RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507771.5

ITGA3-210, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 3

Gene ITGA3, Length 399 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-210ENST00000507771 FABP4P15090 132 aa7.36□□□□□ -1.23
ITGA3-210ENST00000507771 LINC00310P59036 64 aa7.36□□□□□ -1.23
ITGA3-210ENST00000507771 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
ITGA3-210ENST00000507771 LINC00242Q5T6M2 205 aa7.36□□□□□ -1.23
ITGA3-210ENST00000507771 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa7.36□□□□□ -1.23
ITGA3-210ENST00000507771 LINC00173Q6ZV60 143 aa7.36□□□□□ -1.23
ITGA3-210ENST00000507771 Q8N814 137 aa7.36□□□□□ -1.23
ITGA3-210ENST00000507771 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa7.36□□□□□ -1.23
ITGA3-210ENST00000507771 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa7.35□□□□□ -1.23
ITGA3-210ENST00000507771 NUPR1O60356 82 aa7.35□□□□□ -1.23
ITGA3-210ENST00000507771 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa7.35□□□□□ -1.23
ITGA3-210ENST00000507771 C5orf38Q86SI9 138 aa7.35□□□□□ -1.23
ITGA3-210ENST00000507771 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
ITGA3-210ENST00000507771 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
ITGA3-210ENST00000507771 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa7.35□□□□□ -1.23
ITGA3-210ENST00000507771 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa7.35□□□□□ -1.23
ITGA3-210ENST00000507771 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa7.34□□□□□ -1.23
ITGA3-210ENST00000507771 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa7.34□□□□□ -1.23
ITGA3-210ENST00000507771 hDV102S1A0JD36 115 aa7.34□□□□□ -1.23
ITGA3-210ENST00000507771 H3BRM9 83 aa7.34□□□□□ -1.23
ITGA3-210ENST00000507771 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa7.34□□□□□ -1.23
ITGA3-210ENST00000507771 CDPF1Q6NVV7 123 aa7.34□□□□□ -1.23
ITGA3-210ENST00000507771 SPATA12Q7Z6I5 190 aa7.34□□□□□ -1.23
ITGA3-210ENST00000507771 LINC00469Q8N7U9 141 aa7.34□□□□□ -1.23
ITGA3-210ENST00000507771 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
ITGA3-210ENST00000507771 A0A087WZ39 114 aa7.33□□□□□ -1.24
ITGA3-210ENST00000507771 A0A0J9YXV3 536 aa7.33□□□□□ -1.24
ITGA3-210ENST00000507771 H0Y8G0 127 aa7.33□□□□□ -1.24
ITGA3-210ENST00000507771 S100A2P29034 98 aa7.33□□□□□ -1.24
ITGA3-210ENST00000507771 LINC01561Q8N1V8 128 aa7.33□□□□□ -1.24
ITGA3-210ENST00000507771 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
ITGA3-210ENST00000507771 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa7.32□□□□□ -1.24
ITGA3-210ENST00000507771 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
ITGA3-210ENST00000507771 WFDC2Q14508 124 aa7.32□□□□□ -1.24
ITGA3-210ENST00000507771 OR10D4PQ8NGN7 298 aa7.32□□□□□ -1.24
ITGA3-210ENST00000507771 CHAC1Q9BUX1 264 aa7.32□□□□□ -1.24
ITGA3-210ENST00000507771 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa7.32□□□□□ -1.24
ITGA3-210ENST00000507771 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
ITGA3-210ENST00000507771 A0A1B0GVY2 172 aa7.31□□□□□ -1.24
ITGA3-210ENST00000507771 F8VRH5 84 aa7.31□□□□□ -1.24
ITGA3-210ENST00000507771 PRSS2P07478 247 aa7.31□□□□□ -1.24
ITGA3-210ENST00000507771 IGLC3P0DOY3 106 aa7.31□□□□□ -1.24
ITGA3-210ENST00000507771 COX6A2Q02221 97 aa7.31□□□□□ -1.24
ITGA3-210ENST00000507771 HIGD2BQ4VC39 106 aa7.31□□□□□ -1.24
ITGA3-210ENST00000507771 C15orf56Q8N910 161 aa7.31□□□□□ -1.24
ITGA3-210ENST00000507771 ORAOV1Q8WV07 137 aa7.31□□□□□ -1.24
ITGA3-210ENST00000507771 PKD1P98161 4303 aa7.3□□□□□ -1.24
