RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
CCSAP-201ENST00000284617 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa15.41■□□□□ 0.06
CCSAP-201ENST00000284617 NDUFA7O95182 113 aa15.41■□□□□ 0.06
CCSAP-201ENST00000284617 WFDC10AQ9H1F0 79 aa15.41■□□□□ 0.06
CCSAP-201ENST00000284617 IGF2RP11717 2491 aa15.41■□□□□ 0.06
CCSAP-201ENST00000284617 XGP55808 180 aa15.41■□□□□ 0.06
CCSAP-201ENST00000284617 COX8CQ7Z4L0 72 aa15.4■□□□□ 0.06
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF843Q8N446 348 aa15.4■□□□□ 0.06
CCSAP-201ENST00000284617 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa15.4■□□□□ 0.06
CCSAP-201ENST00000284617 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
CCSAP-201ENST00000284617 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa15.4■□□□□ 0.06
CCSAP-201ENST00000284617 C3orf84H3BNL1 204 aa15.39■□□□□ 0.05
CCSAP-201ENST00000284617 PRM2P04554 102 aa15.39■□□□□ 0.05
CCSAP-201ENST00000284617 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa15.39■□□□□ 0.05
CCSAP-201ENST00000284617 IGKV2D-28P01615 120 aa15.39■□□□□ 0.05
CCSAP-201ENST00000284617 LINC00242Q5T6M2 205 aa15.39■□□□□ 0.05
CCSAP-201ENST00000284617 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
CCSAP-201ENST00000284617 MPLKIPQ8TAP9 179 aa15.39■□□□□ 0.05
CCSAP-201ENST00000284617 LINC00526Q96FQ7 95 aa15.38■□□□□ 0.05
CCSAP-201ENST00000284617 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
CCSAP-201ENST00000284617 COX7CP15954 63 aa15.37■□□□□ 0.05
CCSAP-201ENST00000284617 CASC2Q6XLA1 102 aa15.37■□□□□ 0.05
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
CCSAP-201ENST00000284617 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa15.37■□□□□ 0.05
CCSAP-201ENST00000284617 WFDC10BQ8IUB3 73 aa15.36■□□□□ 0.05
CCSAP-201ENST00000284617 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
CCSAP-201ENST00000284617 CEP192Q8TEP8 1941 aa15.36■□□□□ 0.05
CCSAP-201ENST00000284617 Q6JHZ5 121 aa15.35■□□□□ 0.05
CCSAP-201ENST00000284617 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
CCSAP-201ENST00000284617 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa15.35■□□□□ 0.05
CCSAP-201ENST00000284617 LY6G6DO95868 133 aa15.35■□□□□ 0.05
CCSAP-201ENST00000284617 ODF3L2Q3SX64 289 aa15.34■□□□□ 0.05
CCSAP-201ENST00000284617 Q6Q795 121 aa15.34■□□□□ 0.05
CCSAP-201ENST00000284617 CLUHP3Q96NS8 147 aa15.34■□□□□ 0.05
CCSAP-201ENST00000284617 SVIPQ8NHG7 77 aa15.34■□□□□ 0.05
CCSAP-201ENST00000284617 SPTSSBQ8NFR3 76 aa15.33■□□□□ 0.05
CCSAP-201ENST00000284617 BRI3O95415 125 aa15.33■□□□□ 0.05
CCSAP-201ENST00000284617 AVPP01185 164 aa15.33■□□□□ 0.05
CCSAP-201ENST00000284617 CDSNQ15517 529 aa15.33■□□□□ 0.05
CCSAP-201ENST00000284617 V9GYY9 64 aa15.33■□□□□ 0.05
CCSAP-201ENST00000284617 SMIM1B2RUZ4 78 aa15.32■□□□□ 0.04
CCSAP-201ENST00000284617 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa15.31■□□□□ 0.04
CCSAP-201ENST00000284617 CYSRT1A8MQ03 144 aa15.31■□□□□ 0.04
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
CCSAP-201ENST00000284617 LRP4O75096 1905 aa15.29■□□□□ 0.04
CCSAP-201ENST00000284617 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa15.29■□□□□ 0.04
CCSAP-201ENST00000284617 RPL28P46779 137 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
CCSAP-201ENST00000284617 CHCHD7Q9BUK0 85 aa15.29■□□□□ 0.04
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF580Q9UK33 172 aa15.28■□□□□ 0.04
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC179H3BU77 68 aa15.28■□□□□ 0.04
