RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471650.5

SH3BP1-207, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 900 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-207ENST00000471650 C6orf223Q8N319 242 aa7.18□□□□□ -1.26
SH3BP1-207ENST00000471650 UBE2WQ96B02 151 aa7.18□□□□□ -1.26
SH3BP1-207ENST00000471650 HIST1H2BLQ99880 126 aa7.18□□□□□ -1.26
SH3BP1-207ENST00000471650 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
SH3BP1-207ENST00000471650 NUPR1O60356 82 aa7.17□□□□□ -1.26
SH3BP1-207ENST00000471650 HBDP02042 147 aa7.17□□□□□ -1.26
SH3BP1-207ENST00000471650 CRPP02741 224 aa7.17□□□□□ -1.26
SH3BP1-207ENST00000471650 NPSP0C0P6 89 aa7.17□□□□□ -1.26
SH3BP1-207ENST00000471650 PMCHL1Q16048 86 aa7.17□□□□□ -1.26
SH3BP1-207ENST00000471650 MIAQ16674 131 aa7.17□□□□□ -1.26
SH3BP1-207ENST00000471650 PDZD11Q5EBL8 140 aa7.17□□□□□ -1.26
SH3BP1-207ENST00000471650 Q6ZUT4 128 aa7.17□□□□□ -1.26
SH3BP1-207ENST00000471650 ERASQ7Z444 233 aa7.17□□□□□ -1.26
SH3BP1-207ENST00000471650 NFE4Q86UQ8 179 aa7.17□□□□□ -1.26
SH3BP1-207ENST00000471650 SCGB3A1Q96QR1 104 aa7.17□□□□□ -1.26
SH3BP1-207ENST00000471650 TIMM17AQ99595 171 aa7.17□□□□□ -1.26
SH3BP1-207ENST00000471650 Q9HAA7 133 aa7.17□□□□□ -1.26
SH3BP1-207ENST00000471650 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa7.16□□□□□ -1.26
SH3BP1-207ENST00000471650 HSBP1O75506 76 aa7.16□□□□□ -1.26
SH3BP1-207ENST00000471650 PCP4P48539 62 aa7.16□□□□□ -1.26
SH3BP1-207ENST00000471650 CLPSL2Q6UWE3 100 aa7.16□□□□□ -1.26
SH3BP1-207ENST00000471650 TMEM141Q96I45 108 aa7.16□□□□□ -1.26
SH3BP1-207ENST00000471650 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa7.15□□□□□ -1.26
SH3BP1-207ENST00000471650 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa7.15□□□□□ -1.26
SH3BP1-207ENST00000471650 J3QL48 77 aa7.15□□□□□ -1.26
SH3BP1-207ENST00000471650 EREGO14944 169 aa7.15□□□□□ -1.26
SH3BP1-207ENST00000471650 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SH3BP1-207ENST00000471650 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SH3BP1-207ENST00000471650 FAM19A2Q8N3H0 131 aa7.15□□□□□ -1.26
SH3BP1-207ENST00000471650 RMI2Q96E14 147 aa7.15□□□□□ -1.26
SH3BP1-207ENST00000471650 TM2D2Q9BX73 214 aa7.15□□□□□ -1.26
SH3BP1-207ENST00000471650 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa7.14□□□□□ -1.27
SH3BP1-207ENST00000471650 KRTAP10-2P60368 255 aa7.14□□□□□ -1.27
SH3BP1-207ENST00000471650 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SH3BP1-207ENST00000471650 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa7.14□□□□□ -1.27
SH3BP1-207ENST00000471650 AMELXQ99217 191 aa7.14□□□□□ -1.27
SH3BP1-207ENST00000471650 VCX2Q9H322 139 aa7.14□□□□□ -1.27
SH3BP1-207ENST00000471650 COX11Q9Y6N1 276 aa7.14□□□□□ -1.27
SH3BP1-207ENST00000471650 LRP2P98164 4655 aa7.13□□□□□ -1.27
SH3BP1-207ENST00000471650 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa7.13□□□□□ -1.27
SH3BP1-207ENST00000471650 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SH3BP1-207ENST00000471650 CCL25O15444 150 aa7.13□□□□□ -1.27
SH3BP1-207ENST00000471650 ATP5LO75964 103 aa7.13□□□□□ -1.27
SH3BP1-207ENST00000471650 SS18Q15532 418 aa7.13□□□□□ -1.27
SH3BP1-207ENST00000471650 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa7.13□□□□□ -1.27
SH3BP1-207ENST00000471650 Q6ZN92 141 aa7.13□□□□□ -1.27
SH3BP1-207ENST00000471650 TEX43Q6ZNM6 134 aa7.13□□□□□ -1.27
SH3BP1-207ENST00000471650 SPATA12Q7Z6I5 190 aa7.13□□□□□ -1.27
SH3BP1-207ENST00000471650 C1orf43Q9BWL3 253 aa7.13□□□□□ -1.27
SH3BP1-207ENST00000471650 SNHG12Q9BXW3 62 aa7.13□□□□□ -1.27
SH3BP1-207ENST00000471650 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa7.12□□□□□ -1.27
SH3BP1-207ENST00000471650 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa7.12□□□□□ -1.27
