RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425989.5

HDLBP-211, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-211ENST00000425989 PCP4L1A6NKN8 68 aa6.55□□□□□ -1.36
HDLBP-211ENST00000425989 LINC00587B1AMM8 73 aa6.55□□□□□ -1.36
HDLBP-211ENST00000425989 J3QQQ9 107 aa6.55□□□□□ -1.36
HDLBP-211ENST00000425989 CRPP02741 224 aa6.55□□□□□ -1.36
HDLBP-211ENST00000425989 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
HDLBP-211ENST00000425989 COX6A2Q02221 97 aa6.55□□□□□ -1.36
HDLBP-211ENST00000425989 APLNQ9ULZ1 77 aa6.55□□□□□ -1.36
HDLBP-211ENST00000425989 DNAH9Q9NYC9 4486 aa6.55□□□□□ -1.36
HDLBP-211ENST00000425989 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa6.54□□□□□ -1.36
HDLBP-211ENST00000425989 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.54□□□□□ -1.36
HDLBP-211ENST00000425989 APOMO95445 188 aa6.54□□□□□ -1.36
HDLBP-211ENST00000425989 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa6.54□□□□□ -1.36
HDLBP-211ENST00000425989 TAL2Q16559 108 aa6.54□□□□□ -1.36
HDLBP-211ENST00000425989 KLK12Q9UKR0 248 aa6.54□□□□□ -1.36
HDLBP-211ENST00000425989 LINC00588Q9Y4M8 146 aa6.54□□□□□ -1.36
HDLBP-211ENST00000425989 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa6.53□□□□□ -1.36
HDLBP-211ENST00000425989 HERV-K104P63124 156 aa6.53□□□□□ -1.36
HDLBP-211ENST00000425989 RMI2Q96E14 147 aa6.53□□□□□ -1.36
HDLBP-211ENST00000425989 COX11Q9Y6N1 276 aa6.53□□□□□ -1.36
HDLBP-211ENST00000425989 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa6.52□□□□□ -1.37
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF815PA8K554 130 aa6.52□□□□□ -1.37
HDLBP-211ENST00000425989 COX7A2LO14548 114 aa6.52□□□□□ -1.37
HDLBP-211ENST00000425989 IGHV3-30P01768 117 aa6.52□□□□□ -1.37
HDLBP-211ENST00000425989 IGHV3-33P01772 117 aa6.52□□□□□ -1.37
HDLBP-211ENST00000425989 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa6.52□□□□□ -1.37
HDLBP-211ENST00000425989 GCSHP23434 173 aa6.52□□□□□ -1.37
HDLBP-211ENST00000425989 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
HDLBP-211ENST00000425989 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
HDLBP-211ENST00000425989 ZFAND6Q6FIF0 208 aa6.52□□□□□ -1.37
HDLBP-211ENST00000425989 ENHOQ6UWT2 76 aa6.52□□□□□ -1.37
HDLBP-211ENST00000425989 Q6ZVH6 145 aa6.52□□□□□ -1.37
HDLBP-211ENST00000425989 WFDC10BQ8IUB3 73 aa6.52□□□□□ -1.37
HDLBP-211ENST00000425989 PCP2Q8IVA1 136 aa6.52□□□□□ -1.37
HDLBP-211ENST00000425989 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
HDLBP-211ENST00000425989 Q9H8V8 135 aa6.52□□□□□ -1.37
HDLBP-211ENST00000425989 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-211ENST00000425989 SMIM1B2RUZ4 78 aa6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-211ENST00000425989 F8WDY8 70 aa6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-211ENST00000425989 M0R143 59 aa6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-211ENST00000425989 MALP21145 153 aa6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-211ENST00000425989 CFAP161Q6P656 301 aa6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-211ENST00000425989 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-211ENST00000425989 UBE2WQ96B02 151 aa6.51□□□□□ -1.37
HDLBP-211ENST00000425989 TIMM17BO60830 172 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-211ENST00000425989 PRSS2P07478 247 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-211ENST00000425989 SPINK8P0C7L1 97 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-211ENST00000425989 CXCL5P42830 114 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-211ENST00000425989 XCL1P47992 114 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-211ENST00000425989 CTAG1AP78358 180 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-211ENST00000425989 SCGB1D4Q6XE38 83 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-211ENST00000425989 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-211ENST00000425989 COX7B2Q8TF08 81 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-211ENST00000425989 COPS9Q8WXC6 57 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-211ENST00000425989 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-211ENST00000425989 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-211ENST00000425989 A0A0J9YXY3 114 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-211ENST00000425989 NDUFA1O15239 70 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-211ENST00000425989 HSD52Q0P140 79 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-211ENST00000425989 FOXI1Q12951 378 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-211ENST00000425989 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-211ENST00000425989 C5orf38Q86SI9 138 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-211ENST00000425989 Q8IZM0 81 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-211ENST00000425989 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-211ENST00000425989 C1orf43Q9BWL3 253 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-211ENST00000425989 TM2D2Q9BX73 214 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-211ENST00000425989 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-211ENST00000425989 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-211ENST00000425989 GAGE12HA6NDE8 117 aa6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-211ENST00000425989 TMEM238C9JI98 176 aa6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-211ENST00000425989 TTC32Q5I0X7 151 aa6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-211ENST00000425989 C2orf91Q6ZV80 131 aa6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-211ENST00000425989 MUC7Q8TAX7 377 aa6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-211ENST00000425989 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.47□□□□□ -1.373e-10■■■■■ 32.5
HDLBP-211ENST00000425989 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.47□□□□□ -1.37
HDLBP-211ENST00000425989 TP73-AS1Q9UF72 201 aa6.47□□□□□ -1.37
HDLBP-211ENST00000425989 COL7A1Q02388 2944 aa6.47□□□□□ -1.37
HDLBP-211ENST00000425989 C3orf84H3BNL1 204 aa6.46□□□□□ -1.38
HDLBP-211ENST00000425989 IFITM1P13164 125 aa6.46□□□□□ -1.38
HDLBP-211ENST00000425989 PTTG1IPP53801 180 aa6.46□□□□□ -1.38
HDLBP-211ENST00000425989 CKS1BP61024 79 aa6.46□□□□□ -1.38
HDLBP-211ENST00000425989 CLPSL2Q6UWE3 100 aa6.46□□□□□ -1.38
HDLBP-211ENST00000425989 HIST1H4GQ99525 98 aa6.46□□□□□ -1.38
HDLBP-211ENST00000425989 STAB2Q8WWQ8 2551 aa6.46□□□□□ -1.38
HDLBP-211ENST00000425989 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-211ENST00000425989 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-211ENST00000425989 A6NJY4 79 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-211ENST00000425989 TSPEAR-AS2P59090 65 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-211ENST00000425989 COX17Q14061 63 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-211ENST00000425989 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-211ENST00000425989 Q8N3U1 123 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-211ENST00000425989 ORAOV1Q8WV07 137 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-211ENST00000425989 TTTY13Q9BZ97 58 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-211ENST00000425989 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-211ENST00000425989 A6NDN8 102 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-211ENST00000425989 CEND1Q8N111 149 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-211ENST00000425989 C2orf48Q96LS8 159 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-211ENST00000425989 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-211ENST00000425989 SPANXCQ9NY87 97 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-211ENST00000425989 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.44□□□□□ -1.38
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