RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362821.1

RN7SKP173-201, Transcript of RNA, 7SK small nuclear pseudogene 173, humanhuman

BASIC

Gene RN7SKP173, Length 315 nt, Biotype misc RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RN7SKP173-201ENST00000362821 COX8AP10176 69 aa5.88□□□□□ -1.47
RN7SKP173-201ENST00000362821 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
RN7SKP173-201ENST00000362821 COX6A2Q02221 97 aa5.88□□□□□ -1.47
RN7SKP173-201ENST00000362821 MIAQ16674 131 aa5.88□□□□□ -1.47
RN7SKP173-201ENST00000362821 ZFAND6Q6FIF0 208 aa5.88□□□□□ -1.47
RN7SKP173-201ENST00000362821 MUC7Q8TAX7 377 aa5.88□□□□□ -1.47
RN7SKP173-201ENST00000362821 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
RN7SKP173-201ENST00000362821 PLEKHB2Q96CS7 222 aa5.88□□□□□ -1.47
RN7SKP173-201ENST00000362821 MIEN1Q9BRT3 115 aa5.88□□□□□ -1.47
RN7SKP173-201ENST00000362821 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
RN7SKP173-201ENST00000362821 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa5.87□□□□□ -1.47
RN7SKP173-201ENST00000362821 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa5.87□□□□□ -1.47
RN7SKP173-201ENST00000362821 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa5.87□□□□□ -1.47
RN7SKP173-201ENST00000362821 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa5.87□□□□□ -1.47
RN7SKP173-201ENST00000362821 LEPROTO15243 131 aa5.87□□□□□ -1.47
RN7SKP173-201ENST00000362821 SPINK8P0C7L1 97 aa5.87□□□□□ -1.47
RN7SKP173-201ENST00000362821 CD164L2Q6UWJ8 174 aa5.87□□□□□ -1.47
RN7SKP173-201ENST00000362821 C10orf126Q8N4M7 172 aa5.87□□□□□ -1.47
RN7SKP173-201ENST00000362821 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa5.87□□□□□ -1.47
RN7SKP173-201ENST00000362821 A0A087WZ39 114 aa5.86□□□□□ -1.47
RN7SKP173-201ENST00000362821 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa5.86□□□□□ -1.47
RN7SKP173-201ENST00000362821 SMIM1B2RUZ4 78 aa5.86□□□□□ -1.47
RN7SKP173-201ENST00000362821 J3QQQ9 107 aa5.86□□□□□ -1.47
RN7SKP173-201ENST00000362821 COX7A2LO14548 114 aa5.86□□□□□ -1.47
RN7SKP173-201ENST00000362821 DLEU1O43261 78 aa5.86□□□□□ -1.47
RN7SKP173-201ENST00000362821 DDTP30046 118 aa5.86□□□□□ -1.47
RN7SKP173-201ENST00000362821 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
RN7SKP173-201ENST00000362821 ENHOQ6UWT2 76 aa5.86□□□□□ -1.47
RN7SKP173-201ENST00000362821 PCP2Q8IVA1 136 aa5.86□□□□□ -1.47
RN7SKP173-201ENST00000362821 Q9H8V8 135 aa5.86□□□□□ -1.47
RN7SKP173-201ENST00000362821 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa5.85□□□□□ -1.47
RN7SKP173-201ENST00000362821 GAGE12HA6NDE8 117 aa5.85□□□□□ -1.47
RN7SKP173-201ENST00000362821 ZNF815PA8K554 130 aa5.85□□□□□ -1.47
RN7SKP173-201ENST00000362821 K7EP13 123 aa5.85□□□□□ -1.47
RN7SKP173-201ENST00000362821 MALP21145 153 aa5.85□□□□□ -1.47
RN7SKP173-201ENST00000362821 C5orf38Q86SI9 138 aa5.85□□□□□ -1.47
RN7SKP173-201ENST00000362821 BOD1L2Q8IYS8 172 aa5.85□□□□□ -1.47
RN7SKP173-201ENST00000362821 C1orf43Q9BWL3 253 aa5.85□□□□□ -1.47
RN7SKP173-201ENST00000362821 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa5.84□□□□□ -1.47
RN7SKP173-201ENST00000362821 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa5.84□□□□□ -1.47
RN7SKP173-201ENST00000362821 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa5.84□□□□□ -1.47
RN7SKP173-201ENST00000362821 TSPEAR-AS2P59090 65 aa5.84□□□□□ -1.47
RN7SKP173-201ENST00000362821 LINC01561Q8N1V8 128 aa5.84□□□□□ -1.47
RN7SKP173-201ENST00000362821 RMI2Q96E14 147 aa5.84□□□□□ -1.47
RN7SKP173-201ENST00000362821 TTTY13Q9BZ97 58 aa5.84□□□□□ -1.47
RN7SKP173-201ENST00000362821 Q9HAA7 133 aa5.84□□□□□ -1.47
RN7SKP173-201ENST00000362821 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa5.83□□□□□ -1.48
