RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000457356.8

MSC-AS1-201, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene MSC-AS1, Length 4,220 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-201ENST00000457356 KLK12Q9UKR0 248 aa7.26□□□□□ -1.25
MSC-AS1-201ENST00000457356 U3KQK5 164 aa7.26□□□□□ -1.25
MSC-AS1-201ENST00000457356 K7EMT4 169 aa7.26□□□□□ -1.25
MSC-AS1-201ENST00000457356 MP68P56378 58 aa7.26□□□□□ -1.25
MSC-AS1-201ENST00000457356 GPHB5Q86YW7 130 aa7.26□□□□□ -1.25
MSC-AS1-201ENST00000457356 C20orf173Q96LM9 149 aa7.26□□□□□ -1.25
MSC-AS1-201ENST00000457356 LINC00574Q9H8X3 128 aa7.26□□□□□ -1.25
MSC-AS1-201ENST00000457356 SPAG11BQ08648 103 aa7.25□□□□□ -1.25
MSC-AS1-201ENST00000457356 NRACQ8N912 160 aa7.25□□□□□ -1.25
MSC-AS1-201ENST00000457356 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
MSC-AS1-201ENST00000457356 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa7.25□□□□□ -1.25
MSC-AS1-201ENST00000457356 ODF3BA8MYP8 253 aa7.25□□□□□ -1.25
MSC-AS1-201ENST00000457356 USP17L23D6RBM5 183 aa7.25□□□□□ -1.25
MSC-AS1-201ENST00000457356 FAM236CP0DP71 79 aa7.25□□□□□ -1.25
MSC-AS1-201ENST00000457356 Q6ZTI0 123 aa7.25□□□□□ -1.25
MSC-AS1-201ENST00000457356 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
MSC-AS1-201ENST00000457356 FRYLO94915 3013 aa7.24□□□□□ -1.25
MSC-AS1-201ENST00000457356 M0QY20 66 aa7.24□□□□□ -1.25
MSC-AS1-201ENST00000457356 A0A096LNJ9 63 aa7.23□□□□□ -1.25
MSC-AS1-201ENST00000457356 PRM2P04554 102 aa7.23□□□□□ -1.25
MSC-AS1-201ENST00000457356 DIRC1Q969H9 104 aa7.23□□□□□ -1.25
MSC-AS1-201ENST00000457356 SNURFQ9Y675 71 aa7.23□□□□□ -1.25
MSC-AS1-201ENST00000457356 BPY2O14599 106 aa7.23□□□□□ -1.25
MSC-AS1-201ENST00000457356 FHL3Q13643 280 aa7.22□□□□□ -1.25
MSC-AS1-201ENST00000457356 TIRAPP58753 221 aa7.22□□□□□ -1.25
MSC-AS1-201ENST00000457356 SERP2Q8N6R1 65 aa7.22□□□□□ -1.25
MSC-AS1-201ENST00000457356 C16orf74Q96GX8 76 aa7.22□□□□□ -1.25
MSC-AS1-201ENST00000457356 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa7.22□□□□□ -1.25
MSC-AS1-201ENST00000457356 POM121L12Q8N7R1 296 aa7.22□□□□□ -1.25
MSC-AS1-201ENST00000457356 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa7.22□□□□□ -1.25
MSC-AS1-201ENST00000457356 H7C423 109 aa7.22□□□□□ -1.25
MSC-AS1-201ENST00000457356 LST1O00453 97 aa7.22□□□□□ -1.25
MSC-AS1-201ENST00000457356 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
MSC-AS1-201ENST00000457356 ZFAND3Q9H8U3 227 aa7.22□□□□□ -1.25
MSC-AS1-201ENST00000457356 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
MSC-AS1-201ENST00000457356 COX7CP15954 63 aa7.21□□□□□ -1.25
MSC-AS1-201ENST00000457356 PRR9Q5T870 116 aa7.21□□□□□ -1.25
MSC-AS1-201ENST00000457356 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa7.21□□□□□ -1.26
MSC-AS1-201ENST00000457356 NDUFA1O15239 70 aa7.21□□□□□ -1.26
MSC-AS1-201ENST00000457356 C6orf99Q4VX62 202 aa7.21□□□□□ -1.26
MSC-AS1-201ENST00000457356 HRCT1Q6UXD1 115 aa7.21□□□□□ -1.26
MSC-AS1-201ENST00000457356 C4orf3Q8WVX3 66 aa7.21□□□□□ -1.26
MSC-AS1-201ENST00000457356 PRR4Q16378 134 aa7.21□□□□□ -1.26
MSC-AS1-201ENST00000457356 XAGE1AQ9HD64 81 aa7.21□□□□□ -1.26
MSC-AS1-201ENST00000457356 TMEM89A2RUT3 159 aa7.2□□□□□ -1.26
MSC-AS1-201ENST00000457356 LINC00269Q8N2A0 174 aa7.2□□□□□ -1.26
MSC-AS1-201ENST00000457356 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
MSC-AS1-201ENST00000457356 SMIM9A6NGZ8 99 aa7.2□□□□□ -1.26
MSC-AS1-201ENST00000457356 C10orf99Q6UWK7 81 aa7.2□□□□□ -1.26
