RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492826.1

GCFC2-210, Transcript of GC-rich sequence DNA-binding factor 2, human

TSL 3

Gene GCFC2, Length 443 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GCFC2-210	ENST00000492826	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	0.18	□□□□□ -2.38
GCFC2-210	ENST00000492826	IGSF10	Q6WRI0	2623 aa		0.18	□□□□□ -2.38
GCFC2-210	ENST00000492826	PLCE1	Q9P212	2302 aa		0.18	□□□□□ -2.38
GCFC2-210	ENST00000492826	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	0.18	□□□□□ -2.38
GCFC2-210	ENST00000492826	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		0.17	□□□□□ -2.38
GCFC2-210	ENST00000492826	PAPPA	Q13219	1627 aa		0.17	□□□□□ -2.38
GCFC2-210	ENST00000492826		I3L2K1	104 aa		0.17	□□□□□ -2.38
GCFC2-210	ENST00000492826	UBE2D3	P61077	147 aa		0.17	□□□□□ -2.38
GCFC2-210	ENST00000492826	UBE2D2	P62837	147 aa		0.17	□□□□□ -2.38
GCFC2-210	ENST00000492826	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		0.17	□□□□□ -2.38
GCFC2-210	ENST00000492826	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		0.17	□□□□□ -2.38
GCFC2-210	ENST00000492826	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		0.17	□□□□□ -2.38
GCFC2-210	ENST00000492826	SCN7A	Q01118	1682 aa		0.17	□□□□□ -2.38
GCFC2-210	ENST00000492826	HMGXB3	Q12766	1538 aa		0.17	□□□□□ -2.38
GCFC2-210	ENST00000492826	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		0.17	□□□□□ -2.38
GCFC2-210	ENST00000492826	SPTBN2	O15020	2390 aa		0.17	□□□□□ -2.38
GCFC2-210	ENST00000492826	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		0.16	□□□□□ -2.38
GCFC2-210	ENST00000492826	FAM223B	A6NKX1	122 aa		0.16	□□□□□ -2.38
GCFC2-210	ENST00000492826		H3BQ15	152 aa		0.16	□□□□□ -2.38
GCFC2-210	ENST00000492826	S100P	P25815	95 aa		0.16	□□□□□ -2.38
GCFC2-210	ENST00000492826		Q5VSD8	79 aa		0.16	□□□□□ -2.38
GCFC2-210	ENST00000492826	SPRR2G	Q9BYE4	73 aa		0.16	□□□□□ -2.38
GCFC2-210	ENST00000492826	C10orf142	B7Z368	130 aa		0.15	□□□□□ -2.39
GCFC2-210	ENST00000492826	SPRR1A	P35321	89 aa		0.15	□□□□□ -2.39
GCFC2-210	ENST00000492826	SEC11A	P67812	179 aa		0.15	□□□□□ -2.39
GCFC2-210	ENST00000492826	PRO1933	Q9H354	126 aa		0.15	□□□□□ -2.39
GCFC2-210	ENST00000492826	MYO7B	Q6PIF6	2116 aa		0.14	□□□□□ -2.39
GCFC2-210	ENST00000492826	ABCA3	Q99758	1704 aa		0.14	□□□□□ -2.39
GCFC2-210	ENST00000492826	hADV29S1	A0JD25	119 aa		0.14	□□□□□ -2.39
GCFC2-210	ENST00000492826	TMEM262	E9PQX1	116 aa		0.14	□□□□□ -2.39
GCFC2-210	ENST00000492826	SPRR4	Q96PI1	79 aa		0.14	□□□□□ -2.39
GCFC2-210	ENST00000492826	TCEAL7	Q9BRU2	100 aa		0.14	□□□□□ -2.39
GCFC2-210	ENST00000492826	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	0.14	□□□□□ -2.39
GCFC2-210	ENST00000492826	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		0.14	□□□□□ -2.39
GCFC2-210	ENST00000492826	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		0.14	□□□□□ -2.39
GCFC2-210	ENST00000492826	COL7A1	Q02388	2944 aa		0.14	□□□□□ -2.39
GCFC2-210	ENST00000492826	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		0.13	□□□□□ -2.39
GCFC2-210	ENST00000492826	ZFHX3	Q15911	3703 aa		0.13	□□□□□ -2.39
GCFC2-210	ENST00000492826	LINC01600	Q96MT4	127 aa		0.13	□□□□□ -2.39
GCFC2-210	ENST00000492826	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		0.12	□□□□□ -2.39
GCFC2-210	ENST00000492826	USF3	Q68DE3	2245 aa		0.12	□□□□□ -2.39
GCFC2-210	ENST00000492826	TMEM218	A2RU14	115 aa		0.12	□□□□□ -2.39
GCFC2-210	ENST00000492826	GNGT2	O14610	69 aa		0.12	□□□□□ -2.39
GCFC2-210	ENST00000492826	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	0.12	□□□□□ -2.39
GCFC2-210	ENST00000492826	S100A10	P60903	97 aa		0.12	□□□□□ -2.39
GCFC2-210	ENST00000492826	LCN9	Q8WX39	176 aa		0.12	□□□□□ -2.39
GCFC2-210	ENST00000492826	FXYD6	Q9H0Q3	95 aa		0.12	□□□□□ -2.39
GCFC2-210	ENST00000492826	AP4S1	Q9Y587	144 aa		0.12	□□□□□ -2.39
GCFC2-210	ENST00000492826	TSC2	P49815	1807 aa		0.12	□□□□□ -2.39
GCFC2-210	ENST00000492826	CHD1	O14646	1710 aa		0.12	□□□□□ -2.39
