RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249504.6

HOXD11-201, Transcript of homeobox D11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD11, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-201ENST00000249504 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.31
HOXD11-201ENST00000249504 NFE4Q86UQ8 179 aa13.08□□□□□ -0.31
HOXD11-201ENST00000249504 IGLC3P0DOY3 106 aa13.08□□□□□ -0.32
HOXD11-201ENST00000249504 ENHOQ6UWT2 76 aa13.08□□□□□ -0.32
HOXD11-201ENST00000249504 STPG4Q8N801 248 aa13.08□□□□□ -0.32
HOXD11-201ENST00000249504 RTL8CO15255 209 aa13.07□□□□□ -0.32
HOXD11-201ENST00000249504 CLPSL2Q6UWE3 100 aa13.07□□□□□ -0.32
HOXD11-201ENST00000249504 UBE2WQ96B02 151 aa13.07□□□□□ -0.32
HOXD11-201ENST00000249504 Q9HAA7 133 aa13.07□□□□□ -0.32
HOXD11-201ENST00000249504 C11orf86A6NJI1 115 aa13.06□□□□□ -0.32
HOXD11-201ENST00000249504 CRPP02741 224 aa13.06□□□□□ -0.32
HOXD11-201ENST00000249504 LINC00336Q6ZUF6 198 aa13.06□□□□□ -0.32
HOXD11-201ENST00000249504 CHAC1Q9BUX1 264 aa13.06□□□□□ -0.32
HOXD11-201ENST00000249504 HERVK_113P61574 105 aa13.05□□□□□ -0.32
HOXD11-201ENST00000249504 SEC11AP67812 179 aa13.05□□□□□ -0.32
HOXD11-201ENST00000249504 ANKRD39Q53RE8 183 aa13.05□□□□□ -0.32
HOXD11-201ENST00000249504 MIEN1Q9BRT3 115 aa13.05□□□□□ -0.32
HOXD11-201ENST00000249504 UQCR10Q9UDW1 63 aa13.05□□□□□ -0.32
HOXD11-201ENST00000249504 DNAH2Q9P225 4427 aa13.05□□□□□ -0.32
HOXD11-201ENST00000249504 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa13.04□□□□□ -0.32
HOXD11-201ENST00000249504 UBE2D1P51668 147 aa13.04□□□□□ -0.32
HOXD11-201ENST00000249504 DNAH10Q8IVF4 4471 aa13.04□□□□□ -0.32
HOXD11-201ENST00000249504 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa13.03□□□□□ -0.32
HOXD11-201ENST00000249504 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa13.03□□□□□ -0.32
HOXD11-201ENST00000249504 A0A0J9YXV3 536 aa13.03□□□□□ -0.32
HOXD11-201ENST00000249504 MIAQ16674 131 aa13.03□□□□□ -0.32
HOXD11-201ENST00000249504 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa13.03□□□□□ -0.32
HOXD11-201ENST00000249504 DDTP30046 118 aa13.03□□□□□ -0.32
HOXD11-201ENST00000249504 TMEM170BQ5T4T1 132 aa13.03□□□□□ -0.32
HOXD11-201ENST00000249504 C14orf144Q96I85 54 aa13.03□□□□□ -0.32
HOXD11-201ENST00000249504 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa13.02□□□□□ -0.33
HOXD11-201ENST00000249504 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
HOXD11-201ENST00000249504 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa13.01□□□□□ -0.33
HOXD11-201ENST00000249504 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa13.01□□□□□ -0.33
HOXD11-201ENST00000249504 COX8AP10176 69 aa13.01□□□□□ -0.33
HOXD11-201ENST00000249504 SLC25A34Q6PIV7 304 aa13.01□□□□□ -0.33
HOXD11-201ENST00000249504 PSCAO43653 123 aa13□□□□□ -0.33
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
HOXD11-201ENST00000249504 NMUP48645 174 aa13□□□□□ -0.33
HOXD11-201ENST00000249504 HERVK_113P63121 156 aa13□□□□□ -0.33
HOXD11-201ENST00000249504 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
HOXD11-201ENST00000249504 RMI2Q96E14 147 aa13□□□□□ -0.33
HOXD11-201ENST00000249504 FRAS1Q86XX4 4008 aa13□□□□□ -0.33
HOXD11-201ENST00000249504 E9PLD3 99 aa12.99□□□□□ -0.33
HOXD11-201ENST00000249504 CCL25O15444 150 aa12.99□□□□□ -0.33
HOXD11-201ENST00000249504 SS18Q15532 418 aa12.99□□□□□ -0.33
HOXD11-201ENST00000249504 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa12.98□□□□□ -0.33
HOXD11-201ENST00000249504 TM2D2Q9BX73 214 aa12.98□□□□□ -0.33
HOXD11-201ENST00000249504 H3BRM9 83 aa12.98□□□□□ -0.33
HOXD11-201ENST00000249504 TNP2Q05952 138 aa12.98□□□□□ -0.33
HOXD11-201ENST00000249504 C1orf43Q9BWL3 253 aa12.98□□□□□ -0.33
HOXD11-201ENST00000249504 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa12.97□□□□□ -0.33
