RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 WFDC10AQ9H1F0 79 aa5.07□□□□□ -1.6
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HERC4-211ENST00000492996 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa5.07□□□□□ -1.6
HERC4-211ENST00000492996 DSCR8Q96T75 97 aa5.07□□□□□ -1.6
HERC4-211ENST00000492996 TM2D3Q9BRN9 247 aa5.07□□□□□ -1.6
HERC4-211ENST00000492996 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa5.06□□□□□ -1.6
HERC4-211ENST00000492996 C2orf82Q6UX34 121 aa5.06□□□□□ -1.6
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HERC4-211ENST00000492996 M0R2P5 195 aa5.06□□□□□ -1.6
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HERC4-211ENST00000492996 A8MTW9 85 aa5.04□□□□□ -1.6
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HERC4-211ENST00000492996 C11orf72Q8NBR9 251 aa5.04□□□□□ -1.6
HERC4-211ENST00000492996 ATRQ13535 2644 aa5.04□□□□□ -1.6
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HERC4-211ENST00000492996 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
HERC4-211ENST00000492996 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
HERC4-211ENST00000492996 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
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HERC4-211ENST00000492996 C9orf66Q5T8R8 295 aa5.03□□□□□ -1.6
HERC4-211ENST00000492996 SBSPONQ8IVN8 264 aa5.03□□□□□ -1.6
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HERC4-211ENST00000492996 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa5.03□□□□□ -1.6
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HERC4-211ENST00000492996 Q6ZTI0 123 aa5.02□□□□□ -1.61
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HERC4-211ENST00000492996 PRO0628Q9UI54 55 aa5.02□□□□□ -1.61
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HERC4-211ENST00000492996 UBE2D1P51668 147 aa5.02□□□□□ -1.61
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HERC4-211ENST00000492996 OXLD1Q5BKU9 147 aa4.98□□□□□ -1.61
HERC4-211ENST00000492996 SLC25A29Q8N8R3 303 aa4.98□□□□□ -1.61
HERC4-211ENST00000492996 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
HERC4-211ENST00000492996 AMELXQ99217 191 aa4.98□□□□□ -1.61
HERC4-211ENST00000492996 TIMM21Q9BVV7 248 aa4.98□□□□□ -1.61
HERC4-211ENST00000492996 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa4.98□□□□□ -1.61
HERC4-211ENST00000492996 LEPROTO15243 131 aa4.98□□□□□ -1.61
HERC4-211ENST00000492996 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa4.98□□□□□ -1.61
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