RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512194.1

HERC3-210, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 836 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-210ENST00000512194 HIST3H2BBQ8N257 126 aa5.03□□□□□ -1.6
HERC3-210ENST00000512194 FAM218AQ96MZ4 157 aa5.03□□□□□ -1.6
HERC3-210ENST00000512194 SCGB3A1Q96QR1 104 aa5.03□□□□□ -1.6
HERC3-210ENST00000512194 TMEM243Q9BU79 118 aa5.03□□□□□ -1.6
HERC3-210ENST00000512194 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa5.03□□□□□ -1.6
HERC3-210ENST00000512194 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa5.02□□□□□ -1.61
HERC3-210ENST00000512194 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa5.02□□□□□ -1.61
HERC3-210ENST00000512194 NUPR2A6NF83 97 aa5.02□□□□□ -1.61
HERC3-210ENST00000512194 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
HERC3-210ENST00000512194 FABP4P15090 132 aa5.02□□□□□ -1.61
HERC3-210ENST00000512194 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa5.02□□□□□ -1.61
HERC3-210ENST00000512194 Q6ZN92 141 aa5.02□□□□□ -1.61
HERC3-210ENST00000512194 FAM19A2Q8N3H0 131 aa5.02□□□□□ -1.61
HERC3-210ENST00000512194 TMEM141Q96I45 108 aa5.02□□□□□ -1.61
HERC3-210ENST00000512194 TMEM101Q96IK0 257 aa5.02□□□□□ -1.61
HERC3-210ENST00000512194 VSIG2Q96IQ7 327 aa5.02□□□□□ -1.61
HERC3-210ENST00000512194 PKHD1P08F94 4074 aa5.02□□□□□ -1.61
HERC3-210ENST00000512194 A0A096LPF7 62 aa5.01□□□□□ -1.61
HERC3-210ENST00000512194 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa5.01□□□□□ -1.61
HERC3-210ENST00000512194 C20orf202A1L168 122 aa5.01□□□□□ -1.61
HERC3-210ENST00000512194 IGLL5B9A064 214 aa5.01□□□□□ -1.61
HERC3-210ENST00000512194 TMEM262E9PQX1 116 aa5.01□□□□□ -1.61
HERC3-210ENST00000512194 NUPR1O60356 82 aa5.01□□□□□ -1.61
HERC3-210ENST00000512194 TCTAP57738 103 aa5.01□□□□□ -1.61
HERC3-210ENST00000512194 PMCHL1Q16048 86 aa5.01□□□□□ -1.61
HERC3-210ENST00000512194 C2orf66Q6UXQ4 117 aa5.01□□□□□ -1.61
HERC3-210ENST00000512194 ERASQ7Z444 233 aa5.01□□□□□ -1.61
HERC3-210ENST00000512194 C20orf203Q8NBC4 194 aa5.01□□□□□ -1.61
HERC3-210ENST00000512194 TOMM6Q96B49 74 aa5.01□□□□□ -1.61
HERC3-210ENST00000512194 HIST1H2BLQ99880 126 aa5.01□□□□□ -1.61
HERC3-210ENST00000512194 CHCHD5Q9BSY4 110 aa5.01□□□□□ -1.61
HERC3-210ENST00000512194 LINC00694P0DN24 101 aa5□□□□□ -1.61
HERC3-210ENST00000512194 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
HERC3-210ENST00000512194 MT3P25713 68 aa5□□□□□ -1.61
HERC3-210ENST00000512194 CCL18P55774 89 aa5□□□□□ -1.61
HERC3-210ENST00000512194 LELP1Q5T871 98 aa5□□□□□ -1.61
HERC3-210ENST00000512194 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
HERC3-210ENST00000512194 Q6ZRP5 223 aa5□□□□□ -1.61
HERC3-210ENST00000512194 OR10D4PQ8NGN7 298 aa5□□□□□ -1.61
HERC3-210ENST00000512194 IFI27L1Q96BM0 104 aa5□□□□□ -1.61
HERC3-210ENST00000512194 TIMM17AQ99595 171 aa5□□□□□ -1.61
HERC3-210ENST00000512194 TIMM21Q9BVV7 248 aa5□□□□□ -1.61
HERC3-210ENST00000512194 SPANXA1Q9NS26 97 aa5□□□□□ -1.61
HERC3-210ENST00000512194 Q9UF83 564 aa5□□□□□ -1.61
HERC3-210ENST00000512194 FAT2Q9NYQ8 4349 aa5□□□□□ -1.61
HERC3-210ENST00000512194 A0A087WX48 190 aa4.99□□□□□ -1.61
HERC3-210ENST00000512194 KRTDAPP60985 99 aa4.99□□□□□ -1.61
HERC3-210ENST00000512194 Q6ZVQ6 151 aa4.99□□□□□ -1.61
HERC3-210ENST00000512194 OR5A1Q8NGJ0 315 aa4.99□□□□□ -1.61
HERC3-210ENST00000512194 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa4.99□□□□□ -1.61
HERC3-210ENST00000512194 C2orf88Q9BSF0 95 aa4.99□□□□□ -1.61