RN7SKP173-201ENST00000362821 APOMO95445 188 aa5.83□□□□□ -1.48
RN7SKP173-201ENST00000362821 PRSS2P07478 247 aa5.83□□□□□ -1.48
RN7SKP173-201ENST00000362821 FOXI1Q12951 378 aa5.83□□□□□ -1.48
RN7SKP173-201ENST00000362821 TTC32Q5I0X7 151 aa5.83□□□□□ -1.48
RN7SKP173-201ENST00000362821 SCGB1D4Q6XE38 83 aa5.83□□□□□ -1.48
RN7SKP173-201ENST00000362821 TOMM7Q9P0U1 55 aa5.83□□□□□ -1.48
RN7SKP173-201ENST00000362821 TP73-AS1Q9UF72 201 aa5.83□□□□□ -1.48
RN7SKP173-201ENST00000362821 NDUFA12Q9UI09 145 aa5.83□□□□□ -1.48
RN7SKP173-201ENST00000362821 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa5.82□□□□□ -1.48
RN7SKP173-201ENST00000362821 COX7B2Q8TF08 81 aa5.82□□□□□ -1.48
RN7SKP173-201ENST00000362821 C3orf84H3BNL1 204 aa5.81□□□□□ -1.48
RN7SKP173-201ENST00000362821 NDUFA1O15239 70 aa5.81□□□□□ -1.48
RN7SKP173-201ENST00000362821 CFAP161Q6P656 301 aa5.81□□□□□ -1.48
RN7SKP173-201ENST00000362821 SFTA2Q6UW10 78 aa5.81□□□□□ -1.48
RN7SKP173-201ENST00000362821 C2orf91Q6ZV80 131 aa5.81□□□□□ -1.48
RN7SKP173-201ENST00000362821 ORAOV1Q8WV07 137 aa5.81□□□□□ -1.48
RN7SKP173-201ENST00000362821 HIGD1BQ9P298 99 aa5.81□□□□□ -1.48
RN7SKP173-201ENST00000362821 COX11Q9Y6N1 276 aa5.81□□□□□ -1.48
RN7SKP173-201ENST00000362821 HERV-K104P63124 156 aa5.8□□□□□ -1.48
RN7SKP173-201ENST00000362821 CTAG1AP78358 180 aa5.8□□□□□ -1.48
RN7SKP173-201ENST00000362821 C6orf226Q5I0X4 101 aa5.8□□□□□ -1.48
RN7SKP173-201ENST00000362821 Q8IZM0 81 aa5.8□□□□□ -1.48
RN7SKP173-201ENST00000362821 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa5.79□□□□□ -1.48
RN7SKP173-201ENST00000362821 LINC00587B1AMM8 73 aa5.79□□□□□ -1.48
RN7SKP173-201ENST00000362821 CXCL5P42830 114 aa5.79□□□□□ -1.48
RN7SKP173-201ENST00000362821 CKS1BP61024 79 aa5.79□□□□□ -1.48
RN7SKP173-201ENST00000362821 SPAG11BQ08648 103 aa5.79□□□□□ -1.48
RN7SKP173-201ENST00000362821 CASC10Q5T4H9 136 aa5.79□□□□□ -1.48
RN7SKP173-201ENST00000362821 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa5.79□□□□□ -1.48
RN7SKP173-201ENST00000362821 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
RN7SKP173-201ENST00000362821 TM2D2Q9BX73 214 aa5.79□□□□□ -1.48
RN7SKP173-201ENST00000362821 A0A0J9YXY3 114 aa5.78□□□□□ -1.48
RN7SKP173-201ENST00000362821 TMEM238C9JI98 176 aa5.78□□□□□ -1.48
RN7SKP173-201ENST00000362821 M0R143 59 aa5.78□□□□□ -1.48
RN7SKP173-201ENST00000362821 HSD52Q0P140 79 aa5.78□□□□□ -1.48
RN7SKP173-201ENST00000362821 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
RN7SKP173-201ENST00000362821 MEIG1Q5JSS6 88 aa5.78□□□□□ -1.48
RN7SKP173-201ENST00000362821 HIST1H4GQ99525 98 aa5.78□□□□□ -1.48
RN7SKP173-201ENST00000362821 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa5.78□□□□□ -1.48
RN7SKP173-201ENST00000362821 PSCAO43653 123 aa5.77□□□□□ -1.49
RN7SKP173-201ENST00000362821 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP5.77□□□□□ -1.49
RN7SKP173-201ENST00000362821 TAL2Q16559 108 aa5.77□□□□□ -1.49
RN7SKP173-201ENST00000362821 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
RN7SKP173-201ENST00000362821 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa5.76□□□□□ -1.49
RN7SKP173-201ENST00000362821 TIMM17BO60830 172 aa5.76□□□□□ -1.49
RN7SKP173-201ENST00000362821 LY6G6CO95867 125 aa5.76□□□□□ -1.49
RN7SKP173-201ENST00000362821 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
RN7SKP173-201ENST00000362821 TGP01266 2768 aa5.76□□□□□ -1.49
RN7SKP173-201ENST00000362821 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
RN7SKP173-201ENST00000362821 GCSHP23434 173 aa5.75□□□□□ -1.49
RN7SKP173-201ENST00000362821 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
RN7SKP173-201ENST00000362821 KIAA0087Q14695 138 aa5.75□□□□□ -1.49
RN7SKP173-201ENST00000362821 BATFQ16520 125 aa5.75□□□□□ -1.49
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