX1P62877 108 aa6.81□□□□□ -1.32
PDE8A-212ENST00000560333 ODF1Q14990 250 aa6.81□□□□□ -1.32
PDE8A-212ENST00000560333 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
PDE8A-212ENST00000560333 PYY3Q5JQD4 70 aa6.81□□□□□ -1.32
PDE8A-212ENST00000560333 LINC01545Q5VT33 79 aa6.81□□□□□ -1.32
PDE8A-212ENST00000560333 CHCHD5Q9BSY4 110 aa6.81□□□□□ -1.32
PDE8A-212ENST00000560333 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
PDE8A-212ENST00000560333 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE8A-212ENST00000560333 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
PDE8A-212ENST00000560333 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
PDE8A-212ENST00000560333 KRTDAPP60985 99 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE8A-212ENST00000560333 PET117Q6UWS5 81 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE8A-212ENST00000560333 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE8A-212ENST00000560333 ZNF664Q8N3J9 261 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE8A-212ENST00000560333 UPK3BQ9BT76 320 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE8A-212ENST00000560333 CST9LQ9H4G1 147 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE8A-212ENST00000560333 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE8A-212ENST00000560333 A0A087WX48 190 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE8A-212ENST00000560333 PMVKQ15126 192 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE8A-212ENST00000560333 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
PDE8A-212ENST00000560333 C1orf134Q5TEV5 83 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE8A-212ENST00000560333 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE8A-212ENST00000560333 DNAH10OSP0CZ25 163 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE8A-212ENST00000560333 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
PDE8A-212ENST00000560333 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE8A-212ENST00000560333 UBE2L6O14933 153 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE8A-212ENST00000560333 PRSS1P07477 247 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE8A-212ENST00000560333 UBE2D1P51668 147 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE8A-212ENST00000560333 LINC01556Q5JQF7 62 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE8A-212ENST00000560333 Q6ZN92 141 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE8A-212ENST00000560333 OR5A1Q8NGJ0 315 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE8A-212ENST00000560333 PMCHL2Q9BQD1 86 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE8A-212ENST00000560333 PRR34Q9NV39 138 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE8A-212ENST00000560333 TMEM262E9PQX1 116 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE8A-212ENST00000560333 F8VRH5 84 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE8A-212ENST00000560333 AKR1D1P51857 326 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE8A-212ENST00000560333 CCL18P55774 89 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE8A-212ENST00000560333 COX6A2Q02221 97 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE8A-212ENST00000560333 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE8A-212ENST00000560333 ENHOQ6UWT2 76 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE8A-212ENST00000560333 Q6ZR54 194 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE8A-212ENST00000560333 NFE4Q86UQ8 179 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE8A-212ENST00000560333 VCX2Q9H322 139 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE8A-212ENST00000560333 A0A0J9YXV3 536 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE8A-212ENST00000560333 C11orf86A6NJI1 115 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE8A-212ENST00000560333 H0Y8G0 127 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE8A-212ENST00000560333 IGLC3P0DOY3 106 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE8A-212ENST00000560333 SMAGPQ0VAQ4 97 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE8A-212ENST00000560333 LINC00242Q5T6M2 205 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE8A-212ENST00000560333 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE8A-212ENST00000560333 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE8A-212ENST00000560333 TEX43Q6ZNM6 134 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE8A-212ENST00000560333 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE8A-212ENST00000560333 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE8A-212ENST00000560333 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE8A-212ENST00000560333 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE8A-212ENST00000560333 IGHV3-30P01768 117 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE8A-212ENST00000560333 IGHV3-33P01772 117 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE8A-212ENST00000560333 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE8A-212ENST00000560333 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE8A-212ENST00000560333 PKIAP61925 76 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE8A-212ENST00000560333 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE8A-212ENST00000560333 LINC00269Q8N2A0 174 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE8A-212ENST00000560333 TMEM101Q96IK0 257 aa6.74□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms