RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510829.6

RABGEF1-208, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-208ENST00000510829 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-208ENST00000510829 SH2D6Q7Z4S9 175 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-208ENST00000510829 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-208ENST00000510829 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-208ENST00000510829 SMIM9A6NGZ8 99 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-208ENST00000510829 PAX4O43316 350 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-208ENST00000510829 DAD1P61803 113 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-208ENST00000510829 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-208ENST00000510829 J3QR89 54 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-208ENST00000510829 X6R8D5 127 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-208ENST00000510829 SBSPONQ8IVN8 264 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-208ENST00000510829 PRO0255Q9UI72 69 aa7.79□□□□□ -1.16
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RABGEF1-208ENST00000510829 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
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RABGEF1-208ENST00000510829 IGHV3-33P01772 117 aa7.77□□□□□ -1.16
RABGEF1-208ENST00000510829 SMIM1B2RUZ4 78 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-208ENST00000510829 NDUFA1O15239 70 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-208ENST00000510829 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-208ENST00000510829 F5H768 121 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-208ENST00000510829 CLPSL2Q6UWE3 100 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-208ENST00000510829 C5orf38Q86SI9 138 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-208ENST00000510829 CITED1Q99966 193 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-208ENST00000510829 AKAP9Q99996 3911 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-208ENST00000510829 A0A0B4J2C4 111 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-208ENST00000510829 H7C423 109 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-208ENST00000510829 TCL1BO95988 128 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-208ENST00000510829 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-208ENST00000510829 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-208ENST00000510829 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-208ENST00000510829 SPANXDQ9BXN6 97 aa7.76□□□□□ -1.17
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RABGEF1-208ENST00000510829 LYRM9A8MSI8 78 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-208ENST00000510829 COX6CP09669 75 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-208ENST00000510829 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-208ENST00000510829 LITAFQ99732 161 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-208ENST00000510829 G3V4G9 280 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-208ENST00000510829 PCP4P48539 62 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-208ENST00000510829 IFITM1P13164 125 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-208ENST00000510829 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-208ENST00000510829 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-208ENST00000510829 TENM1Q9UKZ4 2725 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-208ENST00000510829 C9JAW5 83 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-208ENST00000510829 XCL1P47992 114 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-208ENST00000510829 ATP5G1P05496 136 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-208ENST00000510829 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-208ENST00000510829 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-208ENST00000510829 SS18Q15532 418 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-208ENST00000510829 COX7B2Q8TF08 81 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-208ENST00000510829 COPS9Q8WXC6 57 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-208ENST00000510829 TIMM17BO60830 172 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-208ENST00000510829 LINC00158P58513 81 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-208ENST00000510829 OXLD1Q5BKU9 147 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-208ENST00000510829 C3orf56Q8N813 242 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-208ENST00000510829 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGEF1-208ENST00000510829 SPART-AS1P0CW21 52 aa7.72□□□□□ -1.17
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RABGEF1-208ENST00000510829 HERV-K104P63124 156 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGEF1-208ENST00000510829 C6orf226Q5I0X4 101 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGEF1-208ENST00000510829 LINC00308Q8TCZ7 52 aa7.72□□□□□ -1.17
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RABGEF1-208ENST00000510829 LINC00612Q8N6U2 182 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGEF1-208ENST00000510829 PRO0461Q9UI25 63 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGEF1-208ENST00000510829 ICOSQ9Y6W8 199 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGEF1-208ENST00000510829 MIFP14174 115 aa7.71□□□□□ -1.18
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RABGEF1-208ENST00000510829 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa7.7□□□□□ -1.18
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RABGEF1-208ENST00000510829 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-208ENST00000510829 CELA1Q9UNI1 258 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-208ENST00000510829 WFDC9Q8NEX5 89 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-208ENST00000510829 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-208ENST00000510829 SLC25A20O43772 301 aa7.7□□□□□ -1.18
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RABGEF1-208ENST00000510829 LINC00269Q8N2A0 174 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-208ENST00000510829 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa7.69□□□□□ -1.18
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RABGEF1-208ENST00000510829 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa7.68□□□□□ -1.18
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RABGEF1-208ENST00000510829 LINC01620Q4KN68 170 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-208ENST00000510829 CLEC2BQ92478 149 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-208ENST00000510829 MALP21145 153 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-208ENST00000510829 Q8NAQ8 132 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-208ENST00000510829 FOXI1Q12951 378 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-208ENST00000510829 A0A087WZ39 114 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-208ENST00000510829 TEN1Q86WV5 123 aa7.66□□□□□ -1.18
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RABGEF1-208ENST00000510829 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-208ENST00000510829 PPDPFLQ8WWR9 84 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-208ENST00000510829 A0A1B0GUV1 79 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-208ENST00000510829 CFAP161Q6P656 301 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-208ENST00000510829 ANKRD29Q8N6D5 301 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-208ENST00000510829 RETNQ9HD89 108 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-208ENST00000510829 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-208ENST00000510829 CRPP02741 224 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-208ENST00000510829 C2orf82Q6UX34 121 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-208ENST00000510829 Q8N3U1 123 aa7.65□□□□□ -1.18
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