RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 FAUP35544 74 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 SSR2P43308 183 aa2.53□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 CDK5R1Q15078 307 aa2.53□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 SS18Q15532 418 aa2.53□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 MIC13Q5XKP0 118 aa2.53□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 PATE2Q6UY27 113 aa2.53□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 Q6ZQT0 140 aa2.53□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 MORN4Q8NDC4 146 aa2.53□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 OR8B3Q8NGG8 313 aa2.53□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 COPS9Q8WXC6 57 aa2.53□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 TVP23CQ96ET8 276 aa2.53□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 CYSTM1Q9H1C7 97 aa2.53□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 NOTCH3Q9UM47 2321 aa2.53□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa2.53□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 SVEP1Q4LDE5 3571 aa2.53□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 CFAP126Q5VTH2 177 aa2.52□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 C15orf53Q8NAA6 179 aa2.52□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 TAS2R4Q9NYW5 299 aa2.52□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 PRO2289Q9P1D8 64 aa2.52□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 STAB1Q9NY15 2570 aa2.52□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 NUMA1Q14980 2115 aa2.51□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 NINQ8N4C6 2090 aa2.51□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP2.51□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 KRTDAPP60985 99 aa2.51□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 ESRGQ1W209 222 aa2.51□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 SPANXN5Q5MJ07 72 aa2.51□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF826PQ6ZT77 177 aa2.51□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa2.51□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 ODF3Q96PU9 254 aa2.51□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 CXCL16Q9H2A7 254 aa2.51□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 MANBALQ9NQG1 85 aa2.51□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 PLXNA2O75051 1894 aa2.51□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa2.51□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 COL6A5A8TX70 2615 aa2.5□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 CSPG4Q6UVK1 2322 aa2.5□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa2.5□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa2.5□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 E7EQL1 145 aa2.5□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 ATOX1O00244 68 aa2.5□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 IGLV3-19P01714 112 aa2.5□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 HBDP02042 147 aa2.5□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 C3orf79P0CE67 100 aa2.5□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 INSL4Q14641 139 aa2.5□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM155Q4W5P6 130 aa2.5□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 IGFL3Q6UXB1 125 aa2.5□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 Q6ZTI0 123 aa2.5□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 C7orf65Q6ZTY9 151 aa2.5□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 OR5AS1Q8N127 324 aa2.5□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 LINC01600Q96MT4 127 aa2.5□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 BIRC6Q9NR09 4857 aa2.5□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 ACANP16112 2415 aa2.5□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 SHANK1Q9Y566 2161 aa2.49□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa2.49□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 TRAV17A0A0B4J275 112 aa2.49□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 A0A0D9SFI3 127 aa2.49□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 HCRTO43612 131 aa2.49□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 ASAH2BP0C7U1 165 aa2.49□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 SMIM13P0DJ93 91 aa2.49□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 ESPL1Q14674 2120 aa2.49□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 Q8N8P6 123 aa2.49□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 DIRC1Q969H9 104 aa2.49□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 CST11Q9H112 138 aa2.49□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 HIGD1BQ9P298 99 aa2.49□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 MYOFQ9NZM1 2061 aa2.49□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 JMJD1CQ15652 2540 aa2.48□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 TRAV2A0A0B4J234 112 aa2.48□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 TRAV3A0A0B4J244 114 aa2.48□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa2.48□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 A6NN06 94 aa2.48□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa2.48□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 BAALC-AS2P0C853 105 aa2.48□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 COX8AP10176 69 aa2.48□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 MGST1P10620 155 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 EFNA4P52798 201 aa2.48□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP2.48□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 KRTAP10-3P60369 221 aa2.48□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 CCL8P80075 99 aa2.48□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 C5orf38Q86SI9 138 aa2.48□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 TOMM5Q8N4H5 51 aa2.48□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM216BQ8N7L0 139 aa2.48□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 RETNLBQ9BQ08 111 aa2.48□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 LY96Q9Y6Y9 160 aa2.48□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 TGP01266 2768 aa2.48□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 CMYA5Q8N3K9 4069 aa2.47□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa2.47□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa2.47□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 UBE2G1P62253 170 aa2.47□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.6 ms