SH3BP1-207ENST00000471650 XGP55808 180 aa7.12□□□□□ -1.27
SH3BP1-207ENST00000471650 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa7.12□□□□□ -1.27
SH3BP1-207ENST00000471650 LINC00173Q6ZV60 143 aa7.12□□□□□ -1.27
SH3BP1-207ENST00000471650 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SH3BP1-207ENST00000471650 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa7.12□□□□□ -1.27
SH3BP1-207ENST00000471650 BAALCQ8WXS3 180 aa7.11□□□□□ -1.27
SH3BP1-207ENST00000471650 CST9LQ9H4G1 147 aa7.11□□□□□ -1.27
SH3BP1-207ENST00000471650 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1-207ENST00000471650 GAGE12HA6NDE8 117 aa7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1-207ENST00000471650 PSCAO43653 123 aa7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1-207ENST00000471650 LEPROTL1O95214 131 aa7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1-207ENST00000471650 UBE2D1P51668 147 aa7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1-207ENST00000471650 PMVKQ15126 192 aa7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1-207ENST00000471650 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1-207ENST00000471650 CD164L2Q6UWJ8 174 aa7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1-207ENST00000471650 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1-207ENST00000471650 IFI27L1Q96BM0 104 aa7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1-207ENST00000471650 XCL1P47992 114 aa7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1-207ENST00000471650 FOXI1Q12951 378 aa7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1-207ENST00000471650 LINC00242Q5T6M2 205 aa7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1-207ENST00000471650 HSPB8Q9UJY1 196 aa7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1-207ENST00000471650 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1-207ENST00000471650 FAT3Q8TDW7 4589 aa7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1-207ENST00000471650 LRCOL1A6NCL2 159 aa7.08□□□□□ -1.28
SH3BP1-207ENST00000471650 PRSS1P07477 247 aa7.08□□□□□ -1.28
SH3BP1-207ENST00000471650 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa7.07□□□□□ -1.28
SH3BP1-207ENST00000471650 A0A0J9YXV3 536 aa7.07□□□□□ -1.28
SH3BP1-207ENST00000471650 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP7.07□□□□□ -1.28
SH3BP1-207ENST00000471650 COX6A2Q02221 97 aa7.07□□□□□ -1.28
SH3BP1-207ENST00000471650 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa7.07□□□□□ -1.28
SH3BP1-207ENST00000471650 MIEN1Q9BRT3 115 aa7.07□□□□□ -1.28
SH3BP1-207ENST00000471650 A0A087WTM6 91 aa7.06□□□□□ -1.28
SH3BP1-207ENST00000471650 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa7.06□□□□□ -1.28
SH3BP1-207ENST00000471650 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa7.06□□□□□ -1.28
SH3BP1-207ENST00000471650 SEC11AP67812 179 aa7.06□□□□□ -1.28
SH3BP1-207ENST00000471650 WFDC2Q14508 124 aa7.06□□□□□ -1.28
SH3BP1-207ENST00000471650 USP17L23D6RBM5 183 aa7.05□□□□□ -1.28
SH3BP1-207ENST00000471650 COX7A2LO14548 114 aa7.05□□□□□ -1.28
SH3BP1-207ENST00000471650 SCGB1D1O95968 90 aa7.05□□□□□ -1.28
SH3BP1-207ENST00000471650 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
SH3BP1-207ENST00000471650 IGLC3P0DOY3 106 aa7.05□□□□□ -1.28
SH3BP1-207ENST00000471650 HERVK_113P63121 156 aa7.05□□□□□ -1.28
SH3BP1-207ENST00000471650 C5orf38Q86SI9 138 aa7.05□□□□□ -1.28
SH3BP1-207ENST00000471650 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
SH3BP1-207ENST00000471650 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
SH3BP1-207ENST00000471650 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1-207ENST00000471650 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1-207ENST00000471650 A0A087WZ39 114 aa7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 93 ms