RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 NDUFA12Q9UI09 145 aa7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-211ENST00000520276 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa7.35□□□□□ -1.23
TRPS1-211ENST00000520276 SPANXDQ9BXN6 97 aa7.35□□□□□ -1.23
TRPS1-211ENST00000520276 SPANXCQ9NY87 97 aa7.35□□□□□ -1.23
TRPS1-211ENST00000520276 TRAV21A0A0B4J279 112 aa7.35□□□□□ -1.23
TRPS1-211ENST00000520276 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa7.35□□□□□ -1.23
TRPS1-211ENST00000520276 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
TRPS1-211ENST00000520276 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-211ENST00000520276 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-211ENST00000520276 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
TRPS1-211ENST00000520276 A0A0U1RRA0 63 aa7.33□□□□□ -1.24
TRPS1-211ENST00000520276 BAALC-AS2P0C853 105 aa7.33□□□□□ -1.24
TRPS1-211ENST00000520276 TRBV12-3P01733 135 aa7.33□□□□□ -1.24
TRPS1-211ENST00000520276 BEAN1Q3B7T3 259 aa7.33□□□□□ -1.24
TRPS1-211ENST00000520276 C18orf65Q6ZTR6 163 aa7.33□□□□□ -1.24
TRPS1-211ENST00000520276 SPATA3Q8NHX4 192 aa7.33□□□□□ -1.24
TRPS1-211ENST00000520276 FAM218AQ96MZ4 157 aa7.33□□□□□ -1.24
TRPS1-211ENST00000520276 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
TRPS1-211ENST00000520276 MDFIQ99750 246 aa7.32□□□□□ -1.24
TRPS1-211ENST00000520276 ZANQ9Y493 2812 aa7.32□□□□□ -1.24
TRPS1-211ENST00000520276 PDZD2O15018 2839 aa7.32□□□□□ -1.24
TRPS1-211ENST00000520276 FHL2Q14192 279 aa7.32□□□□□ -1.24
TRPS1-211ENST00000520276 LINC00336Q6ZUF6 198 aa7.32□□□□□ -1.24
TRPS1-211ENST00000520276 SERP2Q8N6R1 65 aa7.32□□□□□ -1.24
TRPS1-211ENST00000520276 FAM104AQ969W3 186 aa7.32□□□□□ -1.24
TRPS1-211ENST00000520276 CCDC140Q96MF4 163 aa7.32□□□□□ -1.24
TRPS1-211ENST00000520276 CUBNO60494 3623 aa7.32□□□□□ -1.24
TRPS1-211ENST00000520276 MRAPQ8TCY5 172 aa7.32□□□□□ -1.24
TRPS1-211ENST00000520276 Q9HAA7 133 aa7.32□□□□□ -1.24
TRPS1-211ENST00000520276 SORL1Q92673 2214 aa7.32□□□□□ -1.24
TRPS1-211ENST00000520276 STAB1Q9NY15 2570 aa7.31□□□□□ -1.24
TRPS1-211ENST00000520276 COX7A2LO14548 114 aa7.31□□□□□ -1.24
TRPS1-211ENST00000520276 LINC01561Q8N1V8 128 aa7.31□□□□□ -1.24
TRPS1-211ENST00000520276 C20orf203Q8NBC4 194 aa7.31□□□□□ -1.24
TRPS1-211ENST00000520276 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
TRPS1-211ENST00000520276 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa7.31□□□□□ -1.24
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-211ENST00000520276 VSIG2Q96IQ7 327 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-211ENST00000520276 USP17L23D6RBM5 183 aa7.29□□□□□ -1.24
TRPS1-211ENST00000520276 K7EMT4 169 aa7.29□□□□□ -1.24
TRPS1-211ENST00000520276 M0QY20 66 aa7.29□□□□□ -1.24
TRPS1-211ENST00000520276 STHQ8IWL8 128 aa7.29□□□□□ -1.24
TRPS1-211ENST00000520276 C1orf43Q9BWL3 253 aa7.29□□□□□ -1.24
TRPS1-211ENST00000520276 PKIGQ9Y2B9 76 aa7.29□□□□□ -1.24
TRPS1-211ENST00000520276 PFN2P35080 140 aa7.29□□□□□ -1.24
TRPS1-211ENST00000520276 LENEPQ9Y5L5 61 aa7.29□□□□□ -1.24
TRPS1-211ENST00000520276 MED14OSP0DP75 135 aa7.28□□□□□ -1.24
TRPS1-211ENST00000520276 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
TRPS1-211ENST00000520276 LINC00846Q9NV44 126 aa7.28□□□□□ -1.24
TRPS1-211ENST00000520276 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa7.28□□□□□ -1.24
TRPS1-211ENST00000520276 IGKV3-20P01619 116 aa7.28□□□□□ -1.24
TRPS1-211ENST00000520276 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
TRPS1-211ENST00000520276 CFHR3Q02985 330 aa7.28□□□□□ -1.24
TRPS1-211ENST00000520276 OXLD1Q5BKU9 147 aa7.28□□□□□ -1.24
