RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345015.4

KCNQ1-203, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene KCNQ1, Length 304 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-203ENST00000345015 MALP21145 153 aa7.9□□□□□ -1.14
KCNQ1-203ENST00000345015 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP7.9□□□□□ -1.14
KCNQ1-203ENST00000345015 FA2HQ7L5A8 372 aa7.9□□□□□ -1.14
KCNQ1-203ENST00000345015 OR10D4PQ8NGN7 298 aa7.9□□□□□ -1.14
KCNQ1-203ENST00000345015 CHAC1Q9BUX1 264 aa7.9□□□□□ -1.14
KCNQ1-203ENST00000345015 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa7.9□□□□□ -1.14
KCNQ1-203ENST00000345015 VCX2Q9H322 139 aa7.9□□□□□ -1.14
KCNQ1-203ENST00000345015 ABCA13Q86UQ4 5058 aa7.9□□□□□ -1.14
KCNQ1-203ENST00000345015 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa7.89□□□□□ -1.15
KCNQ1-203ENST00000345015 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
KCNQ1-203ENST00000345015 SDIM1Q6ZPB5 146 aa7.89□□□□□ -1.15
KCNQ1-203ENST00000345015 C2orf48Q96LS8 159 aa7.89□□□□□ -1.15
KCNQ1-203ENST00000345015 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
KCNQ1-203ENST00000345015 FAT1Q14517 4588 aa7.88□□□□□ -1.15
KCNQ1-203ENST00000345015 A0A087WZ39 114 aa7.88□□□□□ -1.15
KCNQ1-203ENST00000345015 LINC00614P0C842 121 aa7.88□□□□□ -1.15
KCNQ1-203ENST00000345015 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa7.88□□□□□ -1.15
KCNQ1-203ENST00000345015 C18orf32Q8TCD1 76 aa7.88□□□□□ -1.15
KCNQ1-203ENST00000345015 LINC00474Q9P2X8 69 aa7.88□□□□□ -1.15
KCNQ1-203ENST00000345015 SLPIP03973 132 aa7.87□□□□□ -1.15
KCNQ1-203ENST00000345015 UBE2D1P51668 147 aa7.87□□□□□ -1.15
KCNQ1-203ENST00000345015 RNF151Q2KHN1 245 aa7.87□□□□□ -1.15
KCNQ1-203ENST00000345015 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
KCNQ1-203ENST00000345015 LINC00242Q5T6M2 205 aa7.87□□□□□ -1.15
KCNQ1-203ENST00000345015 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
KCNQ1-203ENST00000345015 HERVK_113P63121 156 aa7.86□□□□□ -1.15
KCNQ1-203ENST00000345015 SCGB3A1Q96QR1 104 aa7.86□□□□□ -1.15
KCNQ1-203ENST00000345015 FAM30AQ9NZY2 134 aa7.86□□□□□ -1.15
KCNQ1-203ENST00000345015 FAM229AH3BQW9 127 aa7.85□□□□□ -1.15
KCNQ1-203ENST00000345015 SYCNQ0VAF6 134 aa7.85□□□□□ -1.15
KCNQ1-203ENST00000345015 LINC00173Q6ZV60 143 aa7.85□□□□□ -1.15
KCNQ1-203ENST00000345015 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
KCNQ1-203ENST00000345015 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa7.84□□□□□ -1.15
KCNQ1-203ENST00000345015 EPM2AB3EWF7 344 aa7.84□□□□□ -1.15
KCNQ1-203ENST00000345015 HIGD2BQ4VC39 106 aa7.84□□□□□ -1.15
KCNQ1-203ENST00000345015 C5orf38Q86SI9 138 aa7.84□□□□□ -1.15
KCNQ1-203ENST00000345015 CARD19Q96LW7 228 aa7.84□□□□□ -1.15
KCNQ1-203ENST00000345015 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
KCNQ1-203ENST00000345015 HBDP02042 147 aa7.83□□□□□ -1.16
KCNQ1-203ENST00000345015 SCXQ7RTU7 201 aa7.83□□□□□ -1.16
KCNQ1-203ENST00000345015 CBLN2Q8IUK8 224 aa7.83□□□□□ -1.16
KCNQ1-203ENST00000345015 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
KCNQ1-203ENST00000345015 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa7.82□□□□□ -1.16
KCNQ1-203ENST00000345015 ATP5LO75964 103 aa7.82□□□□□ -1.16
KCNQ1-203ENST00000345015 PMVKQ15126 192 aa7.82□□□□□ -1.16
KCNQ1-203ENST00000345015 LINC01620Q4KN68 170 aa7.82□□□□□ -1.16
KCNQ1-203ENST00000345015 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa7.82□□□□□ -1.16
KCNQ1-203ENST00000345015 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa7.81□□□□□ -1.16
