RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468066.5

CBWD5-215, Transcript of COBW domain containing 5, human

TSL 3

Gene CBWD5, Length 487 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CBWD5-215	ENST00000468066		H3BRM9	83 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CBWD5-215	ENST00000468066		K7EP13	123 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CBWD5-215	ENST00000468066	DLEU1	O43261	78 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CBWD5-215	ENST00000468066	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CBWD5-215	ENST00000468066	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CBWD5-215	ENST00000468066	COX8A	P10176	69 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CBWD5-215	ENST00000468066	SS18	Q15532	418 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CBWD5-215	ENST00000468066	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CBWD5-215	ENST00000468066	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CBWD5-215	ENST00000468066	APLN	Q9ULZ1	77 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CBWD5-215	ENST00000468066	FBN3	Q75N90	2809 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CBWD5-215	ENST00000468066	TG	P01266	2768 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CBWD5-215	ENST00000468066	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CBWD5-215	ENST00000468066	REG3A	Q06141	175 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CBWD5-215	ENST00000468066	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CBWD5-215	ENST00000468066	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CBWD5-215	ENST00000468066	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CBWD5-215	ENST00000468066	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CBWD5-215	ENST00000468066	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CBWD5-215	ENST00000468066	PRO1933	Q9H354	126 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CBWD5-215	ENST00000468066	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CBWD5-215	ENST00000468066	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CBWD5-215	ENST00000468066	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066	LEPROT	O15243	131 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066	SIVA1	O15304	175 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066	COX6A2	Q02221	97 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066	MIA	Q16674	131 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066	SLC25A34	Q6PIV7	304 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066	TENM2	Q9NT68	2774 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066		A0A087WZ39	114 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066	DDT	P30046	118 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066	NMU	P48645	174 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066	C14orf144	Q96I85	54 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066	KLK12	Q9UKR0	248 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066		J3QQQ9	107 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066	IGHV3-30	P01768	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066	IGHV3-33	P01772	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066	CRP	P02741	224 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066	ENHO	Q6UWT2	76 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066	PCP2	Q8IVA1	136 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066	HIGD1B	Q9P298	99 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066	KRTAP19-1	Q8IUB9	90 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066	MUC7	Q8TAX7	377 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066		Q9H8V8	135 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066	PCP4L1	A6NKN8	68 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066	COX7A2L	O14548	114 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066	SPINK8	P0C7L1	97 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066	XCL1	P47992	114 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066	FOXI1	Q12951	378 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066	SFTA2	Q6UW10	78 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066	UBE2W	Q96B02	151 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066	ZNF815P	A8K554	130 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066	NDUFA1	O15239	70 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066	APOM	O95445	188 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066	C2orf91	Q6ZV80	131 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066		Q8IZM0	81 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066	RMI2	Q96E14	147 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066	COX11	Q9Y6N1	276 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066		H3BS24	57 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066	CXCL5	P42830	114 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066	HERV-K104	P63124	156 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066	TAL2	Q16559	108 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066	C5orf38	Q86SI9	138 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066	COX7B2	Q8TF08	81 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CBWD5-215	ENST00000468066	LINC00587	B1AMM8	73 aa		4.83	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms