RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486480.1

PTPRN-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRN, Length 563 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-216ENST00000486480 ERASQ7Z444 233 aa12.36□□□□□ -0.43
PTPRN-216ENST00000486480 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa12.36□□□□□ -0.43
PTPRN-216ENST00000486480 VCX2Q9H322 139 aa12.36□□□□□ -0.43
PTPRN-216ENST00000486480 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa12.35□□□□□ -0.43
PTPRN-216ENST00000486480 UBE2D1P51668 147 aa12.35□□□□□ -0.43
PTPRN-216ENST00000486480 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa12.35□□□□□ -0.43
PTPRN-216ENST00000486480 SCGB3A1Q96QR1 104 aa12.35□□□□□ -0.43
PTPRN-216ENST00000486480 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa12.35□□□□□ -0.43
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PTPRN-216ENST00000486480 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa12.32□□□□□ -0.44
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PTPRN-216ENST00000486480 SPAG11BQ08648 103 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRN-216ENST00000486480 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRN-216ENST00000486480 OR10D4PQ8NGN7 298 aa12.29□□□□□ -0.44
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PTPRN-216ENST00000486480 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
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PTPRN-216ENST00000486480 C10orf25Q5T742 122 aa12.16□□□□□ -0.46
PTPRN-216ENST00000486480 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa12.16□□□□□ -0.46
PTPRN-216ENST00000486480 FAM19A2Q8N3H0 131 aa12.16□□□□□ -0.46
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PTPRN-216ENST00000486480 SMIM1B2RUZ4 78 aa12.15□□□□□ -0.46
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PTPRN-216ENST00000486480 C2orf82Q6UX34 121 aa12.14□□□□□ -0.47
PTPRN-216ENST00000486480 IFI27L1Q96BM0 104 aa12.14□□□□□ -0.47
PTPRN-216ENST00000486480 LINC00474Q9P2X8 69 aa12.14□□□□□ -0.47
PTPRN-216ENST00000486480 C6orf48Q9UBA6 75 aa12.14□□□□□ -0.47
PTPRN-216ENST00000486480 PTTG1IPP53801 180 aa12.13□□□□□ -0.47
PTPRN-216ENST00000486480 PLAC8Q9NZF1 115 aa12.13□□□□□ -0.47
PTPRN-216ENST00000486480 FAT1Q14517 4588 aa12.13□□□□□ -0.47
PTPRN-216ENST00000486480 H3BRM9 83 aa12.12□□□□□ -0.47
PTPRN-216ENST00000486480 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
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