RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa4.98□□□□□ -1.61
SGMS1-201ENST00000361543 C1orf196B1AJZ1 125 aa4.98□□□□□ -1.61
SGMS1-201ENST00000361543 PRSS1P07477 247 aa4.98□□□□□ -1.61
SGMS1-201ENST00000361543 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
SGMS1-201ENST00000361543 SS18Q15532 418 aa4.98□□□□□ -1.61
SGMS1-201ENST00000361543 Q6ZN92 141 aa4.98□□□□□ -1.61
SGMS1-201ENST00000361543 FA2HQ7L5A8 372 aa4.98□□□□□ -1.61
SGMS1-201ENST00000361543 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
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SGMS1-201ENST00000361543 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa4.98□□□□□ -1.61
SGMS1-201ENST00000361543 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa4.98□□□□□ -1.61
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SGMS1-201ENST00000361543 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa4.96□□□□□ -1.62
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SGMS1-201ENST00000361543 C2orf66Q6UXQ4 117 aa4.96□□□□□ -1.62
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SGMS1-201ENST00000361543 S100A1P23297 94 aa4.95□□□□□ -1.62
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SGMS1-201ENST00000361543 CD164L2Q6UWJ8 174 aa4.95□□□□□ -1.62
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SGMS1-201ENST00000361543 C9orf163Q8N9P6 203 aa4.95□□□□□ -1.62
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SGMS1-201ENST00000361543 IFITM10A6NMD0 228 aa4.94□□□□□ -1.62
SGMS1-201ENST00000361543 COLCA2A8K830 154 aa4.94□□□□□ -1.62
SGMS1-201ENST00000361543 APOMO95445 188 aa4.94□□□□□ -1.62
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SGMS1-201ENST00000361543 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa4.93□□□□□ -1.62
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SGMS1-201ENST00000361543 LINC00614P0C842 121 aa4.93□□□□□ -1.62
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SGMS1-201ENST00000361543 C18orf32Q8TCD1 76 aa4.93□□□□□ -1.62
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SGMS1-201ENST00000361543 FOXI1Q12951 378 aa4.92□□□□□ -1.62
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SGMS1-201ENST00000361543 UBR4Q5T4S7 5183 aa4.92□□□□□ -1.62
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SGMS1-201ENST00000361543 TRGC2P03986 189 aa4.91□□□□□ -1.62
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
SGMS1-201ENST00000361543 HIGD2BQ4VC39 106 aa4.91□□□□□ -1.62
SGMS1-201ENST00000361543 SDIM1Q6ZPB5 146 aa4.91□□□□□ -1.62
SGMS1-201ENST00000361543 LINC01561Q8N1V8 128 aa4.91□□□□□ -1.62
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SGMS1-201ENST00000361543 CHTF8P0CG12 524 aa4.89□□□□□ -1.63
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SGMS1-201ENST00000361543 LINC00242Q5T6M2 205 aa4.88□□□□□ -1.63
SGMS1-201ENST00000361543 C2orf48Q96LS8 159 aa4.88□□□□□ -1.63
SGMS1-201ENST00000361543 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
SGMS1-201ENST00000361543 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
SGMS1-201ENST00000361543 CST9LQ9H4G1 147 aa4.88□□□□□ -1.63
SGMS1-201ENST00000361543 HSPB8Q9UJY1 196 aa4.88□□□□□ -1.63
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