KCNQ1-203ENST00000345015 SPAG11BQ08648 103 aa7.81□□□□□ -1.16
KCNQ1-203ENST00000345015 SPACA4Q8TDM5 124 aa7.81□□□□□ -1.16
KCNQ1-203ENST00000345015 ORAOV1Q8WV07 137 aa7.81□□□□□ -1.16
KCNQ1-203ENST00000345015 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa7.81□□□□□ -1.16
KCNQ1-203ENST00000345015 CAMK2N2Q96S95 79 aa7.81□□□□□ -1.16
KCNQ1-203ENST00000345015 CST9LQ9H4G1 147 aa7.81□□□□□ -1.16
KCNQ1-203ENST00000345015 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
KCNQ1-203ENST00000345015 A0A096LNJ9 63 aa7.8□□□□□ -1.16
KCNQ1-203ENST00000345015 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa7.8□□□□□ -1.16
KCNQ1-203ENST00000345015 COLCA2A8K830 154 aa7.8□□□□□ -1.16
KCNQ1-203ENST00000345015 NDUFA1O15239 70 aa7.8□□□□□ -1.16
KCNQ1-203ENST00000345015 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
KCNQ1-203ENST00000345015 COX6A2Q02221 97 aa7.8□□□□□ -1.16
KCNQ1-203ENST00000345015 PDZD11Q5EBL8 140 aa7.8□□□□□ -1.16
KCNQ1-203ENST00000345015 PLAC8Q9NZF1 115 aa7.8□□□□□ -1.16
KCNQ1-203ENST00000345015 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa7.79□□□□□ -1.16
KCNQ1-203ENST00000345015 TLX1NBP0CAT3 122 aa7.79□□□□□ -1.16
KCNQ1-203ENST00000345015 KIAA0087Q14695 138 aa7.79□□□□□ -1.16
KCNQ1-203ENST00000345015 Q5VSD8 79 aa7.79□□□□□ -1.16
KCNQ1-203ENST00000345015 Q8IZM0 81 aa7.79□□□□□ -1.16
KCNQ1-203ENST00000345015 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
KCNQ1-203ENST00000345015 TRGC2P03986 189 aa7.78□□□□□ -1.16
KCNQ1-203ENST00000345015 CXCL5P42830 114 aa7.78□□□□□ -1.16
KCNQ1-203ENST00000345015 ODF1Q14990 250 aa7.78□□□□□ -1.16
KCNQ1-203ENST00000345015 Q6ZRU5 148 aa7.78□□□□□ -1.16
KCNQ1-203ENST00000345015 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
KCNQ1-203ENST00000345015 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa7.76□□□□□ -1.17
KCNQ1-203ENST00000345015 A0A0J9YXV3 536 aa7.76□□□□□ -1.17
KCNQ1-203ENST00000345015 H3BRM9 83 aa7.76□□□□□ -1.17
KCNQ1-203ENST00000345015 PRSS2P07478 247 aa7.76□□□□□ -1.17
KCNQ1-203ENST00000345015 IGLC3P0DOY3 106 aa7.76□□□□□ -1.17
KCNQ1-203ENST00000345015 PTTG1IPP53801 180 aa7.76□□□□□ -1.17
KCNQ1-203ENST00000345015 BAGE3Q86Y29 109 aa7.76□□□□□ -1.17
KCNQ1-203ENST00000345015 LINC00528Q8N1L1 170 aa7.76□□□□□ -1.17
KCNQ1-203ENST00000345015 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa7.76□□□□□ -1.17
KCNQ1-203ENST00000345015 A0A087WYN8 130 aa7.75□□□□□ -1.17
KCNQ1-203ENST00000345015 HSBP1O75506 76 aa7.75□□□□□ -1.17
KCNQ1-203ENST00000345015 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
KCNQ1-203ENST00000345015 C6orf226Q5I0X4 101 aa7.75□□□□□ -1.17
KCNQ1-203ENST00000345015 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa7.75□□□□□ -1.17
KCNQ1-203ENST00000345015 LINC00469Q8N7U9 141 aa7.75□□□□□ -1.17
KCNQ1-203ENST00000345015 LINC00526Q96FQ7 95 aa7.75□□□□□ -1.17
KCNQ1-203ENST00000345015 DPH3Q96FX2 82 aa7.75□□□□□ -1.17
KCNQ1-203ENST00000345015 A0A096LNI7 61 aa7.74□□□□□ -1.17
KCNQ1-203ENST00000345015 PANO1I0J062 215 aa7.74□□□□□ -1.17
KCNQ1-203ENST00000345015 CKS1BP61024 79 aa7.74□□□□□ -1.17
KCNQ1-203ENST00000345015 SFTA2Q6UW10 78 aa7.74□□□□□ -1.17
KCNQ1-203ENST00000345015 SMIM1B2RUZ4 78 aa7.73□□□□□ -1.17
KCNQ1-203ENST00000345015 MAJINQ3KP22 176 aa7.73□□□□□ -1.17
KCNQ1-203ENST00000345015 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa7.72□□□□□ -1.17
KCNQ1-203ENST00000345015 F8VRH5 84 aa7.72□□□□□ -1.17
KCNQ1-203ENST00000345015 CHTF8P0CG12 524 aa7.72□□□□□ -1.17
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