RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489495.5

FUBP1-211, Transcript of far upstream element binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene FUBP1, Length 2,156 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUBP1-211ENST00000489495 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa2.58□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa2.58□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 ATP6V0E1O15342 81 aa2.58□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP2.58□□□□□ -25e-8■□□□□ 11.3
FUBP1-211ENST00000489495 HAMPP81172 84 aa2.58□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 Q1T7F1 81 aa2.58□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 TMEM254Q8TBM7 123 aa2.58□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa2.58□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 FAM186AA6NE01 2351 aa2.58□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa2.57□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 CDK2AP2O75956 126 aa2.57□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 LY6G6DO95868 133 aa2.57□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 PDE6GP18545 87 aa2.57□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 LINC00158P58513 81 aa2.57□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 BSPH1Q075Z2 132 aa2.57□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 NREPQ16612 68 aa2.57□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 Q6ZTC4 211 aa2.57□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 Q8N814 137 aa2.57□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 TMEM105Q8N8V8 129 aa2.57□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 TM2D3Q9BRN9 247 aa2.57□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 ESM1Q9NQ30 184 aa2.57□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 TRANK1O15050 2925 aa2.57□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 NBEAQ8NFP9 2946 aa2.57□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 CACNA1EQ15878 2313 aa2.57□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa2.57□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa2.57□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 CCL18P55774 89 aa2.57□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 Q6ZQT0 140 aa2.57□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 COX7B2Q8TF08 81 aa2.57□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa2.56□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa2.56□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 LYRM9A8MSI8 78 aa2.56□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 E7EQL1 145 aa2.56□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 G3V318 75 aa2.56□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 H3BQ85 93 aa2.56□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 Q6ZTI0 123 aa2.56□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 C6orf223Q8N319 242 aa2.56□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 LINC01560Q8TB33 94 aa2.56□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa2.56□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 CACNA1GO43497 2377 aa2.56□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 CADP27708 2225 aa2.56□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 INAFM1C9JVW0 142 aa2.56□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 K7EQD1 137 aa2.56□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 BPY2O14599 106 aa2.56□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 PROK1P58294 105 aa2.56□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 FAM215AQ9Y5M1 114 aa2.56□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 FRYQ5TBA9 3013 aa2.55□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa2.55□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 hDV103S1A0JD37 113 aa2.55□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 LYNX1G3V0Z9 82 aa2.55□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 K7EMT4 169 aa2.55□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 IGHV3-53P01767 116 aa2.55□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 LYNX1P0DP58 116 aa2.55□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 FDCSPQ8NFU4 85 aa2.55□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 USMG5Q96IX5 58 aa2.55□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 K7EQG2 157 aa2.54□□□□□ -2
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FUBP1-211ENST00000489495 C9orf66Q5T8R8 295 aa2.54□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa2.54□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa2.54□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa2.54□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 SDK1Q7Z5N4 2213 aa2.54□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa2.54□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 ICE1Q9Y2F5 2266 aa2.54□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 H3BUA1 57 aa2.54□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 NDUFS5O43920 106 aa2.54□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 IGKV3-20P01619 116 aa2.54□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 SPINK13Q1W4C9 94 aa2.54□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 Q6ZRP5 223 aa2.54□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa2.54□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 LAMA1P25391 3075 aa2.53□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa2.53□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa2.53□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 C5orf56Q8N8D9 126 aa2.53□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 OCR1Q9BZK8 76 aa2.53□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 TOMM7Q9P0U1 55 aa2.53□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 Q9UF83 564 aa2.53□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 VPS13AQ96RL7 3174 aa2.53□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 PLCE1Q9P212 2302 aa2.53□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa2.53□□□□□ -2
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FUBP1-211ENST00000489495 LINC00575Q6W349 94 aa2.53□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 C11orf45Q8TAV5 145 aa2.53□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 LINC00588Q9Y4M8 146 aa2.53□□□□□ -2
FUBP1-211ENST00000489495 SPEGQ15772 3267 aa2.52□□□□□ -2.01
FUBP1-211ENST00000489495 TRAV22A0A0B4J277 110 aa2.52□□□□□ -2.01
FUBP1-211ENST00000489495 M0R2N4 97 aa2.52□□□□□ -2.01
FUBP1-211ENST00000489495 M0R378 163 aa2.52□□□□□ -2.01
FUBP1-211ENST00000489495 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
FUBP1-211ENST00000489495 KRTAP10-2P60368 255 aa2.52□□□□□ -2.01
FUBP1-211ENST00000489495 C1orf64Q8NEQ6 169 aa2.52□□□□□ -2.01
FUBP1-211ENST00000489495 HIGD2AQ9BW72 106 aa2.52□□□□□ -2.01
FUBP1-211ENST00000489495 URB1O60287 2271 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
FUBP1-211ENST00000489495 REV3LO60673 3130 aa2.52□□□□□ -2.01
FUBP1-211ENST00000489495 UBE2L6O14933 153 aa2.51□□□□□ -2.01
FUBP1-211ENST00000489495 PSPHP1O15172 72 aa2.51□□□□□ -2.01
FUBP1-211ENST00000489495 HTN1P15515 57 aa2.51□□□□□ -2.01
FUBP1-211ENST00000489495 UBE2AP49459 152 aa2.51□□□□□ -2.01
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