RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513069.1

SH3BP2-225, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 866 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-225ENST00000513069 IFITM10A6NMD0 228 aa9.72□□□□□ -0.85
SH3BP2-225ENST00000513069 TMEM141Q96I45 108 aa9.72□□□□□ -0.85
SH3BP2-225ENST00000513069 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
SH3BP2-225ENST00000513069 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa9.71□□□□□ -0.86
SH3BP2-225ENST00000513069 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
SH3BP2-225ENST00000513069 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
SH3BP2-225ENST00000513069 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa9.71□□□□□ -0.86
SH3BP2-225ENST00000513069 AMELXQ99217 191 aa9.71□□□□□ -0.86
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SH3BP2-225ENST00000513069 LINC00242Q5T6M2 205 aa9.7□□□□□ -0.86
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SH3BP2-225ENST00000513069 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
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SH3BP2-225ENST00000513069 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa9.65□□□□□ -0.86
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SH3BP2-225ENST00000513069 OR10D4PQ8NGN7 298 aa9.64□□□□□ -0.87
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SH3BP2-225ENST00000513069 A0A087WYN8 130 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP2-225ENST00000513069 A0A096LNI7 61 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP2-225ENST00000513069 LINC00614P0C842 121 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP2-225ENST00000513069 SPAG11BQ08648 103 aa9.63□□□□□ -0.87
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SH3BP2-225ENST00000513069 INAFM2P0DMQ5 153 aa9.62□□□□□ -0.87
SH3BP2-225ENST00000513069 CAMK2N2Q96S95 79 aa9.62□□□□□ -0.87
SH3BP2-225ENST00000513069 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa9.61□□□□□ -0.87
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SH3BP2-225ENST00000513069 C10orf25Q5T742 122 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP2-225ENST00000513069 LINC01561Q8N1V8 128 aa9.61□□□□□ -0.87
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SH3BP2-225ENST00000513069 A0A0J9YXV3 536 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP2-225ENST00000513069 LINC01549A6NIU2 74 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP2-225ENST00000513069 MAJINQ3KP22 176 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP2-225ENST00000513069 DPH3Q96FX2 82 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP2-225ENST00000513069 CST9LQ9H4G1 147 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP2-225ENST00000513069 MYCBP2O75592 4640 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP2-225ENST00000513069 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SH3BP2-225ENST00000513069 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SH3BP2-225ENST00000513069 PMCHL1Q16048 86 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP2-225ENST00000513069 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP2-225ENST00000513069 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP2-225ENST00000513069 F8WDY8 70 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP2-225ENST00000513069 RNF151Q2KHN1 245 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP2-225ENST00000513069 PDZD11Q5EBL8 140 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP2-225ENST00000513069 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
SH3BP2-225ENST00000513069 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP2-225ENST00000513069 COLCA2A8K830 154 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP2-225ENST00000513069 PTTG1IPP53801 180 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP2-225ENST00000513069 HERVK_113P63121 156 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP2-225ENST00000513069 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-225ENST00000513069 TRGC2P03986 189 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-225ENST00000513069 SEC11AP67812 179 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-225ENST00000513069 PMVKQ15126 192 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-225ENST00000513069 C2orf82Q6UX34 121 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-225ENST00000513069 STPG4Q8N801 248 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-225ENST00000513069 C6orf48Q9UBA6 75 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-225ENST00000513069 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-225ENST00000513069 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-225ENST00000513069 NDUFA1O15239 70 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-225ENST00000513069 HBDP02042 147 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-225ENST00000513069 RAB5BP61020 215 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-225ENST00000513069 GAGE2BQ13066 116 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-225ENST00000513069 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-225ENST00000513069 LINC00474Q9P2X8 69 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-225ENST00000513069 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
SH3BP2-225ENST00000513069 PKIGQ9Y2B9 76 aa9.54□□□□□ -0.88
SH3BP2-225ENST00000513069 A0A1W2PNN7 141 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP2-225ENST00000513069 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
SH3BP2-225ENST00000513069 SMIM1B2RUZ4 78 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP2-225ENST00000513069 TLX1NBP0CAT3 122 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP2-225ENST00000513069 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
SH3BP2-225ENST00000513069 Q6ZRP5 223 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP2-225ENST00000513069 Q8IZM0 81 aa9.52□□□□□ -0.89
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