RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492966.5

TMBIM1-222, Transcript of transmembrane BAX inhibitor motif containing 1, human

TSL 4

Gene TMBIM1, Length 400 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMBIM1-222	ENST00000492966	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		3.61	□□□□□ -1.83
TMBIM1-222	ENST00000492966		H7C423	109 aa		3.61	□□□□□ -1.83
TMBIM1-222	ENST00000492966	IGLV6-57	P01721	117 aa		3.61	□□□□□ -1.83
TMBIM1-222	ENST00000492966	RAB14	P61106	215 aa		3.61	□□□□□ -1.83
TMBIM1-222	ENST00000492966	STOML3	Q8TAV4	291 aa		3.61	□□□□□ -1.83
TMBIM1-222	ENST00000492966	TMEM101	Q96IK0	257 aa		3.61	□□□□□ -1.83
TMBIM1-222	ENST00000492966	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		3.6	□□□□□ -1.83
TMBIM1-222	ENST00000492966	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		3.6	□□□□□ -1.83
TMBIM1-222	ENST00000492966	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		3.6	□□□□□ -1.83
TMBIM1-222	ENST00000492966	PET100	P0DJ07	73 aa		3.6	□□□□□ -1.83
TMBIM1-222	ENST00000492966	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		3.6	□□□□□ -1.83
TMBIM1-222	ENST00000492966	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
TMBIM1-222	ENST00000492966	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
TMBIM1-222	ENST00000492966	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		3.6	□□□□□ -1.83
TMBIM1-222	ENST00000492966	SPRR2F	Q96RM1	72 aa		3.6	□□□□□ -1.83
TMBIM1-222	ENST00000492966	CHTOP	Q9Y3Y2	248 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
TMBIM1-222	ENST00000492966		A6NN06	94 aa		3.59	□□□□□ -1.83
TMBIM1-222	ENST00000492966		F8WDY8	70 aa		3.59	□□□□□ -1.83
TMBIM1-222	ENST00000492966	TEX46	H3BTG2	121 aa		3.59	□□□□□ -1.83
TMBIM1-222	ENST00000492966	SCO1	O75880	301 aa		3.59	□□□□□ -1.83
TMBIM1-222	ENST00000492966	SPRR2D	P22532	72 aa		3.59	□□□□□ -1.83
TMBIM1-222	ENST00000492966	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	3.59	□□□□□ -1.83
TMBIM1-222	ENST00000492966	HBG1	P69891	147 aa		3.59	□□□□□ -1.83
TMBIM1-222	ENST00000492966	HBG2	P69892	147 aa		3.59	□□□□□ -1.83
TMBIM1-222	ENST00000492966	NHLH2	Q02577	135 aa		3.59	□□□□□ -1.83
TMBIM1-222	ENST00000492966	KIAA0087	Q14695	138 aa		3.59	□□□□□ -1.83
TMBIM1-222	ENST00000492966	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
TMBIM1-222	ENST00000492966	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		3.59	□□□□□ -1.83
TMBIM1-222	ENST00000492966	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		3.59	□□□□□ -1.83
TMBIM1-222	ENST00000492966	C20orf166-AS1	Q96NR2	134 aa		3.59	□□□□□ -1.83
TMBIM1-222	ENST00000492966	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
TMBIM1-222	ENST00000492966	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TMBIM1-222	ENST00000492966	C20orf202	A1L168	122 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TMBIM1-222	ENST00000492966	IGKV2D-28	P01615	120 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TMBIM1-222	ENST00000492966	ATP6V1F	Q16864	119 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TMBIM1-222	ENST00000492966	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TMBIM1-222	ENST00000492966	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TMBIM1-222	ENST00000492966	STX12	Q86Y82	276 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TMBIM1-222	ENST00000492966		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
TMBIM1-222	ENST00000492966	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
TMBIM1-222	ENST00000492966	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TMBIM1-222	ENST00000492966	TMEM238	C9JI98	176 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TMBIM1-222	ENST00000492966	NCR2	O95944	276 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TMBIM1-222	ENST00000492966	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
TMBIM1-222	ENST00000492966	MOBP	Q13875	183 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TMBIM1-222	ENST00000492966	CBLN2	Q8IUK8	224 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TMBIM1-222	ENST00000492966	HIGD2A	Q9BW72	106 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TMBIM1-222	ENST00000492966	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TMBIM1-222	ENST00000492966	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TMBIM1-222	ENST00000492966	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TMBIM1-222	ENST00000492966	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TMBIM1-222	ENST00000492966	RAB19	A4D1S5	217 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TMBIM1-222	ENST00000492966	ZNF727	A8MUV8	499 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TMBIM1-222	ENST00000492966	UQCC3	Q6UW78	93 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TMBIM1-222	ENST00000492966	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
