RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249501.4

HOXD10-201, Transcript of homeobox D10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD10, Length 1,989 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10-201ENST00000249501 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa13.04□□□□□ -0.32
HOXD10-201ENST00000249501 ORAOV1Q8WV07 137 aa13.04□□□□□ -0.32
HOXD10-201ENST00000249501 HIGD1BQ9P298 99 aa13.04□□□□□ -0.32
HOXD10-201ENST00000249501 H3BRM9 83 aa13.03□□□□□ -0.32
HOXD10-201ENST00000249501 ANGP03950 147 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
HOXD10-201ENST00000249501 ESRGQ1W209 222 aa13.03□□□□□ -0.32
HOXD10-201ENST00000249501 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa13.03□□□□□ -0.32
HOXD10-201ENST00000249501 LINC00269Q8N2A0 174 aa13.03□□□□□ -0.32
HOXD10-201ENST00000249501 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa13.02□□□□□ -0.32
HOXD10-201ENST00000249501 WFDC10BQ8IUB3 73 aa13.01□□□□□ -0.33
HOXD10-201ENST00000249501 SMIM1B2RUZ4 78 aa13.01□□□□□ -0.33
HOXD10-201ENST00000249501 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
HOXD10-201ENST00000249501 HSD52Q0P140 79 aa13□□□□□ -0.33
HOXD10-201ENST00000249501 SCGB1D4Q6XE38 83 aa13□□□□□ -0.33
HOXD10-201ENST00000249501 IGHV3-30P01768 117 aa12.99□□□□□ -0.33
HOXD10-201ENST00000249501 IGHV3-33P01772 117 aa12.99□□□□□ -0.33
HOXD10-201ENST00000249501 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa12.99□□□□□ -0.33
HOXD10-201ENST00000249501 REG3AQ06141 175 aa12.99□□□□□ -0.33
HOXD10-201ENST00000249501 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa12.98□□□□□ -0.33
HOXD10-201ENST00000249501 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa12.98□□□□□ -0.33
HOXD10-201ENST00000249501 CCL25O15444 150 aa12.98□□□□□ -0.33
HOXD10-201ENST00000249501 SS18Q15532 418 aa12.98□□□□□ -0.33
HOXD10-201ENST00000249501 XCL1P47992 114 aa12.98□□□□□ -0.33
HOXD10-201ENST00000249501 COX11Q9Y6N1 276 aa12.98□□□□□ -0.33
HOXD10-201ENST00000249501 STAB2Q8WWQ8 2551 aa12.97□□□□□ -0.33
HOXD10-201ENST00000249501 C5orf38Q86SI9 138 aa12.97□□□□□ -0.33
HOXD10-201ENST00000249501 C10orf126Q8N4M7 172 aa12.97□□□□□ -0.33
HOXD10-201ENST00000249501 KLK12Q9UKR0 248 aa12.97□□□□□ -0.33
HOXD10-201ENST00000249501 IGLL5B9A064 214 aa12.96□□□□□ -0.33
HOXD10-201ENST00000249501 C15orf53Q8NAA6 179 aa12.96□□□□□ -0.33
HOXD10-201ENST00000249501 NDUFA12Q9UI09 145 aa12.96□□□□□ -0.33
HOXD10-201ENST00000249501 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa12.96□□□□□ -0.34
HOXD10-201ENST00000249501 GCSHP23434 173 aa12.95□□□□□ -0.34
HOXD10-201ENST00000249501 PTTG1IPP53801 180 aa12.95□□□□□ -0.34
HOXD10-201ENST00000249501 ZFAND6Q6FIF0 208 aa12.95□□□□□ -0.34
HOXD10-201ENST00000249501 HIST1H4GQ99525 98 aa12.94□□□□□ -0.34
HOXD10-201ENST00000249501 K7EP13 123 aa12.94□□□□□ -0.34
HOXD10-201ENST00000249501 CBY1Q9Y3M2 126 aa12.94□□□□□ -0.34
HOXD10-201ENST00000249501 A0A087WZ39 114 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXD10-201ENST00000249501 A0A0J9YXY3 114 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXD10-201ENST00000249501 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
HOXD10-201ENST00000249501 UBE2V1Q13404 147 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXD10-201ENST00000249501 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
HOXD10-201ENST00000249501 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXD10-201ENST00000249501 FXYD2P54710 66 aa12.92□□□□□ -0.34
HOXD10-201ENST00000249501 ENHOQ6UWT2 76 aa12.92□□□□□ -0.34
HOXD10-201ENST00000249501 CEND1Q8N111 149 aa12.92□□□□□ -0.34
HOXD10-201ENST00000249501 PRR34Q9NV39 138 aa12.92□□□□□ -0.34
