RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519494.1

TGS1-202, Transcript of trimethylguanosine synthase 1, humanhuman

TSL 2

Gene TGS1, Length 550 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGS1-202ENST00000519494 LINC00474Q9P2X8 69 aa-0.41□□□□□ -2.48
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TGS1-202ENST00000519494 CUL7Q14999 1698 aa-0.41□□□□□ -2.48
TGS1-202ENST00000519494 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP-0.41□□□□□ -2.48
TGS1-202ENST00000519494 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP-0.41□□□□□ -2.48
TGS1-202ENST00000519494 TGP01266 2768 aa-0.41□□□□□ -2.48
TGS1-202ENST00000519494 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa-0.42□□□□□ -2.48
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TGS1-202ENST00000519494 BTG2P78543 158 aa-0.42□□□□□ -2.48
TGS1-202ENST00000519494 NAA60Q9H7X0 242 aa-0.42□□□□□ -2.48
TGS1-202ENST00000519494 NSD3Q9BZ95 1437 aa-0.42□□□□□ -2.48
TGS1-202ENST00000519494 DNAJC13O75165 2243 aa-0.42□□□□□ -2.48
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TGS1-202ENST00000519494 FAM25CB3EWG5 89 aa-0.43□□□□□ -2.48
TGS1-202ENST00000519494 FAM25GB3EWG6 89 aa-0.43□□□□□ -2.48
TGS1-202ENST00000519494 CATR1Q13166 79 aa-0.43□□□□□ -2.48
TGS1-202ENST00000519494 PIGYQ3MUY2 71 aa-0.43□□□□□ -2.48
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TGS1-202ENST00000519494 WDR7Q9Y4E6 1490 aa-0.43□□□□□ -2.48
TGS1-202ENST00000519494 TULP4Q9NRJ4 1543 aa-0.43□□□□□ -2.48
TGS1-202ENST00000519494 NALCNQ8IZF0 1738 aa-0.44□□□□□ -2.48
TGS1-202ENST00000519494 FMN2Q9NZ56 1722 aa-0.44□□□□□ -2.48
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TGS1-202ENST00000519494 K7EP13 123 aa-0.44□□□□□ -2.48
TGS1-202ENST00000519494 SFT2D2O95562 160 aa-0.44□□□□□ -2.48
TGS1-202ENST00000519494 TNFP01375 233 aa-0.44□□□□□ -2.48
TGS1-202ENST00000519494 COX6B1P14854 86 aa-0.44□□□□□ -2.48
TGS1-202ENST00000519494 TPPP2P59282 170 aa-0.44□□□□□ -2.48
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TGS1-202ENST00000519494 PPP3R2Q96LZ3 170 aa-0.44□□□□□ -2.48
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TGS1-202ENST00000519494 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP-0.44□□□□□ -2.48
TGS1-202ENST00000519494 HMGXB3Q12766 1538 aa-0.44□□□□□ -2.48
TGS1-202ENST00000519494 NUP188Q5SRE5 1749 aa-0.44□□□□□ -2.48
TGS1-202ENST00000519494 ANKRD36A6QL64 1941 aa-0.44□□□□□ -2.48
TGS1-202ENST00000519494 SHANK2Q9UPX8 1470 aa-0.45□□□□□ -2.48
TGS1-202ENST00000519494 APOC3P02656 99 aa-0.45□□□□□ -2.48
TGS1-202ENST00000519494 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP-0.45□□□□□ -2.48
TGS1-202ENST00000519494 COMMD6Q7Z4G1 85 aa-0.45□□□□□ -2.48
TGS1-202ENST00000519494 C5orf38Q86SI9 138 aa-0.45□□□□□ -2.48
TGS1-202ENST00000519494 MYOZ3Q8TDC0 251 aa-0.45□□□□□ -2.48
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TGS1-202ENST00000519494 A2ML1A8K2U0 1454 aa-0.46□□□□□ -2.48
TGS1-202ENST00000519494 GAPVD1Q14C86 1478 aa-0.46□□□□□ -2.48
TGS1-202ENST00000519494 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP-0.46□□□□□ -2.48
TGS1-202ENST00000519494 DNHD1Q96M86 4753 aa-0.46□□□□□ -2.48
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TGS1-202ENST00000519494 FGF7P21781 194 aa-0.46□□□□□ -2.48
TGS1-202ENST00000519494 C10orf113Q5VZT2 155 aa-0.46□□□□□ -2.48
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TGS1-202ENST00000519494 FAM107BQ9H098 131 aa-0.46□□□□□ -2.48
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TGS1-202ENST00000519494 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP-0.46□□□□□ -2.48
TGS1-202ENST00000519494 ABCA13Q86UQ4 5058 aa-0.46□□□□□ -2.48
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TGS1-202ENST00000519494 REV3LO60673 3130 aa-0.47□□□□□ -2.48
TGS1-202ENST00000519494 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa-0.47□□□□□ -2.48
TGS1-202ENST00000519494 S100A12P80511 92 aa-0.47□□□□□ -2.48
TGS1-202ENST00000519494 KLK9Q2XQG4 91 aa-0.47□□□□□ -2.48
TGS1-202ENST00000519494 PP6455Q8WZ26 134 aa-0.47□□□□□ -2.48
TGS1-202ENST00000519494 KIAA0556O60303 1618 aa-0.47□□□□□ -2.48
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TGS1-202ENST00000519494 FAM223AQ8IWN6 122 aa-0.48□□□□□ -2.49
TGS1-202ENST00000519494 LCN9Q8WX39 176 aa-0.48□□□□□ -2.49
TGS1-202ENST00000519494 DPH3P1Q9H4G8 78 aa-0.48□□□□□ -2.49
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TGS1-202ENST00000519494 CHD1O14646 1710 aa-0.48□□□□□ -2.49
TGS1-202ENST00000519494 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP-0.48□□□□□ -2.49
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TGS1-202ENST00000519494 MUC17Q685J3 4493 aa-0.48□□□□□ -2.49
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TGS1-202ENST00000519494 SONP18583 2426 aaKnown RBP-0.48□□□□□ -2.49
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TGS1-202ENST00000519494 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa-0.49□□□□□ -2.49
TGS1-202ENST00000519494 COL4A6Q14031 1691 aa-0.49□□□□□ -2.49
TGS1-202ENST00000519494 AKAIN1P0CW23 69 aa-0.49□□□□□ -2.49
TGS1-202ENST00000519494 LINC01600Q96MT4 127 aa-0.49□□□□□ -2.49
TGS1-202ENST00000519494 TSC22D3Q99576 134 aa-0.49□□□□□ -2.49
TGS1-202ENST00000519494 FXYD6Q9H0Q3 95 aa-0.49□□□□□ -2.49
TGS1-202ENST00000519494 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa-0.49□□□□□ -2.49
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