RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 SEC11AP67812 179 aa9.99□□□□□ -0.81
PGGT1B-202ENST00000379615 C5orf38Q86SI9 138 aa9.99□□□□□ -0.81
PGGT1B-202ENST00000379615 AMELXQ99217 191 aa9.99□□□□□ -0.81
PGGT1B-202ENST00000379615 LRP1BQ9NZR2 4599 aa9.99□□□□□ -0.81
PGGT1B-202ENST00000379615 HSPG2P98160 4391 aa9.98□□□□□ -0.81
PGGT1B-202ENST00000379615 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa9.98□□□□□ -0.81
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PGGT1B-202ENST00000379615 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa9.97□□□□□ -0.81
PGGT1B-202ENST00000379615 UBE2D1P51668 147 aa9.97□□□□□ -0.81
PGGT1B-202ENST00000379615 LINC00242Q5T6M2 205 aa9.97□□□□□ -0.81
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PGGT1B-202ENST00000379615 XGP55808 180 aa9.96□□□□□ -0.82
PGGT1B-202ENST00000379615 Q6ZSA8 131 aa9.96□□□□□ -0.82
PGGT1B-202ENST00000379615 PKIGQ9Y2B9 76 aa9.96□□□□□ -0.82
PGGT1B-202ENST00000379615 DNAH5Q8TE73 4624 aa9.95□□□□□ -0.82
PGGT1B-202ENST00000379615 COLCA2A8K830 154 aa9.95□□□□□ -0.82
PGGT1B-202ENST00000379615 TRGC2P03986 189 aa9.95□□□□□ -0.82
PGGT1B-202ENST00000379615 LINC00173Q6ZV60 143 aa9.95□□□□□ -0.82
PGGT1B-202ENST00000379615 OR10D4PQ8NGN7 298 aa9.95□□□□□ -0.82
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PGGT1B-202ENST00000379615 LINC01561Q8N1V8 128 aa9.94□□□□□ -0.82
PGGT1B-202ENST00000379615 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa9.94□□□□□ -0.82
PGGT1B-202ENST00000379615 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
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PGGT1B-202ENST00000379615 F8WDY8 70 aa9.93□□□□□ -0.82
PGGT1B-202ENST00000379615 HERVK_113P63121 156 aa9.93□□□□□ -0.82
PGGT1B-202ENST00000379615 SYCNQ0VAF6 134 aa9.93□□□□□ -0.82
PGGT1B-202ENST00000379615 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa9.93□□□□□ -0.82
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa9.93□□□□□ -0.82
PGGT1B-202ENST00000379615 C2orf48Q96LS8 159 aa9.93□□□□□ -0.82
PGGT1B-202ENST00000379615 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa9.92□□□□□ -0.82
PGGT1B-202ENST00000379615 ATP5LO75964 103 aa9.92□□□□□ -0.82
PGGT1B-202ENST00000379615 SPAG11BQ08648 103 aa9.92□□□□□ -0.82
PGGT1B-202ENST00000379615 PMVKQ15126 192 aa9.92□□□□□ -0.82
PGGT1B-202ENST00000379615 ORAOV1Q8WV07 137 aa9.92□□□□□ -0.82
PGGT1B-202ENST00000379615 CARD19Q96LW7 228 aa9.92□□□□□ -0.82
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PGGT1B-202ENST00000379615 Q8N1X5 172 aa9.91□□□□□ -0.82
PGGT1B-202ENST00000379615 LINC00526Q96FQ7 95 aa9.91□□□□□ -0.82
PGGT1B-202ENST00000379615 CST9LQ9H4G1 147 aa9.91□□□□□ -0.82
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A096LNJ9 63 aa9.9□□□□□ -0.82
PGGT1B-202ENST00000379615 PMCHL1Q16048 86 aa9.9□□□□□ -0.82
PGGT1B-202ENST00000379615 DPH3Q96FX2 82 aa9.9□□□□□ -0.82
PGGT1B-202ENST00000379615 HSBP1O75506 76 aa9.89□□□□□ -0.83
PGGT1B-202ENST00000379615 SCO1O75880 301 aa9.89□□□□□ -0.83
PGGT1B-202ENST00000379615 NDUFA6P56556 154 aa9.89□□□□□ -0.83
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PGGT1B-202ENST00000379615 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A0J9YXV3 536 aa9.88□□□□□ -0.83