HERC3-210ENST00000512194 CHCHD7Q9BUK0 85 aa4.99□□□□□ -1.61
HERC3-210ENST00000512194 VCX2Q9H322 139 aa4.99□□□□□ -1.61
HERC3-210ENST00000512194 DNAH2Q9P225 4427 aa4.98□□□□□ -1.61
HERC3-210ENST00000512194 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
HERC3-210ENST00000512194 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
HERC3-210ENST00000512194 FGF6P10767 208 aa4.98□□□□□ -1.61
HERC3-210ENST00000512194 RPL39P62891 51 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
HERC3-210ENST00000512194 LYPD5Q6UWN5 251 aa4.98□□□□□ -1.61
HERC3-210ENST00000512194 TEX43Q6ZNM6 134 aa4.98□□□□□ -1.61
HERC3-210ENST00000512194 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa4.98□□□□□ -1.61
HERC3-210ENST00000512194 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
HERC3-210ENST00000512194 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa4.98□□□□□ -1.61
HERC3-210ENST00000512194 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
HERC3-210ENST00000512194 DNAH11Q96DT5 4516 aa4.98□□□□□ -1.61
HERC3-210ENST00000512194 IGIPA6NJ69 53 aa4.97□□□□□ -1.61
HERC3-210ENST00000512194 H0Y8G0 127 aa4.97□□□□□ -1.61
HERC3-210ENST00000512194 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa4.97□□□□□ -1.61
HERC3-210ENST00000512194 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
HERC3-210ENST00000512194 PMVKQ15126 192 aa4.97□□□□□ -1.61
HERC3-210ENST00000512194 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa4.97□□□□□ -1.61
HERC3-210ENST00000512194 DNAH17Q9UFH2 4485 aa4.97□□□□□ -1.61
HERC3-210ENST00000512194 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa4.96□□□□□ -1.62
HERC3-210ENST00000512194 A0A096LNJ9 63 aa4.96□□□□□ -1.62
HERC3-210ENST00000512194 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa4.96□□□□□ -1.62
HERC3-210ENST00000512194 C3orf79P0CE67 100 aa4.96□□□□□ -1.62
HERC3-210ENST00000512194 SEC11AP67812 179 aa4.96□□□□□ -1.62
HERC3-210ENST00000512194 SPATA12Q7Z6I5 190 aa4.96□□□□□ -1.62
HERC3-210ENST00000512194 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa4.96□□□□□ -1.62
HERC3-210ENST00000512194 ZNF664Q8N3J9 261 aa4.96□□□□□ -1.62
HERC3-210ENST00000512194 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
HERC3-210ENST00000512194 HSPG2P98160 4391 aa4.95□□□□□ -1.62
HERC3-210ENST00000512194 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa4.95□□□□□ -1.62
HERC3-210ENST00000512194 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa4.95□□□□□ -1.62
HERC3-210ENST00000512194 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa4.95□□□□□ -1.62
HERC3-210ENST00000512194 HSBP1L1C9JCN9 74 aa4.95□□□□□ -1.62
HERC3-210ENST00000512194 CCL25O15444 150 aa4.95□□□□□ -1.62
HERC3-210ENST00000512194 PLNP26678 52 aa4.95□□□□□ -1.62
HERC3-210ENST00000512194 S100A12P80511 92 aa4.95□□□□□ -1.62
HERC3-210ENST00000512194 ESRGQ1W209 222 aa4.95□□□□□ -1.62
HERC3-210ENST00000512194 LGALS9CQ6DKI2 356 aa4.95□□□□□ -1.62
HERC3-210ENST00000512194 BAALCQ8WXS3 180 aa4.95□□□□□ -1.62
HERC3-210ENST00000512194 CST9LQ9H4G1 147 aa4.95□□□□□ -1.62
HERC3-210ENST00000512194 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
HERC3-210ENST00000512194 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
HERC3-210ENST00000512194 HERC1Q15751 4861 aa4.94□□□□□ -1.62
HERC3-210ENST00000512194 NACAE9PAV3 2078 aa4.94□□□□□ -1.62
HERC3-210ENST00000512194 K7EP13 123 aa4.94□□□□□ -1.62
HERC3-210ENST00000512194 DPM2O94777 84 aa4.94□□□□□ -1.62
HERC3-210ENST00000512194 CRPP02741 224 aa4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms