RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541990.5

THBS3-211, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS3, Length 2,928 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-211ENST00000541990 ID1P41134 155 aa6.59□□□□□ -1.36
THBS3-211ENST00000541990 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.59□□□□□ -1.36
THBS3-211ENST00000541990 LINC00467Q9BRT7 94 aa6.59□□□□□ -1.36
THBS3-211ENST00000541990 CHCHD7Q9BUK0 85 aa6.59□□□□□ -1.36
THBS3-211ENST00000541990 LINC00694P0DN24 101 aa6.58□□□□□ -1.36
THBS3-211ENST00000541990 HILS1P60008 231 aa6.58□□□□□ -1.36
THBS3-211ENST00000541990 COX6A2Q02221 97 aa6.58□□□□□ -1.36
THBS3-211ENST00000541990 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa6.58□□□□□ -1.36
THBS3-211ENST00000541990 NDUFA7O95182 113 aa6.58□□□□□ -1.36
THBS3-211ENST00000541990 TMEM101Q96IK0 257 aa6.58□□□□□ -1.36
THBS3-211ENST00000541990 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa6.58□□□□□ -1.36
THBS3-211ENST00000541990 C22orf24Q9Y442 160 aa6.58□□□□□ -1.36
THBS3-211ENST00000541990 NOTCH1P46531 2555 aa6.58□□□□□ -1.36
THBS3-211ENST00000541990 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa6.57□□□□□ -1.36
THBS3-211ENST00000541990 RS1O15537 224 aa6.57□□□□□ -1.36
THBS3-211ENST00000541990 UBE2E2Q96LR5 201 aa6.57□□□□□ -1.36
THBS3-211ENST00000541990 FAM218AQ96MZ4 157 aa6.57□□□□□ -1.36
THBS3-211ENST00000541990 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa6.56□□□□□ -1.36
THBS3-211ENST00000541990 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
THBS3-211ENST00000541990 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
THBS3-211ENST00000541990 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
THBS3-211ENST00000541990 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.56□□□□□ -1.36
THBS3-211ENST00000541990 DNAJC30Q96LL9 226 aa6.56□□□□□ -1.36
THBS3-211ENST00000541990 WFDC10AQ9H1F0 79 aa6.56□□□□□ -1.36
THBS3-211ENST00000541990 H3BUA1 57 aa6.56□□□□□ -1.36
THBS3-211ENST00000541990 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
THBS3-211ENST00000541990 C9orf153Q5TBE3 101 aa6.56□□□□□ -1.36
THBS3-211ENST00000541990 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.56□□□□□ -1.36
THBS3-211ENST00000541990 Q9H8V8 135 aa6.56□□□□□ -1.36
THBS3-211ENST00000541990 CCL24O00175 119 aa6.55□□□□□ -1.36
THBS3-211ENST00000541990 Q9HAA7 133 aa6.55□□□□□ -1.36
THBS3-211ENST00000541990 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
THBS3-211ENST00000541990 K7EQG2 157 aa6.54□□□□□ -1.36
THBS3-211ENST00000541990 BEAN1Q3B7T3 259 aa6.54□□□□□ -1.36
THBS3-211ENST00000541990 C5orf47Q569G3 176 aa6.54□□□□□ -1.36
THBS3-211ENST00000541990 COX7A2LO14548 114 aa6.54□□□□□ -1.36
THBS3-211ENST00000541990 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
THBS3-211ENST00000541990 NDUFA1O15239 70 aa6.53□□□□□ -1.36
THBS3-211ENST00000541990 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa6.53□□□□□ -1.36
THBS3-211ENST00000541990 C3orf22Q8N5N4 141 aa6.53□□□□□ -1.36
THBS3-211ENST00000541990 IMUPQ9GZP8 106 aa6.53□□□□□ -1.36
THBS3-211ENST00000541990 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa6.53□□□□□ -1.36
THBS3-211ENST00000541990 TIRAPP58753 221 aa6.53□□□□□ -1.36
THBS3-211ENST00000541990 HERVK_113P63121 156 aa6.53□□□□□ -1.36
THBS3-211ENST00000541990 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
THBS3-211ENST00000541990 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
THBS3-211ENST00000541990 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
THBS3-211ENST00000541990 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
THBS3-211ENST00000541990 BAALC-AS2P0C853 105 aa6.52□□□□□ -1.37
THBS3-211ENST00000541990 DEFB131AP59861 70 aa6.52□□□□□ -1.37
THBS3-211ENST00000541990 C4orf3Q8WVX3 66 aa6.52□□□□□ -1.37
THBS3-211ENST00000541990 K7EMT4 169 aa6.52□□□□□ -1.37
THBS3-211ENST00000541990 TIMM17BO60830 172 aa6.52□□□□□ -1.37
THBS3-211ENST00000541990 GAGE2AQ6NT46 116 aa6.52□□□□□ -1.37
THBS3-211ENST00000541990 LINC00643Q86TS7 51 aa6.52□□□□□ -1.37
THBS3-211ENST00000541990 TMEM86BQ8N661 226 aa6.52□□□□□ -1.37
THBS3-211ENST00000541990 DYNLRB2Q8TF09 96 aa6.51□□□□□ -1.37
THBS3-211ENST00000541990 LINC00242Q5T6M2 205 aa6.51□□□□□ -1.37
THBS3-211ENST00000541990 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa6.5□□□□□ -1.37
THBS3-211ENST00000541990 A0A1B0GX51 115 aa6.5□□□□□ -1.37
THBS3-211ENST00000541990 RNF152Q8N8N0 203 aa6.5□□□□□ -1.37
THBS3-211ENST00000541990 C2orf48Q96LS8 159 aa6.5□□□□□ -1.37
THBS3-211ENST00000541990 MGAM2Q2M2H8 2515 aa6.5□□□□□ -1.37
THBS3-211ENST00000541990 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa6.5□□□□□ -1.37
THBS3-211ENST00000541990 SMIM1B2RUZ4 78 aa6.5□□□□□ -1.37
THBS3-211ENST00000541990 SDIM1Q6ZPB5 146 aa6.5□□□□□ -1.37
THBS3-211ENST00000541990 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.49□□□□□ -1.37
THBS3-211ENST00000541990 UQCRQO14949 82 aa6.49□□□□□ -1.37
THBS3-211ENST00000541990 hADV29S1A0JD25 119 aa6.49□□□□□ -1.37
THBS3-211ENST00000541990 WIPF1O43516 503 aa6.49□□□□□ -1.37
THBS3-211ENST00000541990 ACYP1P07311 99 aa6.49□□□□□ -1.37
THBS3-211ENST00000541990 C5orf38Q86SI9 138 aa6.49□□□□□ -1.37
THBS3-211ENST00000541990 LINC00526Q96FQ7 95 aa6.49□□□□□ -1.37
THBS3-211ENST00000541990 EDA2RQ9HAV5 297 aa6.49□□□□□ -1.37
THBS3-211ENST00000541990 A0A087WVE0 104 aa6.49□□□□□ -1.37
THBS3-211ENST00000541990 ATP5G1P05496 136 aa6.49□□□□□ -1.37
THBS3-211ENST00000541990 DEFB114Q30KQ6 69 aa6.49□□□□□ -1.37
THBS3-211ENST00000541990 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa6.49□□□□□ -1.37
THBS3-211ENST00000541990 PRIMA1Q86XR5 153 aa6.49□□□□□ -1.37
THBS3-211ENST00000541990 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa6.48□□□□□ -1.37
THBS3-211ENST00000541990 SMIM9A6NGZ8 99 aa6.48□□□□□ -1.37
THBS3-211ENST00000541990 J3KT08 172 aa6.48□□□□□ -1.37
THBS3-211ENST00000541990 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
THBS3-211ENST00000541990 A0A087WYN8 130 aa6.48□□□□□ -1.37
THBS3-211ENST00000541990 PF4P02776 101 aa6.47□□□□□ -1.37
THBS3-211ENST00000541990 LINC00337Q8N6G1 96 aa6.47□□□□□ -1.37
THBS3-211ENST00000541990 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa6.47□□□□□ -1.37
THBS3-211ENST00000541990 C14orf132Q9NPU4 83 aa6.47□□□□□ -1.37
THBS3-211ENST00000541990 PEMTQ9UBM1 199 aa6.47□□□□□ -1.37
THBS3-211ENST00000541990 TMEM89A2RUT3 159 aa6.47□□□□□ -1.37
THBS3-211ENST00000541990 TRACP01848 142 aa6.47□□□□□ -1.37
THBS3-211ENST00000541990 COX7CP15954 63 aa6.47□□□□□ -1.37
THBS3-211ENST00000541990 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
THBS3-211ENST00000541990 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa6.47□□□□□ -1.37
THBS3-211ENST00000541990 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
THBS3-211ENST00000541990 C16orf95Q9H693 158 aa6.47□□□□□ -1.37
THBS3-211ENST00000541990 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa6.47□□□□□ -1.37
THBS3-211ENST00000541990 C11orf72Q8NBR9 251 aa6.46□□□□□ -1.37
THBS3-211ENST00000541990 ANK2Q01484 3957 aa6.46□□□□□ -1.37
THBS3-211ENST00000541990 IGHV3-53P01767 116 aa6.46□□□□□ -1.38
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