RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543658.5

DDB1-223, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, human

TSL 4

Gene DDB1, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDB1-223	ENST00000543658	MAL	P21145	153 aa		7.96	□□□□□ -1.14
DDB1-223	ENST00000543658	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		7.96	□□□□□ -1.14
DDB1-223	ENST00000543658	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		7.96	□□□□□ -1.14
DDB1-223	ENST00000543658	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		7.95	□□□□□ -1.14
DDB1-223	ENST00000543658		H3BRM9	83 aa		7.95	□□□□□ -1.14
DDB1-223	ENST00000543658	COX7A2L	O14548	114 aa		7.95	□□□□□ -1.14
DDB1-223	ENST00000543658	APOM	O95445	188 aa		7.95	□□□□□ -1.14
DDB1-223	ENST00000543658	IGLC3	P0DOY3	106 aa		7.95	□□□□□ -1.14
DDB1-223	ENST00000543658	PLN	P26678	52 aa		7.95	□□□□□ -1.14
DDB1-223	ENST00000543658	AKR1D1	P51857	326 aa		7.95	□□□□□ -1.14
DDB1-223	ENST00000543658	ODF1	Q14990	250 aa		7.95	□□□□□ -1.14
DDB1-223	ENST00000543658	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		7.95	□□□□□ -1.14
DDB1-223	ENST00000543658	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		7.95	□□□□□ -1.14
DDB1-223	ENST00000543658	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	7.95	□□□□□ -1.14
DDB1-223	ENST00000543658	DPM2	O94777	84 aa		7.94	□□□□□ -1.14
DDB1-223	ENST00000543658	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		7.94	□□□□□ -1.14
DDB1-223	ENST00000543658	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		7.94	□□□□□ -1.14
DDB1-223	ENST00000543658	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		7.93	□□□□□ -1.14
DDB1-223	ENST00000543658	IGKC	P01834	107 aa		7.93	□□□□□ -1.14
DDB1-223	ENST00000543658	FOXI1	Q12951	378 aa		7.93	□□□□□ -1.14
DDB1-223	ENST00000543658	CFAP161	Q6P656	301 aa		7.93	□□□□□ -1.14
DDB1-223	ENST00000543658	C5orf38	Q86SI9	138 aa		7.93	□□□□□ -1.14
DDB1-223	ENST00000543658	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		7.93	□□□□□ -1.14
DDB1-223	ENST00000543658	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		7.92	□□□□□ -1.14
DDB1-223	ENST00000543658	C11orf86	A6NJI1	115 aa		7.92	□□□□□ -1.14
DDB1-223	ENST00000543658		J3QL48	77 aa		7.92	□□□□□ -1.14
DDB1-223	ENST00000543658	HERVK_113	P61574	105 aa		7.92	□□□□□ -1.14
DDB1-223	ENST00000543658	COX6A2	Q02221	97 aa		7.92	□□□□□ -1.14
DDB1-223	ENST00000543658	LINC01545	Q5VT33	79 aa		7.92	□□□□□ -1.14
DDB1-223	ENST00000543658	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		7.91	□□□□□ -1.14
DDB1-223	ENST00000543658	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		7.91	□□□□□ -1.14
DDB1-223	ENST00000543658	EREG	O14944	169 aa		7.91	□□□□□ -1.14
DDB1-223	ENST00000543658	SCGB1D1	O95968	90 aa		7.91	□□□□□ -1.14
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	7.91	□□□□□ -1.14
DDB1-223	ENST00000543658	C14orf177	Q52M58	125 aa		7.91	□□□□□ -1.14
DDB1-223	ENST00000543658	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		7.91	□□□□□ -1.14
DDB1-223	ENST00000543658	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		7.91	□□□□□ -1.14
DDB1-223	ENST00000543658	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		7.9	□□□□□ -1.14
DDB1-223	ENST00000543658		A0A087WZ39	114 aa		7.9	□□□□□ -1.14
DDB1-223	ENST00000543658	PRSS2	P07478	247 aa		7.9	□□□□□ -1.14
DDB1-223	ENST00000543658	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		7.9	□□□□□ -1.14
DDB1-223	ENST00000543658		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	7.9	□□□□□ -1.14
DDB1-223	ENST00000543658	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		7.9	□□□□□ -1.14
DDB1-223	ENST00000543658	USP17L23	D6RBM5	183 aa		7.89	□□□□□ -1.15
DDB1-223	ENST00000543658	SPINK8	P0C7L1	97 aa		7.89	□□□□□ -1.15
DDB1-223	ENST00000543658	ORAOV1	Q8WV07	137 aa		7.89	□□□□□ -1.15
DDB1-223	ENST00000543658	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		7.88	□□□□□ -1.15
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		7.88	□□□□□ -1.15
DDB1-223	ENST00000543658	LECT2	O14960	151 aa		7.88	□□□□□ -1.15