HOXD11-201ENST00000249504 TMEM223A0PJW6 202 aa12.97□□□□□ -0.33
HOXD11-201ENST00000249504 DLEU1O43261 78 aa12.97□□□□□ -0.33
HOXD11-201ENST00000249504 LINC00242Q5T6M2 205 aa12.97□□□□□ -0.33
HOXD11-201ENST00000249504 LINC00469Q8N7U9 141 aa12.97□□□□□ -0.33
HOXD11-201ENST00000249504 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
HOXD11-201ENST00000249504 DNAH17Q9UFH2 4485 aa12.97□□□□□ -0.33
HOXD11-201ENST00000249504 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa12.96□□□□□ -0.33
HOXD11-201ENST00000249504 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa12.96□□□□□ -0.33
HOXD11-201ENST00000249504 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa12.96□□□□□ -0.33
HOXD11-201ENST00000249504 COX11Q9Y6N1 276 aa12.96□□□□□ -0.33
HOXD11-201ENST00000249504 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
HOXD11-201ENST00000249504 BOD1L2Q8IYS8 172 aa12.95□□□□□ -0.34
HOXD11-201ENST00000249504 XCL1P47992 114 aa12.94□□□□□ -0.34
HOXD11-201ENST00000249504 CD164L2Q6UWJ8 174 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXD11-201ENST00000249504 PCP2Q8IVA1 136 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXD11-201ENST00000249504 GAGE12HA6NDE8 117 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXD11-201ENST00000249504 LEPROTO15243 131 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXD11-201ENST00000249504 PLEKHB2Q96CS7 222 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXD11-201ENST00000249504 COX6A2Q02221 97 aa12.92□□□□□ -0.34
HOXD11-201ENST00000249504 FOXI1Q12951 378 aa12.92□□□□□ -0.34
HOXD11-201ENST00000249504 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa12.92□□□□□ -0.34
HOXD11-201ENST00000249504 FAT2Q9NYQ8 4349 aa12.92□□□□□ -0.34
HOXD11-201ENST00000249504 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXD11-201ENST00000249504 LINC00587B1AMM8 73 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXD11-201ENST00000249504 EREGO14944 169 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXD11-201ENST00000249504 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa12.89□□□□□ -0.35
HOXD11-201ENST00000249504 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
HOXD11-201ENST00000249504 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa12.89□□□□□ -0.35
HOXD11-201ENST00000249504 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa12.88□□□□□ -0.35
HOXD11-201ENST00000249504 J3QQQ9 107 aa12.88□□□□□ -0.35
HOXD11-201ENST00000249504 A0A087WTM6 91 aa12.88□□□□□ -0.35
HOXD11-201ENST00000249504 SPINK8P0C7L1 97 aa12.88□□□□□ -0.35
HOXD11-201ENST00000249504 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa12.87□□□□□ -0.35
HOXD11-201ENST00000249504 A0A1B0GVY2 172 aa12.87□□□□□ -0.35
HOXD11-201ENST00000249504 C5orf38Q86SI9 138 aa12.87□□□□□ -0.35
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF815PA8K554 130 aa12.86□□□□□ -0.35
HOXD11-201ENST00000249504 COX7A2LO14548 114 aa12.86□□□□□ -0.35
HOXD11-201ENST00000249504 CTAG1AP78358 180 aa12.86□□□□□ -0.35
HOXD11-201ENST00000249504 TTTY13Q9BZ97 58 aa12.86□□□□□ -0.35
HOXD11-201ENST00000249504 TP73-AS1Q9UF72 201 aa12.86□□□□□ -0.35
HOXD11-201ENST00000249504 A0A087WZ39 114 aa12.85□□□□□ -0.35
HOXD11-201ENST00000249504 HIGD1BQ9P298 99 aa12.85□□□□□ -0.35
HOXD11-201ENST00000249504 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa12.84□□□□□ -0.35
HOXD11-201ENST00000249504 LRCOL1A6NCL2 159 aa12.84□□□□□ -0.35
HOXD11-201ENST00000249504 LECT2O14960 151 aa12.84□□□□□ -0.35
HOXD11-201ENST00000249504 C2orf91Q6ZV80 131 aa12.84□□□□□ -0.35
HOXD11-201ENST00000249504 SMIM1B2RUZ4 78 aa12.83□□□□□ -0.35
HOXD11-201ENST00000249504 TSPEAR-AS2P59090 65 aa12.83□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.8 ms