RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497210.5

CTPS1-211, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 463 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-211ENST00000497210 FABP4P15090 132 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-211ENST00000497210 AKR1D1P51857 326 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF664Q8N3J9 261 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-211ENST00000497210 Q8N976 141 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-211ENST00000497210 VCX2Q9H322 139 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-211ENST00000497210 Q9H8V8 135 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-211ENST00000497210 LYSTQ99698 3801 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-211ENST00000497210 PRSS1P07477 247 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-211ENST00000497210 PMVKQ15126 192 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-211ENST00000497210 HIST1H2BLQ99880 126 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-211ENST00000497210 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa6.6□□□□□ -1.35
CTPS1-211ENST00000497210 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-211ENST00000497210 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-211ENST00000497210 CCL25O15444 150 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-211ENST00000497210 LY6G6CO95867 125 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-211ENST00000497210 SEC11AP67812 179 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-211ENST00000497210 MIAQ16674 131 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-211ENST00000497210 BAALCQ8WXS3 180 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-211ENST00000497210 RMI2Q96E14 147 aa6.59□□□□□ -1.35
CTPS1-211ENST00000497210 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-211ENST00000497210 H0Y8G0 127 aa6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-211ENST00000497210 KRTDAPP60985 99 aa6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-211ENST00000497210 REG3AQ06141 175 aa6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-211ENST00000497210 SS18Q15532 418 aa6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-211ENST00000497210 LINC00269Q8N2A0 174 aa6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-211ENST00000497210 AMELXQ99217 191 aa6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-211ENST00000497210 KLK12Q9UKR0 248 aa6.58□□□□□ -1.36
CTPS1-211ENST00000497210 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa6.57□□□□□ -1.36
CTPS1-211ENST00000497210 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa6.57□□□□□ -1.36
CTPS1-211ENST00000497210 PLNP26678 52 aa6.57□□□□□ -1.36
CTPS1-211ENST00000497210 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
CTPS1-211ENST00000497210 CLPSL2Q6UWE3 100 aa6.57□□□□□ -1.36
CTPS1-211ENST00000497210 PET117Q6UWS5 81 aa6.57□□□□□ -1.36
CTPS1-211ENST00000497210 UBE2WQ96B02 151 aa6.57□□□□□ -1.36
CTPS1-211ENST00000497210 PRR34Q9NV39 138 aa6.57□□□□□ -1.36
CTPS1-211ENST00000497210 ALMS1Q8TCU4 4167 aa6.57□□□□□ -1.36
CTPS1-211ENST00000497210 TENM2Q9NT68 2774 aa6.56□□□□□ -1.36
CTPS1-211ENST00000497210 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa6.56□□□□□ -1.36
CTPS1-211ENST00000497210 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa6.56□□□□□ -1.36
CTPS1-211ENST00000497210 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa6.56□□□□□ -1.36
CTPS1-211ENST00000497210 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa6.56□□□□□ -1.36
CTPS1-211ENST00000497210 F8VRH5 84 aa6.56□□□□□ -1.36
CTPS1-211ENST00000497210 HERVK_113P63121 156 aa6.56□□□□□ -1.36
CTPS1-211ENST00000497210 SPATA12Q7Z6I5 190 aa6.56□□□□□ -1.36
CTPS1-211ENST00000497210 NFE4Q86UQ8 179 aa6.56□□□□□ -1.36
CTPS1-211ENST00000497210 CST9LQ9H4G1 147 aa6.56□□□□□ -1.36
CTPS1-211ENST00000497210 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
CTPS1-211ENST00000497210 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
CTPS1-211ENST00000497210 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-211ENST00000497210 C3orf79P0CE67 100 aa6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-211ENST00000497210 UBE2D1P51668 147 aa6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-211ENST00000497210 LINC00173Q6ZV60 143 aa6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-211ENST00000497210 OR10D4PQ8NGN7 298 aa6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-211ENST00000497210 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-211ENST00000497210 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-211ENST00000497210 CHAC1Q9BUX1 264 aa6.55□□□□□ -1.36
CTPS1-211ENST00000497210 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-211ENST00000497210 H3BRM9 83 aa6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-211ENST00000497210 DPM2O94777 84 aa6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-211ENST00000497210 IGLC3P0DOY3 106 aa6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-211ENST00000497210 Q9HAA7 133 aa6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-211ENST00000497210 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-211ENST00000497210 GAGE10A6NGK3 116 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-211ENST00000497210 XCL1P47992 114 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-211ENST00000497210 LINC01545Q5VT33 79 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-211ENST00000497210 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-211ENST00000497210 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-211ENST00000497210 PSCAO43653 123 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-211ENST00000497210 IGKCP01834 107 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-211ENST00000497210 HERVK_113P61574 105 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-211ENST00000497210 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-211ENST00000497210 ENHOQ6UWT2 76 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-211ENST00000497210 LINC00469Q8N7U9 141 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-211ENST00000497210 FAM104AQ969W3 186 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-211ENST00000497210 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-211ENST00000497210 DNAH1Q9P2D7 4330 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-211ENST00000497210 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.51□□□□□ -1.37
CTPS1-211ENST00000497210 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa6.51□□□□□ -1.37
CTPS1-211ENST00000497210 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa6.51□□□□□ -1.37
CTPS1-211ENST00000497210 A0A0A0MQY5 61 aa6.51□□□□□ -1.37
CTPS1-211ENST00000497210 LCE6AA0A183 80 aa6.51□□□□□ -1.37
CTPS1-211ENST00000497210 HSBP1L1C9JCN9 74 aa6.51□□□□□ -1.37
CTPS1-211ENST00000497210 COX7A2LO14548 114 aa6.51□□□□□ -1.37
CTPS1-211ENST00000497210 APOMO95445 188 aa6.51□□□□□ -1.37
CTPS1-211ENST00000497210 SCGB1D1O95968 90 aa6.51□□□□□ -1.37
CTPS1-211ENST00000497210 LINC00242Q5T6M2 205 aa6.51□□□□□ -1.37
CTPS1-211ENST00000497210 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa6.51□□□□□ -1.37
CTPS1-211ENST00000497210 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-211ENST00000497210 A0A0J9YXV3 536 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-211ENST00000497210 TMEM170BQ5T4T1 132 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-211ENST00000497210 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-211ENST00000497210 C11orf86A6NJI1 115 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-211ENST00000497210 CFAP161Q6P656 301 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-211ENST00000497210 Q6ZR54 194 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-211ENST00000497210 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-211ENST00000497210 C6orf223Q8N319 242 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-211ENST00000497210 PMCHL2Q9BQD1 86 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-211ENST00000497210 A0A087WZ39 114 aa6.48□□□□□ -1.37
CTPS1-211ENST00000497210 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa6.48□□□□□ -1.37
CTPS1-211ENST00000497210 M0R2N4 97 aa6.48□□□□□ -1.37
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