RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262124.15

SEH1L-201, Transcript of SEH1 like nucleoporin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SEH1L, Length 3,494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1L-201ENST00000262124 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa8.59□□□□□ -1.03
SEH1L-201ENST00000262124 CYSRT1A8MQ03 144 aa8.59□□□□□ -1.03
SEH1L-201ENST00000262124 X6R8D5 127 aa8.59□□□□□ -1.03
SEH1L-201ENST00000262124 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa8.59□□□□□ -1.04
SEH1L-201ENST00000262124 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa8.59□□□□□ -1.04
SEH1L-201ENST00000262124 A0A1B0GWB2 263 aa8.59□□□□□ -1.04
SEH1L-201ENST00000262124 PAX4O43316 350 aa8.59□□□□□ -1.04
SEH1L-201ENST00000262124 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa8.58□□□□□ -1.04
SEH1L-201ENST00000262124 DAD1P61803 113 aa8.58□□□□□ -1.04
SEH1L-201ENST00000262124 PFN2P35080 140 aa8.58□□□□□ -1.04
SEH1L-201ENST00000262124 TAL2Q16559 108 aa8.58□□□□□ -1.04
SEH1L-201ENST00000262124 IL17DQ8TAD2 202 aa8.58□□□□□ -1.04
SEH1L-201ENST00000262124 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa8.58□□□□□ -1.04
SEH1L-201ENST00000262124 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa8.57□□□□□ -1.04
SEH1L-201ENST00000262124 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa8.57□□□□□ -1.04
SEH1L-201ENST00000262124 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa8.57□□□□□ -1.04
SEH1L-201ENST00000262124 TMEM238C9JI98 176 aa8.57□□□□□ -1.04
SEH1L-201ENST00000262124 INSL3P51460 131 aa8.56□□□□□ -1.04
SEH1L-201ENST00000262124 LINC00526Q96FQ7 95 aa8.56□□□□□ -1.04
SEH1L-201ENST00000262124 PRO1854Q9UHT4 67 aa8.56□□□□□ -1.04
SEH1L-201ENST00000262124 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa8.56□□□□□ -1.04
SEH1L-201ENST00000262124 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa8.56□□□□□ -1.04
SEH1L-201ENST00000262124 MRAPQ8TCY5 172 aa8.56□□□□□ -1.04
SEH1L-201ENST00000262124 CLUHP3Q96NS8 147 aa8.55□□□□□ -1.04
SEH1L-201ENST00000262124 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa8.55□□□□□ -1.04
SEH1L-201ENST00000262124 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa8.55□□□□□ -1.04
SEH1L-201ENST00000262124 ERG28Q9UKR5 140 aa8.55□□□□□ -1.04
SEH1L-201ENST00000262124 STAB2Q8WWQ8 2551 aa8.54□□□□□ -1.04
SEH1L-201ENST00000262124 ANK2Q01484 3957 aa8.54□□□□□ -1.04
SEH1L-201ENST00000262124 RBX1P62877 108 aa8.54□□□□□ -1.04
SEH1L-201ENST00000262124 CITED1Q99966 193 aa8.54□□□□□ -1.04
SEH1L-201ENST00000262124 K7ERU9 68 aa8.54□□□□□ -1.04
SEH1L-201ENST00000262124 TCL1BO95988 128 aa8.54□□□□□ -1.04
SEH1L-201ENST00000262124 HERVK_113P63121 156 aa8.54□□□□□ -1.04
SEH1L-201ENST00000262124 ANGP03950 147 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
SEH1L-201ENST00000262124 TENM2Q9NT68 2774 aa8.53□□□□□ -1.04
SEH1L-201ENST00000262124 SMIM1B2RUZ4 78 aa8.53□□□□□ -1.04
SEH1L-201ENST00000262124 OVOL2Q9BRP0 275 aa8.53□□□□□ -1.04
SEH1L-201ENST00000262124 LINC00269Q8N2A0 174 aa8.53□□□□□ -1.04
SEH1L-201ENST00000262124 LINC00158P58513 81 aa8.52□□□□□ -1.05
SEH1L-201ENST00000262124 C2orf82Q6UX34 121 aa8.52□□□□□ -1.05
SEH1L-201ENST00000262124 PRO0255Q9UI72 69 aa8.52□□□□□ -1.05
SEH1L-201ENST00000262124 CRYBA4P53673 196 aa8.52□□□□□ -1.05
SEH1L-201ENST00000262124 EDA2RQ9HAV5 297 aa8.52□□□□□ -1.05
SEH1L-201ENST00000262124 APOC4P55056 127 aa8.52□□□□□ -1.05
SEH1L-201ENST00000262124 CLEC2BQ92478 149 aa8.52□□□□□ -1.05
SEH1L-201ENST00000262124 C9JAW5 83 aa8.51□□□□□ -1.05
SEH1L-201ENST00000262124 PCP4P48539 62 aa8.5□□□□□ -1.05