DDB1-223	ENST00000543658	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		7.88	□□□□□ -1.15
DDB1-223	ENST00000543658	KMT2A	Q03164	3969 aa		7.87	□□□□□ -1.15
DDB1-223	ENST00000543658	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		7.87	□□□□□ -1.15
DDB1-223	ENST00000543658	hDV102S1	A0JD36	115 aa		7.87	□□□□□ -1.15
DDB1-223	ENST00000543658	SPAG11B	Q08648	103 aa		7.87	□□□□□ -1.15
DDB1-223	ENST00000543658	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		7.87	□□□□□ -1.15
DDB1-223	ENST00000543658	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		7.87	□□□□□ -1.15
DDB1-223	ENST00000543658	TMEM223	A0PJW6	202 aa		7.86	□□□□□ -1.15
DDB1-223	ENST00000543658	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		7.86	□□□□□ -1.15
DDB1-223	ENST00000543658	RTL8C	O15255	209 aa		7.86	□□□□□ -1.15
DDB1-223	ENST00000543658	ATOH7	Q8N100	152 aa		7.86	□□□□□ -1.15
DDB1-223	ENST00000543658	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		7.86	□□□□□ -1.15
DDB1-223	ENST00000543658		A0A087WTM6	91 aa		7.85	□□□□□ -1.15
DDB1-223	ENST00000543658	JOSD1	Q15040	202 aa	Predicted RBP	7.85	□□□□□ -1.15
DDB1-223	ENST00000543658	C15orf56	Q8N910	161 aa		7.85	□□□□□ -1.15
DDB1-223	ENST00000543658	COX7B2	Q8TF08	81 aa		7.85	□□□□□ -1.15
DDB1-223	ENST00000543658	RYR3	Q15413	4870 aa		7.85	□□□□□ -1.15
DDB1-223	ENST00000543658	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	7.84	□□□□□ -1.15
DDB1-223	ENST00000543658	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		7.84	□□□□□ -1.15
DDB1-223	ENST00000543658	CXCL5	P42830	114 aa		7.84	□□□□□ -1.15
DDB1-223	ENST00000543658	CKS1B	P61024	79 aa		7.84	□□□□□ -1.15
DDB1-223	ENST00000543658	TNP2	Q05952	138 aa		7.84	□□□□□ -1.15
DDB1-223	ENST00000543658	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		7.84	□□□□□ -1.15
DDB1-223	ENST00000543658		Q8IZM0	81 aa		7.84	□□□□□ -1.15
DDB1-223	ENST00000543658	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		7.84	□□□□□ -1.15
DDB1-223	ENST00000543658	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		7.84	□□□□□ -1.15
DDB1-223	ENST00000543658	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		7.84	□□□□□ -1.15
DDB1-223	ENST00000543658	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	7.83	□□□□□ -1.16
DDB1-223	ENST00000543658	IGLV2-33	A0A075B6J2	118 aa	Predicted RBP	7.83	□□□□□ -1.16
DDB1-223	ENST00000543658	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	7.83	□□□□□ -1.16
DDB1-223	ENST00000543658	WFDC2	Q14508	124 aa		7.83	□□□□□ -1.16
DDB1-223	ENST00000543658		Q8N814	137 aa		7.83	□□□□□ -1.16
DDB1-223	ENST00000543658	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		7.83	□□□□□ -1.16
DDB1-223	ENST00000543658	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		7.83	□□□□□ -1.16
DDB1-223	ENST00000543658	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	7.82	□□□□□ -1.16
DDB1-223	ENST00000543658		F8WDY8	70 aa		7.82	□□□□□ -1.16
DDB1-223	ENST00000543658	NDUFA1	O15239	70 aa		7.82	□□□□□ -1.16
DDB1-223	ENST00000543658	LEPROT	O15243	131 aa		7.82	□□□□□ -1.16
DDB1-223	ENST00000543658	STPG4	Q8N801	248 aa		7.82	□□□□□ -1.16
DDB1-223	ENST00000543658	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		7.81	□□□□□ -1.16
DDB1-223	ENST00000543658		E9PLD3	99 aa		7.81	□□□□□ -1.16
DDB1-223	ENST00000543658	SFTA2	Q6UW10	78 aa		7.81	□□□□□ -1.16
DDB1-223	ENST00000543658	C2orf48	Q96LS8	159 aa		7.81	□□□□□ -1.16
DDB1-223	ENST00000543658	VAMP8	Q9BV40	100 aa		7.81	□□□□□ -1.16
DDB1-223	ENST00000543658		J3QQQ9	107 aa		7.8	□□□□□ -1.16
DDB1-223	ENST00000543658	NMU	P48645	174 aa		7.8	□□□□□ -1.16
DDB1-223	ENST00000543658	SYCN	Q0VAF6	134 aa		7.8	□□□□□ -1.16
DDB1-223	ENST00000543658	PYY3	Q5JQD4	70 aa		7.8	□□□□□ -1.16
DDB1-223	ENST00000543658	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	7.8	□□□□□ -1.16
DDB1-223	ENST00000543658	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		7.8	□□□□□ -1.16
DDB1-223	ENST00000543658	CARD19	Q96LW7	228 aa		7.8	□□□□□ -1.16

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