GCFC2-210	ENST00000492826	PTPRQ	Q9UMZ3	2332 aa		0.12	□□□□□ -2.39
GCFC2-210	ENST00000492826	TRBV7-4	A0A0J9YYF1	115 aa		0.11	□□□□□ -2.39
GCFC2-210	ENST00000492826	ATP6V1G2-DDX39B	F2Z307	99 aa		0.11	□□□□□ -2.39
GCFC2-210	ENST00000492826	CGREF1	Q99674	301 aa		0.11	□□□□□ -2.39
GCFC2-210	ENST00000492826	VAMP8	Q9BV40	100 aa		0.11	□□□□□ -2.39
GCFC2-210	ENST00000492826	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		0.11	□□□□□ -2.39
GCFC2-210	ENST00000492826	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	0.1	□□□□□ -2.39
GCFC2-210	ENST00000492826	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		0.1	□□□□□ -2.39
GCFC2-210	ENST00000492826	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	0.1	□□□□□ -2.39
GCFC2-210	ENST00000492826	PKDREJ	Q9NTG1	2253 aa		0.1	□□□□□ -2.39
GCFC2-210	ENST00000492826	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		0.1	□□□□□ -2.39
GCFC2-210	ENST00000492826	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		0.1	□□□□□ -2.39
GCFC2-210	ENST00000492826	COX6B1	P14854	86 aa		0.1	□□□□□ -2.39
GCFC2-210	ENST00000492826	C14orf144	Q96I85	54 aa		0.1	□□□□□ -2.39
GCFC2-210	ENST00000492826	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		0.1	□□□□□ -2.39
GCFC2-210	ENST00000492826	ADGRL2	O95490	1459 aa		0.1	□□□□□ -2.39
GCFC2-210	ENST00000492826		A0A0G2JND7	137 aa		0.09	□□□□□ -2.4
GCFC2-210	ENST00000492826	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		0.09	□□□□□ -2.4
GCFC2-210	ENST00000492826	AKAP6	Q13023	2319 aa		0.09	□□□□□ -2.4
GCFC2-210	ENST00000492826	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		0.09	□□□□□ -2.4
GCFC2-210	ENST00000492826	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	0.08	□□□□□ -2.4
GCFC2-210	ENST00000492826	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		0.08	□□□□□ -2.4
GCFC2-210	ENST00000492826	ABCC5	O15440	1437 aa		0.08	□□□□□ -2.4
GCFC2-210	ENST00000492826		A0A087WVE0	104 aa		0.08	□□□□□ -2.4
GCFC2-210	ENST00000492826	ASIP	P42127	132 aa		0.08	□□□□□ -2.4
GCFC2-210	ENST00000492826	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		0.08	□□□□□ -2.4
GCFC2-210	ENST00000492826	NLRP1	Q9C000	1473 aa		0.08	□□□□□ -2.4
GCFC2-210	ENST00000492826	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		0.07	□□□□□ -2.4
GCFC2-210	ENST00000492826	RBP2	P50120	134 aa		0.07	□□□□□ -2.4
GCFC2-210	ENST00000492826	CACFD1	Q9UGQ2	172 aa		0.07	□□□□□ -2.4
GCFC2-210	ENST00000492826	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		0.06	□□□□□ -2.4
GCFC2-210	ENST00000492826	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		0.06	□□□□□ -2.4
GCFC2-210	ENST00000492826	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		0.06	□□□□□ -2.4
GCFC2-210	ENST00000492826		K7EQZ3	153 aa		0.06	□□□□□ -2.4
GCFC2-210	ENST00000492826	NDUFC1	O43677	76 aa		0.06	□□□□□ -2.4
GCFC2-210	ENST00000492826	SPRR1B	P22528	89 aa		0.06	□□□□□ -2.4
GCFC2-210	ENST00000492826	DEFB123	Q8N688	67 aa		0.06	□□□□□ -2.4
GCFC2-210	ENST00000492826	PMCHL1	Q16048	86 aa		0.05	□□□□□ -2.4
GCFC2-210	ENST00000492826	PSMG4	Q5JS54	123 aa		0.05	□□□□□ -2.4
GCFC2-210	ENST00000492826	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		0.05	□□□□□ -2.4
GCFC2-210	ENST00000492826	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		0.05	□□□□□ -2.4
GCFC2-210	ENST00000492826	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	0.04	□□□□□ -2.4
GCFC2-210	ENST00000492826	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		0.04	□□□□□ -2.4
GCFC2-210	ENST00000492826	GOLGA4	Q13439	2230 aa	Known RBP	0.04	□□□□□ -2.4
GCFC2-210	ENST00000492826	MT-ATP8	P03928	68 aa		0.04	□□□□□ -2.4
GCFC2-210	ENST00000492826	PIEZO2	Q9H5I5	2752 aa		0.04	□□□□□ -2.4
GCFC2-210	ENST00000492826	VWF	P04275	2813 aa		0.04	□□□□□ -2.4
GCFC2-210	ENST00000492826	NCOR1	O75376	2440 aa		0.03	□□□□□ -2.4
GCFC2-210	ENST00000492826		A0A1B0GU69	56 aa		0.03	□□□□□ -2.4
GCFC2-210	ENST00000492826	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		0.03	□□□□□ -2.4

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