RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517316.1

IGHVII-40-1-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable (II)-40-1 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHVII-40-1, Length 58 nt, Biotype IG V pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SSSCA1O60232 199 aa-2.43□□□□□ -2.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TNFSF15O95150 251 aa-2.43□□□□□ -2.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DEFB1P60022 68 aa-2.43□□□□□ -2.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 WFDC13Q8IUB5 93 aa-2.43□□□□□ -2.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TTC9CQ8N5M4 171 aa-2.43□□□□□ -2.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP-2.43□□□□□ -2.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ALX1Q15699 326 aa-2.44□□□□□ -2.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM35BQ8NCS4 154 aa-2.44□□□□□ -2.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SAR1AQ9NR31 198 aa-2.44□□□□□ -2.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HIGD1AQ9Y241 93 aa-2.44□□□□□ -2.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa-2.44□□□□□ -2.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa-2.44□□□□□ -2.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ACACBO00763 2458 aa-2.45□□□□□ -2.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa-2.45□□□□□ -2.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM2Q9UHN6 1383 aa-2.45□□□□□ -2.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ITPR1Q14643 2758 aa-2.45□□□□□ -2.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa-2.45□□□□□ -2.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PFDN1O60925 122 aa-2.45□□□□□ -2.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SCTP09683 121 aa-2.45□□□□□ -2.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RPS28P62857 69 aaKnown RBP-2.45□□□□□ -2.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM128Q5BJH2 165 aa-2.45□□□□□ -2.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 Q6ZUT4 128 aa-2.45□□□□□ -2.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GID8Q9NWU2 228 aa-2.45□□□□□ -2.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CSMD1Q96PZ7 3565 aa-2.45□□□□□ -2.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP-2.45□□□□□ -2.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 COL6A5A8TX70 2615 aa-2.46□□□□□ -2.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM238C9JI98 176 aa-2.46□□□□□ -2.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 E2F6O75461 281 aa-2.46□□□□□ -2.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SNCGO76070 127 aa-2.46□□□□□ -2.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NDUFB6O95139 128 aa-2.46□□□□□ -2.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SFT2D2O95562 160 aa-2.46□□□□□ -2.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TCTE3Q8IZS6 198 aa-2.46□□□□□ -2.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FDCSPQ8NFU4 85 aa-2.46□□□□□ -2.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SPTSSAQ969W0 71 aa-2.46□□□□□ -2.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AQP10Q96PS8 301 aa-2.46□□□□□ -2.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP-2.46□□□□□ -2.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DNAH17Q9UFH2 4485 aa-2.47□□□□□ -2.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa-2.47□□□□□ -2.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HMGN4O00479 90 aa-2.47□□□□□ -2.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TOMM20LQ6UXN7 152 aa-2.47□□□□□ -2.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP-2.47□□□□□ -2.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ATPIF1Q9UII2 106 aa-2.47□□□□□ -2.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP-2.47□□□□□ -2.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MYH8P13535 1937 aa-2.47□□□□□ -2.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa-2.47□□□□□ -2.81
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NWD2Q9ULI1 1742 aa-2.48□□□□□ -2.81
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CEP290O15078 2479 aa-2.48□□□□□ -2.81
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa-2.48□□□□□ -2.81
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 I3L3M4 83 aa-2.48□□□□□ -2.81
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IGLC1P0CG04 106 aa-2.48□□□□□ -2.81
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CMPK1P30085 196 aa-2.48□□□□□ -2.81
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NCS1P62166 190 aa-2.48□□□□□ -2.81
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SAMD13Q5VXD3 122 aa-2.48□□□□□ -2.81
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRIQKQ629K1 86 aa-2.48□□□□□ -2.81
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HEPN1Q6WQI6 88 aa-2.48□□□□□ -2.81
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TSLPQ969D9 159 aa-2.48□□□□□ -2.81
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa-2.48□□□□□ -2.81
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CEP295Q9C0D2 2601 aa-2.49□□□□□ -2.81
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PATJQ8NI35 1801 aa-2.49□□□□□ -2.81
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa-2.49□□□□□ -2.81
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 A0A1B0GX51 115 aa-2.49□□□□□ -2.81
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MGPP08493 103 aa-2.49□□□□□ -2.81
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 UBA52P62987 128 aaKnown RBP-2.49□□□□□ -2.81
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SCIMPQ6UWF3 145 aa-2.49□□□□□ -2.81
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP-2.49□□□□□ -2.81
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SELENOSQ9BQE4 189 aa-2.49□□□□□ -2.81
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PCBD2Q9H0N5 130 aa-2.49□□□□□ -2.81
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DYNLRB1Q9NP97 96 aa-2.49□□□□□ -2.81
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 S4R3F8 94 aa-2.49□□□□□ -2.81
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MYH13Q9UKX3 1938 aa-2.5□□□□□ -2.81
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 K7EP34 96 aa-2.5□□□□□ -2.81
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IGLC6P0CF74 106 aa-2.5□□□□□ -2.81
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BTG2P78543 158 aa-2.5□□□□□ -2.81
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP-2.5□□□□□ -2.81
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ARAP2Q8WZ64 1704 aa-2.51□□□□□ -2.81
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa-2.51□□□□□ -2.81
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BTAF1O14981 1849 aa-2.51□□□□□ -2.81
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP-2.51□□□□□ -2.81
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CTAGE3PQ8IX95 158 aa-2.51□□□□□ -2.81
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MGST2Q99735 147 aa-2.51□□□□□ -2.81
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP-2.51□□□□□ -2.81
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa-2.51□□□□□ -2.81
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EYSQ5T1H1 3165 aa-2.51□□□□□ -2.81
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DNAH5Q8TE73 4624 aa-2.51□□□□□ -2.81
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C1orf167Q5SNV9 1468 aa-2.52□□□□□ -2.81
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MT1HL1P0DM35 61 aa-2.52□□□□□ -2.81
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 S100A5P33763 92 aa-2.52□□□□□ -2.81
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP-2.52□□□□□ -2.81
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa-2.52□□□□□ -2.81
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa-2.52□□□□□ -2.81
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MAP3K1Q13233 1512 aa-2.52□□□□□ -2.81
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP-2.53□□□□□ -2.81
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa-2.53□□□□□ -2.81
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LINC00694P0DN24 101 aa-2.53□□□□□ -2.81
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 G0S2P27469 103 aa-2.53□□□□□ -2.81
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 B2MP61769 119 aa-2.53□□□□□ -2.81
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AKAP14Q86UN6 197 aa-2.53□□□□□ -2.81
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TAC4Q86UU9 113 aa-2.53□□□□□ -2.81
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ROCK1Q13464 1354 aa-2.53□□□□□ -2.81
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DEFB110Q30KQ9 67 aa-2.54□□□□□ -2.82
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