RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412161.1

SYNE1-AS1-201, SYNE1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SYNE1-AS1, Length 553 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OR10D4PQ8NGN7 298 aa5.54□□□□□ -1.52
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TMEM141Q96I45 108 aa5.54□□□□□ -1.52
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C2orf88Q9BSF0 95 aa5.54□□□□□ -1.52
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LINC00474Q9P2X8 69 aa5.54□□□□□ -1.52
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa5.53□□□□□ -1.52
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa5.53□□□□□ -1.52
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SEC11AP67812 179 aa5.53□□□□□ -1.52
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C2orf66Q6UXQ4 117 aa5.53□□□□□ -1.52
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TEX43Q6ZNM6 134 aa5.53□□□□□ -1.52
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SDIM1Q6ZPB5 146 aa5.53□□□□□ -1.52
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LINC01561Q8N1V8 128 aa5.53□□□□□ -1.52
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C2orf48Q96LS8 159 aa5.53□□□□□ -1.52
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TIMM17AQ99595 171 aa5.53□□□□□ -1.52
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FAM30AQ9NZY2 134 aa5.53□□□□□ -1.52
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa5.52□□□□□ -1.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa5.52□□□□□ -1.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LINC01546A6NGU7 62 aa5.52□□□□□ -1.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa5.52□□□□□ -1.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CARD19Q96LW7 228 aa5.52□□□□□ -1.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa5.51□□□□□ -1.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa5.51□□□□□ -1.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SYCNQ0VAF6 134 aa5.51□□□□□ -1.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FABP9Q0Z7S8 132 aa5.51□□□□□ -1.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LINC01620Q4KN68 170 aa5.51□□□□□ -1.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HIGD2BQ4VC39 106 aa5.51□□□□□ -1.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa5.51□□□□□ -1.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa5.51□□□□□ -1.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TOMM6Q96B49 74 aa5.51□□□□□ -1.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 VCX2Q9H322 139 aa5.51□□□□□ -1.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IGIPA6NJ69 53 aa5.5□□□□□ -1.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLPIP03973 132 aa5.5□□□□□ -1.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RNF151Q2KHN1 245 aa5.5□□□□□ -1.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FA2HQ7L5A8 372 aa5.5□□□□□ -1.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ERASQ7Z444 233 aa5.5□□□□□ -1.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FAM104AQ969W3 186 aa5.5□□□□□ -1.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 AMELXQ99217 191 aa5.5□□□□□ -1.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SMCO4Q9NRQ5 59 aa5.5□□□□□ -1.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 A0A087WZ39 114 aa5.49□□□□□ -1.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 UBE2D1P51668 147 aa5.49□□□□□ -1.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RAB5BP61020 215 aa5.49□□□□□ -1.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HERVK_113P63121 156 aa5.49□□□□□ -1.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SPAG11BQ08648 103 aa5.49□□□□□ -1.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KIAA1644Q3SXP7 199 aa5.49□□□□□ -1.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SPACA4Q8TDM5 124 aa5.49□□□□□ -1.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CAMK2N2Q96S95 79 aa5.49□□□□□ -1.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa5.49□□□□□ -1.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa5.48□□□□□ -1.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NDUFA1O15239 70 aa5.48□□□□□ -1.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 INAFM2P0DMQ5 153 aa5.48□□□□□ -1.53
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C5orf38Q86SI9 138 aa5.48□□□□□ -1.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa5.48□□□□□ -1.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PLAC8Q9NZF1 115 aa5.48□□□□□ -1.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HAMPP81172 84 aa5.47□□□□□ -1.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 COX6A2Q02221 97 aa5.47□□□□□ -1.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LINC00173Q6ZV60 143 aa5.47□□□□□ -1.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C7orf33Q8WU49 177 aa5.47□□□□□ -1.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ORAOV1Q8WV07 137 aa5.47□□□□□ -1.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SCGB3A1Q96QR1 104 aa5.47□□□□□ -1.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa5.46□□□□□ -1.54
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C18orf32Q8TCD1 76 aa5.46□□□□□ -1.54
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 A0A087WYN8 130 aa5.45□□□□□ -1.54
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HBDP02042 147 aa5.45□□□□□ -1.54
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LINC00614P0C842 121 aa5.45□□□□□ -1.54
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TLX1NBP0CAT3 122 aa5.45□□□□□ -1.54
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CXCL5P42830 114 aa5.45□□□□□ -1.54
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MAJINQ3KP22 176 aa5.45□□□□□ -1.54
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 Q6ZRU5 148 aa5.45□□□□□ -1.54
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DPH3Q96FX2 82 aa5.45□□□□□ -1.54
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 YPEL4Q96NS1 127 aa5.45□□□□□ -1.54
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa5.45□□□□□ -1.54
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.45□□□□□ -1.54
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MYCBP2O75592 4640 aa5.44□□□□□ -1.54
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa5.44□□□□□ -1.54
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 A0A096LNI7 61 aa5.44□□□□□ -1.54
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa5.44□□□□□ -1.54
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa5.44□□□□□ -1.54
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ATP5LO75964 103 aa5.44□□□□□ -1.54
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PRSS2P07478 247 aa5.44□□□□□ -1.54
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PTTG1IPP53801 180 aa5.44□□□□□ -1.54
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PMVKQ15126 192 aa5.44□□□□□ -1.54
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 Q8IZM0 81 aa5.44□□□□□ -1.54
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 H3BRM9 83 aa5.43□□□□□ -1.54
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PANO1I0J062 215 aa5.43□□□□□ -1.54
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CHTF8P0CG12 524 aa5.43□□□□□ -1.54
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ODF1Q14990 250 aa5.43□□□□□ -1.54
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