RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472278.1

LRRTM3-202, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 3, humanhuman

TSL 2

Gene LRRTM3, Length 264 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM3-202ENST00000472278 CUL7Q14999 1698 aa-0.03□□□□□ -2.41
LRRTM3-202ENST00000472278 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
LRRTM3-202ENST00000472278 ZFHX3Q15911 3703 aa-0.03□□□□□ -2.41
LRRTM3-202ENST00000472278 NCOR1O75376 2440 aa-0.03□□□□□ -2.41
LRRTM3-202ENST00000472278 TCHHQ07283 1943 aa-0.03□□□□□ -2.41
LRRTM3-202ENST00000472278 FSIP2Q5CZC0 6907 aa-0.04□□□□□ -2.42
LRRTM3-202ENST00000472278 KMT2AQ03164 3969 aa-0.04□□□□□ -2.42
LRRTM3-202ENST00000472278 LINC00587B1AMM8 73 aa-0.04□□□□□ -2.42
LRRTM3-202ENST00000472278 TRAPPC2P0DI81 140 aa-0.04□□□□□ -2.42
LRRTM3-202ENST00000472278 TRAPPC2BP0DI82 140 aa-0.04□□□□□ -2.42
LRRTM3-202ENST00000472278 COX6B1P14854 86 aa-0.04□□□□□ -2.42
LRRTM3-202ENST00000472278 KRTDAPP60985 99 aa-0.04□□□□□ -2.42
LRRTM3-202ENST00000472278 UBA52P62987 128 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
LRRTM3-202ENST00000472278 C10orf113Q5VZT2 155 aa-0.04□□□□□ -2.42
LRRTM3-202ENST00000472278 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa-0.04□□□□□ -2.42
LRRTM3-202ENST00000472278 FAM223AQ8IWN6 122 aa-0.04□□□□□ -2.42
LRRTM3-202ENST00000472278 DEFB123Q8N688 67 aa-0.04□□□□□ -2.42
LRRTM3-202ENST00000472278 PRO1933Q9H354 126 aa-0.04□□□□□ -2.42
LRRTM3-202ENST00000472278 PRO1854Q9UHT4 67 aa-0.04□□□□□ -2.42
LRRTM3-202ENST00000472278 NRKQ7Z2Y5 1582 aa-0.04□□□□□ -2.42
LRRTM3-202ENST00000472278 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa-0.04□□□□□ -2.42
LRRTM3-202ENST00000472278 MYCBP2O75592 4640 aa-0.04□□□□□ -2.42
LRRTM3-202ENST00000472278 TENM4Q6N022 2769 aa-0.04□□□□□ -2.42
LRRTM3-202ENST00000472278 HMGXB3Q12766 1538 aa-0.04□□□□□ -2.42
LRRTM3-202ENST00000472278 FAM135AQ9P2D6 1515 aa-0.04□□□□□ -2.42
LRRTM3-202ENST00000472278 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
LRRTM3-202ENST00000472278 NSD3Q9BZ95 1437 aa-0.04□□□□□ -2.42
LRRTM3-202ENST00000472278 VWFP04275 2813 aa-0.05□□□□□ -2.42
LRRTM3-202ENST00000472278 CACNA1AO00555 2505 aa-0.05□□□□□ -2.42
LRRTM3-202ENST00000472278 PAPPAQ13219 1627 aa-0.05□□□□□ -2.42
LRRTM3-202ENST00000472278 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa-0.05□□□□□ -2.42
LRRTM3-202ENST00000472278 C12orf57Q99622 126 aa-0.05□□□□□ -2.42
LRRTM3-202ENST00000472278 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa-0.05□□□□□ -2.42
LRRTM3-202ENST00000472278 LPAP08519 4548 aa-0.05□□□□□ -2.42
LRRTM3-202ENST00000472278 PZPP20742 1482 aa-0.05□□□□□ -2.42
LRRTM3-202ENST00000472278 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
LRRTM3-202ENST00000472278 ARHGAP5Q13017 1502 aa-0.06□□□□□ -2.42
LRRTM3-202ENST00000472278 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
LRRTM3-202ENST00000472278 A0A1B0GWA3 101 aa-0.06□□□□□ -2.42
LRRTM3-202ENST00000472278 C20orf202A1L168 122 aa-0.06□□□□□ -2.42
LRRTM3-202ENST00000472278 TMEM262E9PQX1 116 aa-0.06□□□□□ -2.42
LRRTM3-202ENST00000472278 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
LRRTM3-202ENST00000472278 FLNCQ14315 2725 aa-0.06□□□□□ -2.42
LRRTM3-202ENST00000472278 ARHGEF5Q12774 1597 aa-0.06□□□□□ -2.42
LRRTM3-202ENST00000472278 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa-0.06□□□□□ -2.42
LRRTM3-202ENST00000472278 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa-0.07□□□□□ -2.42
LRRTM3-202ENST00000472278 TET3O43151 1660 aa-0.07□□□□□ -2.42
LRRTM3-202ENST00000472278 GAPVD1Q14C86 1478 aa-0.07□□□□□ -2.42
LRRTM3-202ENST00000472278 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
