RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552346.1

USP15-218, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

TSL 2

Gene USP15, Length 655 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-218ENST00000552346 SPCS1Q9Y6A9 102 aa0.67□□□□□ -2.3
USP15-218ENST00000552346 ADGRL2O95490 1459 aa0.67□□□□□ -2.3
USP15-218ENST00000552346 BCE1O60756 84 aa0.66□□□□□ -2.3
USP15-218ENST00000552346 SEC11AP67812 179 aa0.66□□□□□ -2.3
USP15-218ENST00000552346 PRO0255Q9UI72 69 aa0.66□□□□□ -2.3
USP15-218ENST00000552346 TEX14Q8IWB6 1497 aa0.66□□□□□ -2.3
USP15-218ENST00000552346 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.3
USP15-218ENST00000552346 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa0.65□□□□□ -2.31
USP15-218ENST00000552346 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
USP15-218ENST00000552346 MUC5ACP98088 5654 aa0.65□□□□□ -2.31
USP15-218ENST00000552346 AKAP12Q02952 1782 aa0.65□□□□□ -2.31
USP15-218ENST00000552346 FAM223BA6NKX1 122 aa0.64□□□□□ -2.31
USP15-218ENST00000552346 C10orf142B7Z368 130 aa0.64□□□□□ -2.31
USP15-218ENST00000552346 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP0.64□□□□□ -2.31
USP15-218ENST00000552346 SFTA2Q6UW10 78 aa0.64□□□□□ -2.31
USP15-218ENST00000552346 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa0.63□□□□□ -2.31
USP15-218ENST00000552346 GNGT2O14610 69 aa0.63□□□□□ -2.31
USP15-218ENST00000552346 MT-ATP8P03928 68 aa0.63□□□□□ -2.31
USP15-218ENST00000552346 Q5BKY6 102 aa0.63□□□□□ -2.31
USP15-218ENST00000552346 AP4S1Q9Y587 144 aa0.63□□□□□ -2.31
USP15-218ENST00000552346 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa0.63□□□□□ -2.31
USP15-218ENST00000552346 IGF2RP11717 2491 aa0.62□□□□□ -2.31
USP15-218ENST00000552346 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP0.62□□□□□ -2.31
USP15-218ENST00000552346 M0R3E3 92 aa0.62□□□□□ -2.31
USP15-218ENST00000552346 NDUFC1O43677 76 aa0.62□□□□□ -2.31
USP15-218ENST00000552346 MPC2O95563 127 aa0.62□□□□□ -2.31
USP15-218ENST00000552346 S100A8P05109 93 aa0.62□□□□□ -2.31
USP15-218ENST00000552346 ABCC10Q5T3U5 1492 aa0.61□□□□□ -2.31
USP15-218ENST00000552346 PAPPAQ13219 1627 aa0.61□□□□□ -2.31
USP15-218ENST00000552346 I3L2K1 104 aa0.61□□□□□ -2.31
USP15-218ENST00000552346 M0R143 59 aa0.61□□□□□ -2.31
USP15-218ENST00000552346 NCMAPQ5T1S8 102 aa0.61□□□□□ -2.31
USP15-218ENST00000552346 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa0.61□□□□□ -2.31
USP15-218ENST00000552346 MLH3Q9UHC1 1453 aa0.61□□□□□ -2.31
USP15-218ENST00000552346 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa0.6□□□□□ -2.31
USP15-218ENST00000552346 LINC00032P0C843 101 aa0.6□□□□□ -2.31
USP15-218ENST00000552346 C10orf113Q5VZT2 155 aa0.6□□□□□ -2.31
USP15-218ENST00000552346 CHD9Q3L8U1 2897 aa0.6□□□□□ -2.31
USP15-218ENST00000552346 CCNB3Q8WWL7 1395 aa0.59□□□□□ -2.31
USP15-218ENST00000552346 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
USP15-218ENST00000552346 A0A1B0GWA3 101 aa0.59□□□□□ -2.31
USP15-218ENST00000552346 PMCHL2Q9BQD1 86 aa0.59□□□□□ -2.31
USP15-218ENST00000552346 DPY30Q9C005 99 aa0.59□□□□□ -2.31
USP15-218ENST00000552346 NHSL1Q5SYE7 1610 aa0.59□□□□□ -2.32
USP15-218ENST00000552346 ATOX1O00244 68 aa0.58□□□□□ -2.32
USP15-218ENST00000552346 UBA52P62987 128 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
USP15-218ENST00000552346 C1orf167Q5SNV9 1468 aa0.57□□□□□ -2.32
USP15-218ENST00000552346 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa0.57□□□□□ -2.32
USP15-218ENST00000552346 Q8IZM0 81 aa0.57□□□□□ -2.32
USP15-218ENST00000552346 PRO1933Q9H354 126 aa0.57□□□□□ -2.32
