RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa16.14■□□□□ 0.18
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FAAP20-209ENST00000428120 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa16.14■□□□□ 0.17
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FAAP20-209ENST00000428120 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa15.93■□□□□ 0.14
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FAAP20-209ENST00000428120 SH2D6Q7Z4S9 175 aa15.89■□□□□ 0.13
FAAP20-209ENST00000428120 IGHV3-33P01772 117 aa15.88■□□□□ 0.13
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FAAP20-209ENST00000428120 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
FAAP20-209ENST00000428120 ERG28Q9UKR5 140 aa15.85■□□□□ 0.13
FAAP20-209ENST00000428120 K7EIL1 84 aa15.85■□□□□ 0.13
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FAAP20-209ENST00000428120 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
FAAP20-209ENST00000428120 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa15.84■□□□□ 0.13
FAAP20-209ENST00000428120 Q1RN00 199 aa15.84■□□□□ 0.13
FAAP20-209ENST00000428120 MDFIQ99750 246 aa15.84■□□□□ 0.13
FAAP20-209ENST00000428120 PSMB2P49721 201 aa15.83■□□□□ 0.12
FAAP20-209ENST00000428120 KLK12Q9UKR0 248 aa15.83■□□□□ 0.12
FAAP20-209ENST00000428120 C6orf226Q5I0X4 101 aa15.82■□□□□ 0.12
FAAP20-209ENST00000428120 CD164L2Q6UWJ8 174 aa15.82■□□□□ 0.12
FAAP20-209ENST00000428120 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa15.81■□□□□ 0.12
FAAP20-209ENST00000428120 SCGB1C2P0DMR2 95 aa15.8■□□□□ 0.12
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