HOXD10-201ENST00000249501 TAL2Q16559 108 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXD10-201ENST00000249501 LINC00588Q9Y4M8 146 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXD10-201ENST00000249501 NDUFA1O15239 70 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXD10-201ENST00000249501 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP12.9□□□□□ -0.34
HOXD10-201ENST00000249501 CD164L2Q6UWJ8 174 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXD10-201ENST00000249501 UBE2WQ96B02 151 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXD10-201ENST00000249501 Q9H8V8 135 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXD10-201ENST00000249501 TOMM7Q9P0U1 55 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXD10-201ENST00000249501 TM2D2Q9BX73 214 aa12.89□□□□□ -0.35
HOXD10-201ENST00000249501 Q6ZVH6 145 aa12.89□□□□□ -0.35
HOXD10-201ENST00000249501 COX7B2Q8TF08 81 aa12.89□□□□□ -0.35
HOXD10-201ENST00000249501 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
HOXD10-201ENST00000249501 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
HOXD10-201ENST00000249501 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
HOXD10-201ENST00000249501 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
HOXD10-201ENST00000249501 CRPP02741 224 aa12.87□□□□□ -0.35
HOXD10-201ENST00000249501 FOXI1Q12951 378 aa12.87□□□□□ -0.35
HOXD10-201ENST00000249501 LINC01556Q5JQF7 62 aa12.87□□□□□ -0.35
HOXD10-201ENST00000249501 LITAFQ99732 161 aa12.87□□□□□ -0.35
HOXD10-201ENST00000249501 GAGE12HA6NDE8 117 aa12.86□□□□□ -0.35
HOXD10-201ENST00000249501 COX7A2LO14548 114 aa12.85□□□□□ -0.35
HOXD10-201ENST00000249501 CCL18P55774 89 aa12.85□□□□□ -0.35
HOXD10-201ENST00000249501 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa12.85□□□□□ -0.35
HOXD10-201ENST00000249501 A6NDN8 102 aa12.84□□□□□ -0.35
HOXD10-201ENST00000249501 TMEM238C9JI98 176 aa12.84□□□□□ -0.35
HOXD10-201ENST00000249501 TAX1BP3O14907 124 aa12.84□□□□□ -0.35
HOXD10-201ENST00000249501 VAMP3Q15836 100 aa12.84□□□□□ -0.35
HOXD10-201ENST00000249501 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.35
HOXD10-201ENST00000249501 DNAH10OSP0CZ25 163 aa12.83□□□□□ -0.36
HOXD10-201ENST00000249501 LINC01561Q8N1V8 128 aa12.83□□□□□ -0.36
HOXD10-201ENST00000249501 CSMD3Q7Z407 3707 aa12.83□□□□□ -0.36
HOXD10-201ENST00000249501 K7ERJ3 54 aa12.82□□□□□ -0.36
HOXD10-201ENST00000249501 A0A0U1RRA0 63 aa12.81□□□□□ -0.36
HOXD10-201ENST00000249501 MALP21145 153 aa12.81□□□□□ -0.36
HOXD10-201ENST00000249501 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa12.81□□□□□ -0.36
HOXD10-201ENST00000249501 MIAQ16674 131 aa12.81□□□□□ -0.36
HOXD10-201ENST00000249501 MUSTN1Q8IVN3 82 aa12.81□□□□□ -0.36
HOXD10-201ENST00000249501 DAND5Q8N907 189 aa12.81□□□□□ -0.36
HOXD10-201ENST00000249501 APLNQ9ULZ1 77 aa12.81□□□□□ -0.36
HOXD10-201ENST00000249501 DNAH7Q8WXX0 4024 aa12.81□□□□□ -0.36
HOXD10-201ENST00000249501 RAB37Q96AX2 223 aa12.8□□□□□ -0.36
HOXD10-201ENST00000249501 LYSTQ99698 3801 aa12.8□□□□□ -0.36
HOXD10-201ENST00000249501 NPC2P61916 151 aa12.8□□□□□ -0.36
HOXD10-201ENST00000249501 C6orf226Q5I0X4 101 aa12.8□□□□□ -0.36
HOXD10-201ENST00000249501 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
HOXD10-201ENST00000249501 TIMM17BO60830 172 aa12.79□□□□□ -0.36
HOXD10-201ENST00000249501 HERV-K104P63124 156 aa12.79□□□□□ -0.36
HOXD10-201ENST00000249501 MEIG1Q5JSS6 88 aa12.79□□□□□ -0.36
HOXD10-201ENST00000249501 Q8IZM0 81 aa12.79□□□□□ -0.36
HOXD10-201ENST00000249501 SPANXDQ9BXN6 97 aa12.79□□□□□ -0.36
HOXD10-201ENST00000249501 SPANXCQ9NY87 97 aa12.79□□□□□ -0.36
HOXD10-201ENST00000249501 PRSS2P07478 247 aa12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms