RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495787.1

ECHDC3-204, Transcript of enoyl-CoA hydratase domain containing 3, humanhuman

TSL 3

Gene ECHDC3, Length 505 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3-204ENST00000495787 PCP2Q8IVA1 136 aa7.35□□□□□ -1.23
ECHDC3-204ENST00000495787 LINC00469Q8N7U9 141 aa7.35□□□□□ -1.23
ECHDC3-204ENST00000495787 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
ECHDC3-204ENST00000495787 H3BRM9 83 aa7.34□□□□□ -1.23
ECHDC3-204ENST00000495787 SIVA1O15304 175 aa7.34□□□□□ -1.23
ECHDC3-204ENST00000495787 CCL25O15444 150 aa7.34□□□□□ -1.23
ECHDC3-204ENST00000495787 COX6A2Q02221 97 aa7.34□□□□□ -1.23
ECHDC3-204ENST00000495787 ESRGQ1W209 222 aa7.34□□□□□ -1.23
ECHDC3-204ENST00000495787 PLEKHB2Q96CS7 222 aa7.34□□□□□ -1.23
ECHDC3-204ENST00000495787 ALMS1Q8TCU4 4167 aa7.34□□□□□ -1.23
ECHDC3-204ENST00000495787 RYR1P21817 5038 aa7.34□□□□□ -1.24
ECHDC3-204ENST00000495787 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa7.33□□□□□ -1.24
ECHDC3-204ENST00000495787 TP73-AS1Q9UF72 201 aa7.33□□□□□ -1.24
ECHDC3-204ENST00000495787 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa7.33□□□□□ -1.24
ECHDC3-204ENST00000495787 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa7.32□□□□□ -1.24
ECHDC3-204ENST00000495787 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa7.32□□□□□ -1.24
ECHDC3-204ENST00000495787 ANGP03950 147 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
ECHDC3-204ENST00000495787 CTAG1AP78358 180 aa7.32□□□□□ -1.24
ECHDC3-204ENST00000495787 SS18Q15532 418 aa7.32□□□□□ -1.24
ECHDC3-204ENST00000495787 C2orf91Q6ZV80 131 aa7.32□□□□□ -1.24
ECHDC3-204ENST00000495787 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa7.32□□□□□ -1.24
ECHDC3-204ENST00000495787 TTTY13Q9BZ97 58 aa7.32□□□□□ -1.24
ECHDC3-204ENST00000495787 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa7.31□□□□□ -1.24
ECHDC3-204ENST00000495787 IGLL5B9A064 214 aa7.31□□□□□ -1.24
ECHDC3-204ENST00000495787 J3QQQ9 107 aa7.31□□□□□ -1.24
ECHDC3-204ENST00000495787 SPINK8P0C7L1 97 aa7.31□□□□□ -1.24
ECHDC3-204ENST00000495787 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
ECHDC3-204ENST00000495787 LINC00269Q8N2A0 174 aa7.31□□□□□ -1.24
ECHDC3-204ENST00000495787 Q8N3U1 123 aa7.31□□□□□ -1.24
ECHDC3-204ENST00000495787 HIGD1BQ9P298 99 aa7.31□□□□□ -1.24
ECHDC3-204ENST00000495787 FRAS1Q86XX4 4008 aa7.31□□□□□ -1.24
ECHDC3-204ENST00000495787 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa7.3□□□□□ -1.24
ECHDC3-204ENST00000495787 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa7.3□□□□□ -1.24
ECHDC3-204ENST00000495787 ZNF815PA8K554 130 aa7.3□□□□□ -1.24
ECHDC3-204ENST00000495787 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa7.3□□□□□ -1.24
ECHDC3-204ENST00000495787 TSPEAR-AS2P59090 65 aa7.3□□□□□ -1.24
ECHDC3-204ENST00000495787 REG3AQ06141 175 aa7.3□□□□□ -1.24
ECHDC3-204ENST00000495787 WFDC10BQ8IUB3 73 aa7.3□□□□□ -1.24
ECHDC3-204ENST00000495787 KIAA1109Q2LD37 5005 aa7.3□□□□□ -1.24
ECHDC3-204ENST00000495787 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa7.29□□□□□ -1.24
ECHDC3-204ENST00000495787 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa7.29□□□□□ -1.24
ECHDC3-204ENST00000495787 IGHV3-30P01768 117 aa7.29□□□□□ -1.24
ECHDC3-204ENST00000495787 IGHV3-33P01772 117 aa7.29□□□□□ -1.24
ECHDC3-204ENST00000495787 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa7.29□□□□□ -1.24
ECHDC3-204ENST00000495787 CCL18P55774 89 aa7.29□□□□□ -1.24
ECHDC3-204ENST00000495787 CLPSL2Q6UWE3 100 aa7.29□□□□□ -1.24
ECHDC3-204ENST00000495787 PRR34Q9NV39 138 aa7.29□□□□□ -1.24
ECHDC3-204ENST00000495787 SMIM1B2RUZ4 78 aa7.28□□□□□ -1.24
ECHDC3-204ENST00000495787 M0R143 59 aa7.28□□□□□ -1.24
ECHDC3-204ENST00000495787 LINC01556Q5JQF7 62 aa7.28□□□□□ -1.24
ECHDC3-204ENST00000495787 LINC01561Q8N1V8 128 aa7.28□□□□□ -1.24
ECHDC3-204ENST00000495787 LINC00476Q8WZB0 136 aa7.28□□□□□ -1.24
ECHDC3-204ENST00000495787 KLK12Q9UKR0 248 aa7.28□□□□□ -1.24
ECHDC3-204ENST00000495787 LINC00588Q9Y4M8 146 aa7.28□□□□□ -1.24
ECHDC3-204ENST00000495787 A0A087WZ39 114 aa7.27□□□□□ -1.25
ECHDC3-204ENST00000495787 CD164L2Q6UWJ8 174 aa7.27□□□□□ -1.25
ECHDC3-204ENST00000495787 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
ECHDC3-204ENST00000495787 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa7.26□□□□□ -1.25
ECHDC3-204ENST00000495787 NUPR2A6NF83 97 aa7.26□□□□□ -1.25
ECHDC3-204ENST00000495787 LY6G6CO95867 125 aa7.26□□□□□ -1.25
ECHDC3-204ENST00000495787 CRPP02741 224 aa7.26□□□□□ -1.25
ECHDC3-204ENST00000495787 DNAH10OSP0CZ25 163 aa7.26□□□□□ -1.25
ECHDC3-204ENST00000495787 XCL1P47992 114 aa7.26□□□□□ -1.25
ECHDC3-204ENST00000495787 HSD52Q0P140 79 aa7.26□□□□□ -1.25
ECHDC3-204ENST00000495787 ENHOQ6UWT2 76 aa7.26□□□□□ -1.25
ECHDC3-204ENST00000495787 SCGB1D4Q6XE38 83 aa7.26□□□□□ -1.25
ECHDC3-204ENST00000495787 UPK3BQ9BT76 320 aa7.26□□□□□ -1.25
ECHDC3-204ENST00000495787 SNHG12Q9BXW3 62 aa7.26□□□□□ -1.25
ECHDC3-204ENST00000495787 NDUFA12Q9UI09 145 aa7.26□□□□□ -1.25
ECHDC3-204ENST00000495787 APLNQ9ULZ1 77 aa7.26□□□□□ -1.25
ECHDC3-204ENST00000495787 EREGO14944 169 aa7.25□□□□□ -1.25
ECHDC3-204ENST00000495787 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
ECHDC3-204ENST00000495787 TAL2Q16559 108 aa7.25□□□□□ -1.25
ECHDC3-204ENST00000495787 MIAQ16674 131 aa7.25□□□□□ -1.25
ECHDC3-204ENST00000495787 C5orf38Q86SI9 138 aa7.25□□□□□ -1.25
ECHDC3-204ENST00000495787 UBE2WQ96B02 151 aa7.25□□□□□ -1.25
ECHDC3-204ENST00000495787 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
ECHDC3-204ENST00000495787 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa7.24□□□□□ -1.25
ECHDC3-204ENST00000495787 NDUFA1O15239 70 aa7.24□□□□□ -1.25
ECHDC3-204ENST00000495787 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa7.24□□□□□ -1.25
ECHDC3-204ENST00000495787 COX7B2Q8TF08 81 aa7.24□□□□□ -1.25
ECHDC3-204ENST00000495787 A0A0J9YXY3 114 aa7.23□□□□□ -1.25
ECHDC3-204ENST00000495787 GAGE12HA6NDE8 117 aa7.23□□□□□ -1.25
ECHDC3-204ENST00000495787 COX7A2LO14548 114 aa7.23□□□□□ -1.25
ECHDC3-204ENST00000495787 FOXI1Q12951 378 aa7.23□□□□□ -1.25
ECHDC3-204ENST00000495787 BATFQ16520 125 aa7.23□□□□□ -1.25
ECHDC3-204ENST00000495787 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
ECHDC3-204ENST00000495787 C10orf126Q8N4M7 172 aa7.23□□□□□ -1.25
ECHDC3-204ENST00000495787 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
ECHDC3-204ENST00000495787 DNAH10Q8IVF4 4471 aa7.23□□□□□ -1.25
ECHDC3-204ENST00000495787 ORAOV1Q8WV07 137 aa7.22□□□□□ -1.25
ECHDC3-204ENST00000495787 HIST1H4GQ99525 98 aa7.22□□□□□ -1.25
ECHDC3-204ENST00000495787 TIMM17BO60830 172 aa7.21□□□□□ -1.26
ECHDC3-204ENST00000495787 MALP21145 153 aa7.21□□□□□ -1.26
ECHDC3-204ENST00000495787 HERV-K104P63124 156 aa7.21□□□□□ -1.26
ECHDC3-204ENST00000495787 Q8IZM0 81 aa7.21□□□□□ -1.26
ECHDC3-204ENST00000495787 CEND1Q8N111 149 aa7.21□□□□□ -1.26
ECHDC3-204ENST00000495787 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
ECHDC3-204ENST00000495787 Q9H8V8 135 aa7.21□□□□□ -1.26
ECHDC3-204ENST00000495787 TOMM7Q9P0U1 55 aa7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.1 ms