RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496549.5

CRNKL1-205, Transcript of crooked neck pre-mRNA splicing factor 1, human

TSL 1 (best)

Gene CRNKL1, Length 4,093 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CRNKL1-205	ENST00000496549	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		5.95	□□□□□ -1.46
CRNKL1-205	ENST00000496549	BOD1L1	Q8NFC6	3051 aa		5.95	□□□□□ -1.46
CRNKL1-205	ENST00000496549	CHD6	Q8TD26	2715 aa		5.95	□□□□□ -1.46
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		5.95	□□□□□ -1.46
CRNKL1-205	ENST00000496549	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		5.95	□□□□□ -1.46
CRNKL1-205	ENST00000496549	RNF223	E7ERA6	249 aa		5.95	□□□□□ -1.46
CRNKL1-205	ENST00000496549	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	5.95	□□□□□ -1.46
CRNKL1-205	ENST00000496549	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	5.94	□□□□□ -1.46
CRNKL1-205	ENST00000496549	CXCL6	P80162	114 aa		5.94	□□□□□ -1.46
CRNKL1-205	ENST00000496549	COL6A6	A6NMZ7	2263 aa		5.94	□□□□□ -1.46
CRNKL1-205	ENST00000496549	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		5.93	□□□□□ -1.46
CRNKL1-205	ENST00000496549	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		5.93	□□□□□ -1.46
CRNKL1-205	ENST00000496549	LYNX1	P0DP58	116 aa		5.93	□□□□□ -1.46
CRNKL1-205	ENST00000496549	LINC00315	P59091	139 aa		5.93	□□□□□ -1.46
CRNKL1-205	ENST00000496549	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		5.93	□□□□□ -1.46
CRNKL1-205	ENST00000496549		Q6ZVQ6	151 aa		5.93	□□□□□ -1.46
CRNKL1-205	ENST00000496549	USMG5	Q96IX5	58 aa		5.93	□□□□□ -1.46
CRNKL1-205	ENST00000496549	FAM208B	Q5VWN6	2430 aa		5.93	□□□□□ -1.46
CRNKL1-205	ENST00000496549	USP24	Q9UPU5	2620 aa		5.93	□□□□□ -1.46
CRNKL1-205	ENST00000496549	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		5.93	□□□□□ -1.46
CRNKL1-205	ENST00000496549	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		5.93	□□□□□ -1.46
CRNKL1-205	ENST00000496549	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	5.93	□□□□□ -1.46
CRNKL1-205	ENST00000496549	CREBBP	Q92793	2442 aa		5.93	□□□□□ -1.46
CRNKL1-205	ENST00000496549	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		5.93	□□□□□ -1.46
CRNKL1-205	ENST00000496549		A6NED7	52 aa		5.93	□□□□□ -1.46
CRNKL1-205	ENST00000496549		F8W735	103 aa	Predicted RBP	5.93	□□□□□ -1.46
CRNKL1-205	ENST00000496549		Q6ZRU5	148 aa		5.93	□□□□□ -1.46
CRNKL1-205	ENST00000496549	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		5.93	□□□□□ -1.46
CRNKL1-205	ENST00000496549	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		5.92	□□□□□ -1.46
CRNKL1-205	ENST00000496549	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	5.92	□□□□□ -1.46
CRNKL1-205	ENST00000496549	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		5.92	□□□□□ -1.46
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		5.92	□□□□□ -1.46
CRNKL1-205	ENST00000496549	LY6G6E	A0A0G2JKS1	128 aa		5.92	□□□□□ -1.46
CRNKL1-205	ENST00000496549	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		5.92	□□□□□ -1.46
CRNKL1-205	ENST00000496549	ATP1A1-AS1	Q5TC04	95 aa		5.92	□□□□□ -1.46
CRNKL1-205	ENST00000496549	C16orf95	Q9H693	158 aa		5.92	□□□□□ -1.46
CRNKL1-205	ENST00000496549		U3KQA8	63 aa		5.92	□□□□□ -1.46
CRNKL1-205	ENST00000496549	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		5.91	□□□□□ -1.46
CRNKL1-205	ENST00000496549		Q8N814	137 aa		5.91	□□□□□ -1.46
CRNKL1-205	ENST00000496549	CCDC140	Q96MF4	163 aa		5.91	□□□□□ -1.46
CRNKL1-205	ENST00000496549	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		5.91	□□□□□ -1.46
CRNKL1-205	ENST00000496549	KLLN	B2CW77	178 aa		5.91	□□□□□ -1.46
CRNKL1-205	ENST00000496549	ERC2-IT1	O76042	136 aa		5.91	□□□□□ -1.46
CRNKL1-205	ENST00000496549	CCL18	P55774	89 aa		5.91	□□□□□ -1.46
CRNKL1-205	ENST00000496549	DEFB109B	Q30KR1	87 aa		5.91	□□□□□ -1.46
CRNKL1-205	ENST00000496549	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		5.91	□□□□□ -1.46
CRNKL1-205	ENST00000496549	COL12A1	Q99715	3063 aa		5.91	□□□□□ -1.46
CRNKL1-205	ENST00000496549	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		5.9	□□□□□ -1.46