MSC-AS1-201ENST00000457356 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
MSC-AS1-201ENST00000457356 IMUPQ9GZP8 106 aa7.2□□□□□ -1.26
MSC-AS1-201ENST00000457356 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
MSC-AS1-201ENST00000457356 DEFB135Q30KP9 77 aa7.19□□□□□ -1.26
MSC-AS1-201ENST00000457356 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
MSC-AS1-201ENST00000457356 A0A096LNI7 61 aa7.19□□□□□ -1.26
MSC-AS1-201ENST00000457356 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
MSC-AS1-201ENST00000457356 K7EQG2 157 aa7.19□□□□□ -1.26
MSC-AS1-201ENST00000457356 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
MSC-AS1-201ENST00000457356 A0A087WVE0 104 aa7.19□□□□□ -1.26
MSC-AS1-201ENST00000457356 BRI3O95415 125 aa7.19□□□□□ -1.26
MSC-AS1-201ENST00000457356 PDE6GP18545 87 aa7.19□□□□□ -1.26
MSC-AS1-201ENST00000457356 UNC79Q9P2D8 2635 aa7.19□□□□□ -1.26
MSC-AS1-201ENST00000457356 SPART-AS1P0CW21 52 aa7.18□□□□□ -1.26
MSC-AS1-201ENST00000457356 UBE2D1P51668 147 aa7.18□□□□□ -1.26
MSC-AS1-201ENST00000457356 PRO0461Q9UI25 63 aa7.18□□□□□ -1.26
MSC-AS1-201ENST00000457356 COX7BP24311 80 aa7.18□□□□□ -1.26
MSC-AS1-201ENST00000457356 LINC00526Q96FQ7 95 aa7.18□□□□□ -1.26
MSC-AS1-201ENST00000457356 NDUFB1O75438 58 aa7.17□□□□□ -1.26
MSC-AS1-201ENST00000457356 PRO0255Q9UI72 69 aa7.17□□□□□ -1.26
MSC-AS1-201ENST00000457356 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
MSC-AS1-201ENST00000457356 DCANP1Q8TF63 244 aa7.17□□□□□ -1.26
MSC-AS1-201ENST00000457356 ZNF702PQ9H963 129 aa7.17□□□□□ -1.26
MSC-AS1-201ENST00000457356 MAP6D1Q9H9H5 199 aa7.17□□□□□ -1.26
MSC-AS1-201ENST00000457356 PCSK5Q92824 1860 aa7.17□□□□□ -1.26
MSC-AS1-201ENST00000457356 OXLD1Q5BKU9 147 aa7.17□□□□□ -1.26
MSC-AS1-201ENST00000457356 STAB1Q9NY15 2570 aa7.16□□□□□ -1.26
MSC-AS1-201ENST00000457356 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa7.16□□□□□ -1.26
MSC-AS1-201ENST00000457356 TSHBP01222 138 aa7.16□□□□□ -1.26
MSC-AS1-201ENST00000457356 CXCL5P42830 114 aa7.16□□□□□ -1.26
MSC-AS1-201ENST00000457356 CRYGDP07320 174 aa7.16□□□□□ -1.26
MSC-AS1-201ENST00000457356 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa7.16□□□□□ -1.26
MSC-AS1-201ENST00000457356 Q6ZQY7 126 aa7.16□□□□□ -1.26
MSC-AS1-201ENST00000457356 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa7.16□□□□□ -1.26
MSC-AS1-201ENST00000457356 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa7.15□□□□□ -1.26
MSC-AS1-201ENST00000457356 IGIPA6NJ69 53 aa7.15□□□□□ -1.26
MSC-AS1-201ENST00000457356 H0Y9J4 135 aa7.15□□□□□ -1.26
MSC-AS1-201ENST00000457356 C1orf158Q8N1D5 194 aa7.15□□□□□ -1.26
MSC-AS1-201ENST00000457356 ZNF580Q9UK33 172 aa7.15□□□□□ -1.26
MSC-AS1-201ENST00000457356 V9GYY9 64 aa7.15□□□□□ -1.26
MSC-AS1-201ENST00000457356 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa7.15□□□□□ -1.26
MSC-AS1-201ENST00000457356 C3orf84H3BNL1 204 aa7.15□□□□□ -1.26
MSC-AS1-201ENST00000457356 TIMM17BO60830 172 aa7.15□□□□□ -1.26
MSC-AS1-201ENST00000457356 CCKP06307 115 aa7.15□□□□□ -1.26
MSC-AS1-201ENST00000457356 SMIM11BQ8TCY0 68 aa7.15□□□□□ -1.26
MSC-AS1-201ENST00000457356 REV3LO60673 3130 aa7.15□□□□□ -1.27
MSC-AS1-201ENST00000457356 LRCOL1A6NCL2 159 aa7.15□□□□□ -1.27
MSC-AS1-201ENST00000457356 LY6LH3BQJ8 138 aa7.15□□□□□ -1.27
MSC-AS1-201ENST00000457356 EBI3Q14213 229 aa7.14□□□□□ -1.27
MSC-AS1-201ENST00000457356 RMI2Q96E14 147 aa7.14□□□□□ -1.27
MSC-AS1-201ENST00000457356 TSPEAR-AS2P59090 65 aa7.14□□□□□ -1.27
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