RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493107.5

SEC22C-216, Transcript of SEC22 homolog C, vesicle trafficking protein, humanhuman

TSL 5

Gene SEC22C, Length 827 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22C-216ENST00000493107 LINC01556Q5JQF7 62 aa6.35□□□□□ -1.39
SEC22C-216ENST00000493107 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa6.35□□□□□ -1.39
SEC22C-216ENST00000493107 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa6.35□□□□□ -1.39
SEC22C-216ENST00000493107 DNAH17Q9UFH2 4485 aa6.35□□□□□ -1.39
SEC22C-216ENST00000493107 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa6.34□□□□□ -1.39
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SEC22C-216ENST00000493107 E9PLD3 99 aa6.34□□□□□ -1.39
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SEC22C-216ENST00000493107 IGHV3-33P01772 117 aa6.34□□□□□ -1.39
SEC22C-216ENST00000493107 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa6.34□□□□□ -1.39
SEC22C-216ENST00000493107 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa6.34□□□□□ -1.39
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SEC22C-216ENST00000493107 HERVK_113P63121 156 aa6.32□□□□□ -1.4
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SEC22C-216ENST00000493107 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa6.3□□□□□ -1.4
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SEC22C-216ENST00000493107 XCL1P47992 114 aa6.3□□□□□ -1.4
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SEC22C-216ENST00000493107 UQCR10Q9UDW1 63 aa6.29□□□□□ -1.4
SEC22C-216ENST00000493107 GAGE12HA6NDE8 117 aa6.28□□□□□ -1.4
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SEC22C-216ENST00000493107 J3QQQ9 107 aa6.28□□□□□ -1.4
SEC22C-216ENST00000493107 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.28□□□□□ -1.4
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SEC22C-216ENST00000493107 H3BRM9 83 aa6.27□□□□□ -1.41
SEC22C-216ENST00000493107 DDTP30046 118 aa6.27□□□□□ -1.41
SEC22C-216ENST00000493107 HERVK_113P61574 105 aa6.27□□□□□ -1.41
SEC22C-216ENST00000493107 KIAA0087Q14695 138 aa6.27□□□□□ -1.41
SEC22C-216ENST00000493107 MIAQ16674 131 aa6.27□□□□□ -1.41
SEC22C-216ENST00000493107 SLC25A34Q6PIV7 304 aa6.27□□□□□ -1.41
SEC22C-216ENST00000493107 C10orf126Q8N4M7 172 aa6.27□□□□□ -1.41
SEC22C-216ENST00000493107 PLEKHB2Q96CS7 222 aa6.27□□□□□ -1.41
SEC22C-216ENST00000493107 FAT2Q9NYQ8 4349 aa6.27□□□□□ -1.41
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SEC22C-216ENST00000493107 CASC10Q5T4H9 136 aa6.26□□□□□ -1.41
SEC22C-216ENST00000493107 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
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SEC22C-216ENST00000493107 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
SEC22C-216ENST00000493107 CRPP02741 224 aa6.25□□□□□ -1.41
SEC22C-216ENST00000493107 DNAH5Q8TE73 4624 aa6.25□□□□□ -1.41
SEC22C-216ENST00000493107 ZNF815PA8K554 130 aa6.24□□□□□ -1.41
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SEC22C-216ENST00000493107 CTAG1AP78358 180 aa6.24□□□□□ -1.41
SEC22C-216ENST00000493107 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa6.24□□□□□ -1.41
SEC22C-216ENST00000493107 LITAFQ99732 161 aa6.24□□□□□ -1.41
SEC22C-216ENST00000493107 HIGD1BQ9P298 99 aa6.24□□□□□ -1.41
SEC22C-216ENST00000493107 A0A0J9YXY3 114 aa6.23□□□□□ -1.41
SEC22C-216ENST00000493107 K7EP13 123 aa6.23□□□□□ -1.41
SEC22C-216ENST00000493107 NDUFA1O15239 70 aa6.23□□□□□ -1.41
SEC22C-216ENST00000493107 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
SEC22C-216ENST00000493107 C15orf56Q8N910 161 aa6.23□□□□□ -1.41
SEC22C-216ENST00000493107 COX7B2Q8TF08 81 aa6.23□□□□□ -1.41
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