USP15-218ENST00000552346 LINC00846Q9NV44 126 aa0.57□□□□□ -2.32
USP15-218ENST00000552346 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
USP15-218ENST00000552346 SMARCA2P51531 1590 aa0.57□□□□□ -2.32
USP15-218ENST00000552346 TULP4Q9NRJ4 1543 aa0.56□□□□□ -2.32
USP15-218ENST00000552346 CACFD1Q9UGQ2 172 aa0.56□□□□□ -2.32
USP15-218ENST00000552346 SCRIBQ14160 1630 aa0.56□□□□□ -2.32
USP15-218ENST00000552346 ZNF292O60281 2723 aa0.55□□□□□ -2.32
USP15-218ENST00000552346 A0A0G2JND7 137 aa0.55□□□□□ -2.32
USP15-218ENST00000552346 PHGR1C9JFL3 82 aa0.55□□□□□ -2.32
USP15-218ENST00000552346 H7BZZ5 65 aa0.55□□□□□ -2.32
USP15-218ENST00000552346 SPINK1P00995 79 aa0.55□□□□□ -2.32
USP15-218ENST00000552346 USF3Q68DE3 2245 aa0.54□□□□□ -2.32
USP15-218ENST00000552346 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa0.54□□□□□ -2.32
USP15-218ENST00000552346 GPR98Q8WXG9 6306 aa0.54□□□□□ -2.32
USP15-218ENST00000552346 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP0.54□□□□□ -2.32
USP15-218ENST00000552346 A0A0G2JMZ2 1700 aa0.53□□□□□ -2.32
USP15-218ENST00000552346 PKIAP61925 76 aa0.53□□□□□ -2.32
USP15-218ENST00000552346 PIGYQ3MUY2 71 aa0.53□□□□□ -2.32
USP15-218ENST00000552346 SERP2Q8N6R1 65 aa0.53□□□□□ -2.32
USP15-218ENST00000552346 LINC01600Q96MT4 127 aa0.53□□□□□ -2.32
USP15-218ENST00000552346 TRGV9Q99603 122 aa0.53□□□□□ -2.32
USP15-218ENST00000552346 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP0.53□□□□□ -2.33
USP15-218ENST00000552346 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa0.53□□□□□ -2.33
USP15-218ENST00000552346 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP0.52□□□□□ -2.33
USP15-218ENST00000552346 PMCHL1Q16048 86 aa0.52□□□□□ -2.33
USP15-218ENST00000552346 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa0.52□□□□□ -2.33
USP15-218ENST00000552346 OTOGQ6ZRI0 2925 aa0.52□□□□□ -2.33
USP15-218ENST00000552346 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP0.51□□□□□ -2.33
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USP15-218ENST00000552346 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP0.51□□□□□ -2.33
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USP15-218ENST00000552346 SNHG12Q9BXW3 62 aa0.51□□□□□ -2.33
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USP15-218ENST00000552346 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa0.5□□□□□ -2.33
USP15-218ENST00000552346 PSMG4Q5JS54 123 aa0.5□□□□□ -2.33
USP15-218ENST00000552346 DEFB123Q8N688 67 aa0.5□□□□□ -2.33
USP15-218ENST00000552346 DNAJC13O75165 2243 aa0.5□□□□□ -2.33
USP15-218ENST00000552346 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa0.5□□□□□ -2.33
USP15-218ENST00000552346 SHPRHQ149N8 1683 aa0.49□□□□□ -2.33
USP15-218ENST00000552346 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
USP15-218ENST00000552346 AKAP6Q13023 2319 aa0.49□□□□□ -2.33
USP15-218ENST00000552346 ABCC2Q92887 1545 aa0.49□□□□□ -2.33
USP15-218ENST00000552346 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
USP15-218ENST00000552346 A0A087WVE0 104 aa0.49□□□□□ -2.33
USP15-218ENST00000552346 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa0.49□□□□□ -2.33
USP15-218ENST00000552346 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa0.49□□□□□ -2.33
USP15-218ENST00000552346 UQCRHP07919 91 aa0.49□□□□□ -2.33
USP15-218ENST00000552346 LCN9Q8WX39 176 aa0.49□□□□□ -2.33
USP15-218ENST00000552346 KMT2DO14686 5537 aa0.49□□□□□ -2.33
USP15-218ENST00000552346 MDN1Q9NU22 5596 aa0.49□□□□□ -2.33
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