LRRTM3-202ENST00000472278 MRC2Q9UBG0 1479 aa-0.07□□□□□ -2.42
LRRTM3-202ENST00000472278 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa-0.07□□□□□ -2.42
LRRTM3-202ENST00000472278 SNCAP37840 140 aa-0.07□□□□□ -2.42
LRRTM3-202ENST00000472278 HSD52Q0P140 79 aa-0.07□□□□□ -2.42
LRRTM3-202ENST00000472278 FDCSPQ8NFU4 85 aa-0.07□□□□□ -2.42
LRRTM3-202ENST00000472278 CGREF1Q99674 301 aa-0.07□□□□□ -2.42
LRRTM3-202ENST00000472278 LINC00846Q9NV44 126 aa-0.07□□□□□ -2.42
LRRTM3-202ENST00000472278 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa-0.07□□□□□ -2.42
LRRTM3-202ENST00000472278 CHD6Q8TD26 2715 aa-0.07□□□□□ -2.42
LRRTM3-202ENST00000472278 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
LRRTM3-202ENST00000472278 FAT2Q9NYQ8 4349 aa-0.08□□□□□ -2.42
LRRTM3-202ENST00000472278 BTAF1O14981 1849 aa-0.08□□□□□ -2.42
LRRTM3-202ENST00000472278 FAM223BA6NKX1 122 aa-0.08□□□□□ -2.42
LRRTM3-202ENST00000472278 SPRR1BP22528 89 aa-0.08□□□□□ -2.42
LRRTM3-202ENST00000472278 LINC01600Q96MT4 127 aa-0.08□□□□□ -2.42
LRRTM3-202ENST00000472278 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa-0.08□□□□□ -2.42
LRRTM3-202ENST00000472278 TULP4Q9NRJ4 1543 aa-0.08□□□□□ -2.42
LRRTM3-202ENST00000472278 ADGRL2O95490 1459 aa-0.09□□□□□ -2.42
LRRTM3-202ENST00000472278 HSPG2P98160 4391 aa-0.09□□□□□ -2.42
LRRTM3-202ENST00000472278 BSNQ9UPA5 3926 aa-0.09□□□□□ -2.42
LRRTM3-202ENST00000472278 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa-0.09□□□□□ -2.42
LRRTM3-202ENST00000472278 K7EQZ3 153 aa-0.09□□□□□ -2.42
LRRTM3-202ENST00000472278 SPINK4O60575 86 aa-0.09□□□□□ -2.42
LRRTM3-202ENST00000472278 SPRR2DP22532 72 aa-0.09□□□□□ -2.42
LRRTM3-202ENST00000472278 S100PP25815 95 aa-0.09□□□□□ -2.42
LRRTM3-202ENST00000472278 SFTA2Q6UW10 78 aa-0.09□□□□□ -2.42
LRRTM3-202ENST00000472278 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa-0.1□□□□□ -2.42
LRRTM3-202ENST00000472278 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa-0.1□□□□□ -2.43
LRRTM3-202ENST00000472278 hADV29S1A0JD25 119 aa-0.1□□□□□ -2.43
LRRTM3-202ENST00000472278 NDUFC1O43677 76 aa-0.1□□□□□ -2.43
LRRTM3-202ENST00000472278 SEC11AP67812 179 aa-0.1□□□□□ -2.43
LRRTM3-202ENST00000472278 USMG5Q96IX5 58 aa-0.1□□□□□ -2.43
LRRTM3-202ENST00000472278 VAMP8Q9BV40 100 aa-0.1□□□□□ -2.43
LRRTM3-202ENST00000472278 LRP2P98164 4655 aa-0.1□□□□□ -2.43
LRRTM3-202ENST00000472278 C1orf167Q5SNV9 1468 aa-0.1□□□□□ -2.43
LRRTM3-202ENST00000472278 SSPOA2VEC9 5147 aa-0.11□□□□□ -2.43
LRRTM3-202ENST00000472278 DCHS2Q6V1P9 2916 aa-0.11□□□□□ -2.43
LRRTM3-202ENST00000472278 CSPG4Q6UVK1 2322 aa-0.11□□□□□ -2.43
LRRTM3-202ENST00000472278 PRM1P04553 51 aa-0.11□□□□□ -2.43
LRRTM3-202ENST00000472278 COX8AP10176 69 aa-0.11□□□□□ -2.43
LRRTM3-202ENST00000472278 TCEAL7Q9BRU2 100 aa-0.11□□□□□ -2.43
LRRTM3-202ENST00000472278 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa-0.11□□□□□ -2.43
LRRTM3-202ENST00000472278 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP-0.12□□□□□ -2.43
LRRTM3-202ENST00000472278 TOP2BQ02880 1626 aa-0.12□□□□□ -2.43
LRRTM3-202ENST00000472278 TMEM218A2RU14 115 aa-0.12□□□□□ -2.43
LRRTM3-202ENST00000472278 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa-0.12□□□□□ -2.43
LRRTM3-202ENST00000472278 ALMS1Q8TCU4 4167 aa-0.13□□□□□ -2.43
LRRTM3-202ENST00000472278 ABCC5O15440 1437 aa-0.13□□□□□ -2.43
LRRTM3-202ENST00000472278 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa-0.13□□□□□ -2.43
LRRTM3-202ENST00000472278 A0A0G2JMZ2 1700 aa-0.13□□□□□ -2.43
LRRTM3-202ENST00000472278 TSC2P49815 1807 aa-0.13□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.1 ms