TMBIM1-222	ENST00000492966	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TMBIM1-222	ENST00000492966	TMEM218	A2RU14	115 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TMBIM1-222	ENST00000492966	CXCL1	P09341	107 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TMBIM1-222	ENST00000492966	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TMBIM1-222	ENST00000492966	BLOC1S1	P78537	153 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TMBIM1-222	ENST00000492966	C10orf91	Q5T1B1	145 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TMBIM1-222	ENST00000492966	LCE3B	Q5TA77	95 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TMBIM1-222	ENST00000492966		Q6ZUT4	128 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TMBIM1-222	ENST00000492966	GATD1	Q8NB37	220 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TMBIM1-222	ENST00000492966	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TMBIM1-222	ENST00000492966	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TMBIM1-222	ENST00000492966		C9JQL5	133 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TMBIM1-222	ENST00000492966	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TMBIM1-222	ENST00000492966	PEX7	O00628	323 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TMBIM1-222	ENST00000492966	ADCYAP1	P18509	176 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TMBIM1-222	ENST00000492966	ATP6V0C	P27449	155 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TMBIM1-222	ENST00000492966	GCHFR	P30047	84 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TMBIM1-222	ENST00000492966	TMEM126A	Q9H061	195 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TMBIM1-222	ENST00000492966	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
TMBIM1-222	ENST00000492966	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TMBIM1-222	ENST00000492966	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		3.53	□□□□□ -1.84
TMBIM1-222	ENST00000492966	FHIT	P49789	147 aa		3.53	□□□□□ -1.84
TMBIM1-222	ENST00000492966	MRAP2	Q96G30	205 aa		3.53	□□□□□ -1.84
TMBIM1-222	ENST00000492966	TPPP3	Q9BW30	176 aa		3.53	□□□□□ -1.84
TMBIM1-222	ENST00000492966		A0A1W2PPV4	95 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TMBIM1-222	ENST00000492966	UMAD1	C9J7I0	102 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TMBIM1-222	ENST00000492966		M0R378	163 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TMBIM1-222	ENST00000492966	APOC3	P02656	99 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TMBIM1-222	ENST00000492966	STAG3L2	P0CL84	134 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TMBIM1-222	ENST00000492966	STAG3L3	P0CL85	134 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TMBIM1-222	ENST00000492966	CCL20	P78556	96 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TMBIM1-222	ENST00000492966	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TMBIM1-222	ENST00000492966	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TMBIM1-222	ENST00000492966	SEC11C	Q9BY50	192 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TMBIM1-222	ENST00000492966	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TMBIM1-222	ENST00000492966	FAM74A7	A6NL05	159 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TMBIM1-222	ENST00000492966		F8W036	122 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TMBIM1-222	ENST00000492966	LTA	P01374	205 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TMBIM1-222	ENST00000492966	ZNF726P1	Q15940	193 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TMBIM1-222	ENST00000492966	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TMBIM1-222	ENST00000492966	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TMBIM1-222	ENST00000492966	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TMBIM1-222	ENST00000492966	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	3.51	□□□□□ -1.85
TMBIM1-222	ENST00000492966	NKX6-2	Q9C056	277 aa	Predicted RBP	3.51	□□□□□ -1.85
TMBIM1-222	ENST00000492966	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 93 ms