TRPS1-211ENST00000520276 C14orf132Q9NPU4 83 aa7.28□□□□□ -1.24
TRPS1-211ENST00000520276 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa7.27□□□□□ -1.24
TRPS1-211ENST00000520276 MALP21145 153 aa7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-211ENST00000520276 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-211ENST00000520276 LINC00308Q8TCZ7 52 aa7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-211ENST00000520276 DEFB131AP59861 70 aa7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-211ENST00000520276 PRO0628Q9UI54 55 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-211ENST00000520276 U3KQE9 123 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-211ENST00000520276 KLK9Q9UKQ9 250 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-211ENST00000520276 CSMD2Q7Z408 3487 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-211ENST00000520276 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-211ENST00000520276 DNAL4O96015 105 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-211ENST00000520276 INAFM2P0DMQ5 153 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-211ENST00000520276 LINC00482Q8N8I6 264 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-211ENST00000520276 WFDC9Q8NEX5 89 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-211ENST00000520276 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-211ENST00000520276 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-211ENST00000520276 Q9UF83 564 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-211ENST00000520276 HTN1P15515 57 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-211ENST00000520276 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-211ENST00000520276 SOCS3O14543 225 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-211ENST00000520276 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa7.23□□□□□ -1.25
TRPS1-211ENST00000520276 DEFB114Q30KQ6 69 aa7.23□□□□□ -1.25
TRPS1-211ENST00000520276 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP7.23□□□□□ -1.25
TRPS1-211ENST00000520276 C19orf54Q5BKX5 351 aa7.23□□□□□ -1.25
TRPS1-211ENST00000520276 APRG1Q8IVJ8 170 aa7.23□□□□□ -1.25
TRPS1-211ENST00000520276 OTOGQ6ZRI0 2925 aa7.23□□□□□ -1.25
TRPS1-211ENST00000520276 FAM222AQ5U5X8 452 aa7.23□□□□□ -1.25
TRPS1-211ENST00000520276 Q6JHZ5 121 aa7.22□□□□□ -1.25
TRPS1-211ENST00000520276 Q9H8V8 135 aa7.22□□□□□ -1.25
TRPS1-211ENST00000520276 VPS13CQ709C8 3753 aa7.22□□□□□ -1.25
TRPS1-211ENST00000520276 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa7.22□□□□□ -1.25
TRPS1-211ENST00000520276 F8WDY8 70 aa7.22□□□□□ -1.25
TRPS1-211ENST00000520276 EDN2P20800 178 aa7.22□□□□□ -1.25
TRPS1-211ENST00000520276 KRTAP10-3P60369 221 aa7.22□□□□□ -1.25
TRPS1-211ENST00000520276 C20orf197Q8N268 126 aa7.22□□□□□ -1.25
TRPS1-211ENST00000520276 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa7.22□□□□□ -1.25
TRPS1-211ENST00000520276 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa7.22□□□□□ -1.25
TRPS1-211ENST00000520276 RPL28P46779 137 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
TRPS1-211ENST00000520276 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa7.22□□□□□ -1.25
TRPS1-211ENST00000520276 TIMM17BO60830 172 aa7.22□□□□□ -1.25
TRPS1-211ENST00000520276 APOC4P55056 127 aa7.22□□□□□ -1.25
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM243Q9BU79 118 aa7.22□□□□□ -1.25
TRPS1-211ENST00000520276 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.25
TRPS1-211ENST00000520276 A0A087WYN8 130 aa7.21□□□□□ -1.25
TRPS1-211ENST00000520276 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.25
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