SEH1L-201ENST00000262124 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SEH1L-201ENST00000262124 ZFAND6Q6FIF0 208 aa8.5□□□□□ -1.05
SEH1L-201ENST00000262124 A0A1B0GV72 72 aa8.5□□□□□ -1.05
SEH1L-201ENST00000262124 IGHV3-33P01772 117 aa8.5□□□□□ -1.05
SEH1L-201ENST00000262124 C6orf226Q5I0X4 101 aa8.5□□□□□ -1.05
SEH1L-201ENST00000262124 LITAFQ99732 161 aa8.5□□□□□ -1.05
SEH1L-201ENST00000262124 G3V4G9 280 aa8.49□□□□□ -1.05
SEH1L-201ENST00000262124 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SEH1L-201ENST00000262124 DEFB121Q5J5C9 76 aa8.49□□□□□ -1.05
SEH1L-201ENST00000262124 KRTAP10-11P60412 298 aa8.49□□□□□ -1.05
SEH1L-201ENST00000262124 SBSPONQ8IVN8 264 aa8.49□□□□□ -1.05
SEH1L-201ENST00000262124 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SEH1L-201ENST00000262124 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa8.48□□□□□ -1.05
SEH1L-201ENST00000262124 TRIAP1O43715 76 aa8.48□□□□□ -1.05
SEH1L-201ENST00000262124 ATP5G1P05496 136 aa8.48□□□□□ -1.05
SEH1L-201ENST00000262124 TIRAPP58753 221 aa8.48□□□□□ -1.05
SEH1L-201ENST00000262124 MIAQ16674 131 aa8.48□□□□□ -1.05
SEH1L-201ENST00000262124 KLK12Q9UKR0 248 aa8.48□□□□□ -1.05
SEH1L-201ENST00000262124 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa8.47□□□□□ -1.05
SEH1L-201ENST00000262124 CBY1Q9Y3M2 126 aa8.47□□□□□ -1.05
SEH1L-201ENST00000262124 SPART-AS1P0CW21 52 aa8.46□□□□□ -1.05
SEH1L-201ENST00000262124 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.05
SEH1L-201ENST00000262124 OR13C6PQ8NH95 151 aa8.46□□□□□ -1.05
SEH1L-201ENST00000262124 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa8.46□□□□□ -1.05
SEH1L-201ENST00000262124 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa8.46□□□□□ -1.05
SEH1L-201ENST00000262124 COX7B2Q8TF08 81 aa8.46□□□□□ -1.05
SEH1L-201ENST00000262124 GTSF1LQ9H1H1 148 aa8.46□□□□□ -1.05
SEH1L-201ENST00000262124 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
SEH1L-201ENST00000262124 LINC00308Q8TCZ7 52 aa8.46□□□□□ -1.06
SEH1L-201ENST00000262124 Q8NAQ8 132 aa8.45□□□□□ -1.06
SEH1L-201ENST00000262124 FOSL1P15407 271 aa8.45□□□□□ -1.06
SEH1L-201ENST00000262124 NDUFA1O15239 70 aa8.45□□□□□ -1.06
SEH1L-201ENST00000262124 MALP21145 153 aa8.45□□□□□ -1.06
SEH1L-201ENST00000262124 PRR3P79522 188 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
SEH1L-201ENST00000262124 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
SEH1L-201ENST00000262124 F8W1H4 67 aa8.44□□□□□ -1.06
SEH1L-201ENST00000262124 Q6ZTC4 211 aa8.44□□□□□ -1.06
SEH1L-201ENST00000262124 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
SEH1L-201ENST00000262124 SS18Q15532 418 aa8.43□□□□□ -1.06
SEH1L-201ENST00000262124 UBE2WQ96B02 151 aa8.43□□□□□ -1.06
SEH1L-201ENST00000262124 ICOSQ9Y6W8 199 aa8.43□□□□□ -1.06
SEH1L-201ENST00000262124 SMAGPQ0VAQ4 97 aa8.42□□□□□ -1.06
SEH1L-201ENST00000262124 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
SEH1L-201ENST00000262124 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa8.42□□□□□ -1.06
SEH1L-201ENST00000262124 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa8.42□□□□□ -1.06
SEH1L-201ENST00000262124 LYRM9A8MSI8 78 aa8.42□□□□□ -1.06
SEH1L-201ENST00000262124 REG3AQ06141 175 aa8.42□□□□□ -1.06
SEH1L-201ENST00000262124 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa8.42□□□□□ -1.06
SEH1L-201ENST00000262124 SMIM9A6NGZ8 99 aa8.42□□□□□ -1.06
SEH1L-201ENST00000262124 SLC25A20O43772 301 aa8.42□□□□□ -1.06
SEH1L-201ENST00000262124 CKS1BP61024 79 aa8.42□□□□□ -1.06
SEH1L-201ENST00000262124 CSMD3Q7Z407 3707 aa8.41□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 269.9 ms