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PGGT1B-202ENST00000379615 PRSS2P07478 247 aa9.88□□□□□ -0.83
PGGT1B-202ENST00000379615 S100A1P23297 94 aa9.88□□□□□ -0.83
PGGT1B-202ENST00000379615 LINC00474Q9P2X8 69 aa9.88□□□□□ -0.83
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PGGT1B-202ENST00000379615 NDUFA1O15239 70 aa9.87□□□□□ -0.83
PGGT1B-202ENST00000379615 HAMPP81172 84 aa9.87□□□□□ -0.83
PGGT1B-202ENST00000379615 RNF151Q2KHN1 245 aa9.87□□□□□ -0.83
PGGT1B-202ENST00000379615 SCXQ7RTU7 201 aa9.87□□□□□ -0.83
PGGT1B-202ENST00000379615 LINC00469Q8N7U9 141 aa9.87□□□□□ -0.83
PGGT1B-202ENST00000379615 EPM2AB3EWF7 344 aa9.86□□□□□ -0.83
PGGT1B-202ENST00000379615 Q6ZRU5 148 aa9.86□□□□□ -0.83
PGGT1B-202ENST00000379615 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa9.86□□□□□ -0.83
PGGT1B-202ENST00000379615 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa9.86□□□□□ -0.83
PGGT1B-202ENST00000379615 H3BRM9 83 aa9.85□□□□□ -0.83
PGGT1B-202ENST00000379615 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
PGGT1B-202ENST00000379615 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
PGGT1B-202ENST00000379615 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
PGGT1B-202ENST00000379615 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa9.84□□□□□ -0.83
PGGT1B-202ENST00000379615 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa9.84□□□□□ -0.83
PGGT1B-202ENST00000379615 SERF1AO75920 110 aa9.84□□□□□ -0.83
PGGT1B-202ENST00000379615 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
PGGT1B-202ENST00000379615 C6orf226Q5I0X4 101 aa9.84□□□□□ -0.83
PGGT1B-202ENST00000379615 IFI27L1Q96BM0 104 aa9.84□□□□□ -0.83
PGGT1B-202ENST00000379615 CKS1BP61024 79 aa9.83□□□□□ -0.84
PGGT1B-202ENST00000379615 KIAA0087Q14695 138 aa9.83□□□□□ -0.84
PGGT1B-202ENST00000379615 Q8IZM0 81 aa9.83□□□□□ -0.84
PGGT1B-202ENST00000379615 SPACA4Q8TDM5 124 aa9.83□□□□□ -0.84
PGGT1B-202ENST00000379615 TOMM7Q9P0U1 55 aa9.83□□□□□ -0.84
PGGT1B-202ENST00000379615 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa9.82□□□□□ -0.84
PGGT1B-202ENST00000379615 IGLC3P0DOY3 106 aa9.82□□□□□ -0.84
PGGT1B-202ENST00000379615 MAJINQ3KP22 176 aa9.82□□□□□ -0.84
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM19A2Q8N3H0 131 aa9.82□□□□□ -0.84
PGGT1B-202ENST00000379615 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa9.81□□□□□ -0.84
PGGT1B-202ENST00000379615 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa9.81□□□□□ -0.84
PGGT1B-202ENST00000379615 CHTF8P0CG12 524 aa9.81□□□□□ -0.84
PGGT1B-202ENST00000379615 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa9.81□□□□□ -0.84
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A087WYN8 130 aa9.8□□□□□ -0.84
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A096LNI7 61 aa9.8□□□□□ -0.84
PGGT1B-202ENST00000379615 SMIM1B2RUZ4 78 aa9.8□□□□□ -0.84
PGGT1B-202ENST00000379615 PANO1I0J062 215 aa9.8□□□□□ -0.84
PGGT1B-202ENST00000379615 LEPROTL1O95214 131 aa9.8□□□□□ -0.84
PGGT1B-202ENST00000379615 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
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