RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549547.1

PRPF40B-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog B, humanhuman

TSL 5

Gene PRPF40B, Length 697 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40B-210ENST00000549547 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
PRPF40B-210ENST00000549547 CD164L2Q6UWJ8 174 aa8.46□□□□□ -1.06
PRPF40B-210ENST00000549547 Q6ZUT4 128 aa8.46□□□□□ -1.06
PRPF40B-210ENST00000549547 CYSLTR1Q9Y271 337 aa8.46□□□□□ -1.06
PRPF40B-210ENST00000549547 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa8.46□□□□□ -1.06
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PRPF40B-210ENST00000549547 Q8N1X5 172 aa8.45□□□□□ -1.06
PRPF40B-210ENST00000549547 C15orf56Q8N910 161 aa8.45□□□□□ -1.06
PRPF40B-210ENST00000549547 C9orf163Q8N9P6 203 aa8.45□□□□□ -1.06
PRPF40B-210ENST00000549547 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa8.45□□□□□ -1.06
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PRPF40B-210ENST00000549547 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
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PRPF40B-210ENST00000549547 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa8.41□□□□□ -1.06
PRPF40B-210ENST00000549547 LINC01546A6NGU7 62 aa8.41□□□□□ -1.06
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PRPF40B-210ENST00000549547 APOMO95445 188 aa8.41□□□□□ -1.06
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PRPF40B-210ENST00000549547 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa8.4□□□□□ -1.06
PRPF40B-210ENST00000549547 LINC00614P0C842 121 aa8.4□□□□□ -1.06
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PRPF40B-210ENST00000549547 FAM104AQ969W3 186 aa8.4□□□□□ -1.06
PRPF40B-210ENST00000549547 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
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PRPF40B-210ENST00000549547 A0A1B0GV90 55 aa8.39□□□□□ -1.07
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PRPF40B-210ENST00000549547 ABCA13Q86UQ4 5058 aa8.38□□□□□ -1.07
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PRPF40B-210ENST00000549547 HIST3H2BBQ8N257 126 aa8.38□□□□□ -1.07
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PRPF40B-210ENST00000549547 FAT1Q14517 4588 aa8.36□□□□□ -1.07
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PRPF40B-210ENST00000549547 AMELXQ99217 191 aa8.36□□□□□ -1.07
PRPF40B-210ENST00000549547 UBE2D1P51668 147 aa8.35□□□□□ -1.07
PRPF40B-210ENST00000549547 SEC11AP67812 179 aa8.35□□□□□ -1.07
PRPF40B-210ENST00000549547 SYCNQ0VAF6 134 aa8.35□□□□□ -1.07
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PRPF40B-210ENST00000549547 LINC00242Q5T6M2 205 aa8.34□□□□□ -1.07
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PRPF40B-210ENST00000549547 LINC00173Q6ZV60 143 aa8.33□□□□□ -1.08
PRPF40B-210ENST00000549547 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa8.33□□□□□ -1.08
PRPF40B-210ENST00000549547 LINC01561Q8N1V8 128 aa8.33□□□□□ -1.08
PRPF40B-210ENST00000549547 ORAOV1Q8WV07 137 aa8.33□□□□□ -1.08
PRPF40B-210ENST00000549547 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
PRPF40B-210ENST00000549547 CAMK2N2Q96S95 79 aa8.33□□□□□ -1.08
PRPF40B-210ENST00000549547 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa8.33□□□□□ -1.08
PRPF40B-210ENST00000549547 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PRPF40B-210ENST00000549547 COX6A2Q02221 97 aa8.32□□□□□ -1.08
PRPF40B-210ENST00000549547 LINC00528Q8N1L1 170 aa8.32□□□□□ -1.08
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