ITGA3-210ENST00000507771 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa7.3□□□□□ -1.24
ITGA3-210ENST00000507771 SPAG11BQ08648 103 aa7.3□□□□□ -1.24
ITGA3-210ENST00000507771 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa7.3□□□□□ -1.24
ITGA3-210ENST00000507771 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa7.29□□□□□ -1.24
ITGA3-210ENST00000507771 C16orf90A8MZG2 172 aa7.29□□□□□ -1.24
ITGA3-210ENST00000507771 F8WDY8 70 aa7.29□□□□□ -1.24
ITGA3-210ENST00000507771 PLNP26678 52 aa7.29□□□□□ -1.24
ITGA3-210ENST00000507771 TMEM170BQ5T4T1 132 aa7.29□□□□□ -1.24
ITGA3-210ENST00000507771 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
ITGA3-210ENST00000507771 PKIGQ9Y2B9 76 aa7.29□□□□□ -1.24
ITGA3-210ENST00000507771 DNAH11Q96DT5 4516 aa7.29□□□□□ -1.24
ITGA3-210ENST00000507771 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa7.28□□□□□ -1.24
ITGA3-210ENST00000507771 C20orf202A1L168 122 aa7.28□□□□□ -1.24
ITGA3-210ENST00000507771 KRTAP10-2P60368 255 aa7.28□□□□□ -1.24
ITGA3-210ENST00000507771 CNBPP62633 177 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
ITGA3-210ENST00000507771 ODF1Q14990 250 aa7.28□□□□□ -1.24
ITGA3-210ENST00000507771 PET117Q6UWS5 81 aa7.28□□□□□ -1.24
ITGA3-210ENST00000507771 C2orf48Q96LS8 159 aa7.28□□□□□ -1.24
ITGA3-210ENST00000507771 CAMK2N2Q96S95 79 aa7.28□□□□□ -1.24
ITGA3-210ENST00000507771 TOMM7Q9P0U1 55 aa7.28□□□□□ -1.24
ITGA3-210ENST00000507771 C11orf86A6NJI1 115 aa7.27□□□□□ -1.25
ITGA3-210ENST00000507771 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa7.27□□□□□ -1.25
ITGA3-210ENST00000507771 DPM2O94777 84 aa7.27□□□□□ -1.25
ITGA3-210ENST00000507771 GCSHP23434 173 aa7.27□□□□□ -1.25
ITGA3-210ENST00000507771 AKR1D1P51857 326 aa7.27□□□□□ -1.25
ITGA3-210ENST00000507771 KRTDAPP60985 99 aa7.27□□□□□ -1.25
ITGA3-210ENST00000507771 CKS1BP61024 79 aa7.27□□□□□ -1.25
ITGA3-210ENST00000507771 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
ITGA3-210ENST00000507771 C6orf226Q5I0X4 101 aa7.27□□□□□ -1.25
ITGA3-210ENST00000507771 HIST3H2BBQ8N257 126 aa7.27□□□□□ -1.25
ITGA3-210ENST00000507771 NDUFA1O15239 70 aa7.26□□□□□ -1.25
ITGA3-210ENST00000507771 IGKCP01834 107 aa7.26□□□□□ -1.25
ITGA3-210ENST00000507771 SPINK8P0C7L1 97 aa7.26□□□□□ -1.25
ITGA3-210ENST00000507771 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
ITGA3-210ENST00000507771 SYCNQ0VAF6 134 aa7.26□□□□□ -1.25
ITGA3-210ENST00000507771 Q8IZM0 81 aa7.26□□□□□ -1.25
ITGA3-210ENST00000507771 CARD19Q96LW7 228 aa7.26□□□□□ -1.25
ITGA3-210ENST00000507771 SMIM1B2RUZ4 78 aa7.25□□□□□ -1.25
ITGA3-210ENST00000507771 CXCL5P42830 114 aa7.25□□□□□ -1.25
ITGA3-210ENST00000507771 HERVK_113P61574 105 aa7.25□□□□□ -1.25
ITGA3-210ENST00000507771 COX7B2Q8TF08 81 aa7.25□□□□□ -1.25
ITGA3-210ENST00000507771 LINC00526Q96FQ7 95 aa7.25□□□□□ -1.25
ITGA3-210ENST00000507771 C5orf52A6NGY3 159 aa7.24□□□□□ -1.25
ITGA3-210ENST00000507771 C3orf79P0CE67 100 aa7.24□□□□□ -1.25
ITGA3-210ENST00000507771 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP7.24□□□□□ -1.25
ITGA3-210ENST00000507771 C9orf163Q8N9P6 203 aa7.24□□□□□ -1.25
ITGA3-210ENST00000507771 HIST1H2BLQ99880 126 aa7.24□□□□□ -1.25
ITGA3-210ENST00000507771 LINC01545Q5VT33 79 aa7.23□□□□□ -1.25
ITGA3-210ENST00000507771 SFTA2Q6UW10 78 aa7.23□□□□□ -1.25
ITGA3-210ENST00000507771 PMCHL2Q9BQD1 86 aa7.23□□□□□ -1.25
ITGA3-210ENST00000507771 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
ITGA3-210ENST00000507771 PKHD1P08F94 4074 aa7.22□□□□□ -1.25
ITGA3-210ENST00000507771 DNAH5Q8TE73 4624 aa7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.1 ms