CCSAP-201ENST00000284617 SNURFQ9Y675 71 aa15.28■□□□□ 0.04
CCSAP-201ENST00000284617 C7orf33Q8WU49 177 aa15.27■□□□□ 0.04
CCSAP-201ENST00000284617 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
CCSAP-201ENST00000284617 LRCOL1A6NCL2 159 aa15.26■□□□□ 0.03
CCSAP-201ENST00000284617 EDN2P20800 178 aa15.26■□□□□ 0.03
CCSAP-201ENST00000284617 WFDC13Q8IUB5 93 aa15.26■□□□□ 0.03
CCSAP-201ENST00000284617 A0A096LNJ9 63 aa15.26■□□□□ 0.03
CCSAP-201ENST00000284617 AMELXQ99217 191 aa15.26■□□□□ 0.03
CCSAP-201ENST00000284617 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa15.25■□□□□ 0.03
CCSAP-201ENST00000284617 TSPEAR-AS2P59090 65 aa15.25■□□□□ 0.03
CCSAP-201ENST00000284617 PPDPFQ9H3Y8 114 aa15.25■□□□□ 0.03
CCSAP-201ENST00000284617 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
CCSAP-201ENST00000284617 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa15.23■□□□□ 0.03
CCSAP-201ENST00000284617 IGLV1-51P01701 117 aa15.23■□□□□ 0.03
CCSAP-201ENST00000284617 EML5Q05BV3 1969 aa15.22■□□□□ 0.03
CCSAP-201ENST00000284617 RPL37AP8A6NKH3 93 aa15.22■□□□□ 0.03
CCSAP-201ENST00000284617 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa15.22■□□□□ 0.03
CCSAP-201ENST00000284617 Q8N814 137 aa15.21■□□□□ 0.03
CCSAP-201ENST00000284617 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
CCSAP-201ENST00000284617 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa15.21■□□□□ 0.02
CCSAP-201ENST00000284617 PRR15LQ9BU68 103 aa15.2■□□□□ 0.02
CCSAP-201ENST00000284617 COX6A2Q02221 97 aa15.2■□□□□ 0.02
CCSAP-201ENST00000284617 LINC00474Q9P2X8 69 aa15.19■□□□□ 0.02
CCSAP-201ENST00000284617 BEAN1Q3B7T3 259 aa15.19■□□□□ 0.02
CCSAP-201ENST00000284617 LINC00694P0DN24 101 aa15.18■□□□□ 0.02
CCSAP-201ENST00000284617 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa15.17■□□□□ 0.02
CCSAP-201ENST00000284617 Q8N9L7 120 aa15.17■□□□□ 0.02
CCSAP-201ENST00000284617 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa15.17■□□□□ 0.02
CCSAP-201ENST00000284617 SPINK6Q6UWN8 80 aa15.17■□□□□ 0.02
CCSAP-201ENST00000284617 TRAV7A0A075B6U4 112 aa15.17■□□□□ 0.02
CCSAP-201ENST00000284617 K7ERS5 55 aa15.17■□□□□ 0.02
CCSAP-201ENST00000284617 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa15.16■□□□□ 0.02
CCSAP-201ENST00000284617 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
CCSAP-201ENST00000284617 FHL2Q14192 279 aa15.15■□□□□ 0.02
CCSAP-201ENST00000284617 PTPRSQ13332 1948 aa15.15■□□□□ 0.02
CCSAP-201ENST00000284617 A0A0J9YWU9 116 aa15.14■□□□□ 0.01
CCSAP-201ENST00000284617 PLAC8L1A1L4L8 177 aa15.14■□□□□ 0.01
CCSAP-201ENST00000284617 A0A0U1RQV1 116 aa15.13■□□□□ 0.01
CCSAP-201ENST00000284617 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
CCSAP-201ENST00000284617 JMJD1CQ15652 2540 aa15.12■□□□□ 0.01
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1W2PPR1 153 aa15.12■□□□□ 0.01
CCSAP-201ENST00000284617 OXLD1Q5BKU9 147 aa15.12■□□□□ 0.01
CCSAP-201ENST00000284617 A0A087WYN8 130 aa15.11■□□□□ 0.01
CCSAP-201ENST00000284617 SMIM26A0A096LP01 95 aa15.11■□□□□ 0.01
CCSAP-201ENST00000284617 PRR4Q16378 134 aa15.11■□□□□ 0.01
CCSAP-201ENST00000284617 C1orf137Q5JT78 98 aa15.1■□□□□ 0.01
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1B0GUV1 79 aa15.1■□□□□ 0.01
CCSAP-201ENST00000284617 FAM30AQ9NZY2 134 aa15.09■□□□□ 0.01
CCSAP-201ENST00000284617 C10orf25Q5T742 122 aa15.08■□□□□ 0.01
CCSAP-201ENST00000284617 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 117.7 ms