CRNKL1-205	ENST00000496549	FDCSP	Q8NFU4	85 aa		5.9	□□□□□ -1.46
CRNKL1-205	ENST00000496549	APOC4	P55056	127 aa		5.9	□□□□□ -1.46
CRNKL1-205	ENST00000496549	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		5.9	□□□□□ -1.46
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		5.9	□□□□□ -1.47
CRNKL1-205	ENST00000496549	NDUFB1	O75438	58 aa		5.9	□□□□□ -1.47
CRNKL1-205	ENST00000496549	MP68	P56378	58 aa		5.9	□□□□□ -1.47
CRNKL1-205	ENST00000496549	EPM2A	B3EWF7	344 aa		5.89	□□□□□ -1.47
CRNKL1-205	ENST00000496549	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		5.89	□□□□□ -1.47
CRNKL1-205	ENST00000496549	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		5.89	□□□□□ -1.47
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF575	Q86XF7	245 aa		5.89	□□□□□ -1.47
CRNKL1-205	ENST00000496549	SMG1	Q96Q15	3661 aa	Known RBP	5.89	□□□□□ -1.47
CRNKL1-205	ENST00000496549	NBEA	Q8NFP9	2946 aa		5.89	□□□□□ -1.47
CRNKL1-205	ENST00000496549	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		5.89	□□□□□ -1.47
CRNKL1-205	ENST00000496549	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		5.89	□□□□□ -1.47
CRNKL1-205	ENST00000496549	C10orf142	B7Z368	130 aa		5.89	□□□□□ -1.47
CRNKL1-205	ENST00000496549	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		5.89	□□□□□ -1.47
CRNKL1-205	ENST00000496549		Q8N9W7	124 aa		5.89	□□□□□ -1.47
CRNKL1-205	ENST00000496549	ATM	Q13315	3056 aa		5.89	□□□□□ -1.47
CRNKL1-205	ENST00000496549	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		5.89	□□□□□ -1.47
CRNKL1-205	ENST00000496549	INS	P01308	110 aa		5.89	□□□□□ -1.47
CRNKL1-205	ENST00000496549		Q6ZTI0	123 aa		5.89	□□□□□ -1.47
CRNKL1-205	ENST00000496549	TLN1	Q9Y490	2541 aa	Known RBP	5.88	□□□□□ -1.47
CRNKL1-205	ENST00000496549	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	5.88	□□□□□ -1.47	5e-7	■■□□□ 13.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	RBM12B-AS1	Q9P1G2	102 aa		5.88	□□□□□ -1.47
CRNKL1-205	ENST00000496549	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		5.88	□□□□□ -1.47
CRNKL1-205	ENST00000496549	OBSCN-AS1	Q96MR7	158 aa		5.88	□□□□□ -1.47
CRNKL1-205	ENST00000496549	FLNB	O75369	2602 aa	Known RBP	5.87	□□□□□ -1.47
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		5.87	□□□□□ -1.47
CRNKL1-205	ENST00000496549	AVP	P01185	164 aa		5.87	□□□□□ -1.47
CRNKL1-205	ENST00000496549	COX6A2	Q02221	97 aa		5.87	□□□□□ -1.47
CRNKL1-205	ENST00000496549	C6orf99	Q4VX62	202 aa		5.87	□□□□□ -1.47
CRNKL1-205	ENST00000496549	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		5.87	□□□□□ -1.47
CRNKL1-205	ENST00000496549	VPREB1	P12018	145 aa		5.87	□□□□□ -1.47
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGHV3-53	P01767	116 aa		5.87	□□□□□ -1.47
CRNKL1-205	ENST00000496549	PRR4	Q16378	134 aa		5.87	□□□□□ -1.47
CRNKL1-205	ENST00000496549	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		5.86	□□□□□ -1.47
CRNKL1-205	ENST00000496549	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
CRNKL1-205	ENST00000496549	PRR15L	Q9BU68	103 aa		5.86	□□□□□ -1.47
CRNKL1-205	ENST00000496549	KALRN	O60229	2985 aa		5.86	□□□□□ -1.47
CRNKL1-205	ENST00000496549	LIMD2	Q9BT23	127 aa		5.86	□□□□□ -1.47
CRNKL1-205	ENST00000496549	HIGD2A	Q9BW72	106 aa		5.86	□□□□□ -1.47
CRNKL1-205	ENST00000496549		Q9UF83	564 aa		5.86	□□□□□ -1.47
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZFHX4	Q86UP3	3567 aa		5.86	□□□□□ -1.47
CRNKL1-205	ENST00000496549	NOTCH3	Q9UM47	2321 aa		5.85	□□□□□ -1.47
CRNKL1-205	ENST00000496549		K7EQD1	137 aa		5.85	□□□□□ -1.47
CRNKL1-205	ENST00000496549	PROK1	P58294	105 aa		5.85	□□□□□ -1.47
CRNKL1-205	ENST00000496549	LY6E	Q16553	131 aa		5.85	□□□□□ -1.47
CRNKL1-205	ENST00000496549	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		5.85	□□□□□ -1.47
CRNKL1-205	ENST00000496549	MED13L	Q71F56	2210 aa		5.85	□□□□□ -1.47
CRNKL1-205	ENST00000496549	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CRNKL1-205	ENST00000496549		Q6ZQT0	140 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CRNKL1-205	ENST00000496549		Q6ZQY7	126 aa		5.84	□□□□□ -1.47

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