RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000224140.5

SETX-201, Transcript of senataxin, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SETX, Length 11,100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETX-201ENST00000224140 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa4.64□□□□□ -1.67
SETX-201ENST00000224140 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
SETX-201ENST00000224140 CDPF1Q6NVV7 123 aa4.64□□□□□ -1.67
SETX-201ENST00000224140 AMELXQ99217 191 aa4.64□□□□□ -1.67
SETX-201ENST00000224140 A0A087WZ39 114 aa4.64□□□□□ -1.67
SETX-201ENST00000224140 TSHBP01222 138 aa4.64□□□□□ -1.67
SETX-201ENST00000224140 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
SETX-201ENST00000224140 NAV2Q8IVL1 2488 aa4.64□□□□□ -1.67
SETX-201ENST00000224140 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa4.64□□□□□ -1.67
SETX-201ENST00000224140 PMAIP1Q13794 54 aa4.64□□□□□ -1.67
SETX-201ENST00000224140 Q6Q795 121 aa4.64□□□□□ -1.67
SETX-201ENST00000224140 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa4.64□□□□□ -1.67
SETX-201ENST00000224140 TLN2Q9Y4G6 2542 aa4.64□□□□□ -1.67
SETX-201ENST00000224140 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
SETX-201ENST00000224140 Q6ZTI0 123 aa4.63□□□□□ -1.67
SETX-201ENST00000224140 H0Y9J4 135 aa4.63□□□□□ -1.67
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SETX-201ENST00000224140 IGHV3-33P01772 117 aa4.63□□□□□ -1.67
SETX-201ENST00000224140 RPL28P46779 137 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
SETX-201ENST00000224140 KLK12Q9UKR0 248 aa4.63□□□□□ -1.67
SETX-201ENST00000224140 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa4.63□□□□□ -1.67
SETX-201ENST00000224140 IGHV3-30P01768 117 aa4.63□□□□□ -1.67
SETX-201ENST00000224140 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa4.63□□□□□ -1.67
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SETX-201ENST00000224140 FHL3Q13643 280 aa4.63□□□□□ -1.67
SETX-201ENST00000224140 LY6G6DO95868 133 aa4.62□□□□□ -1.67
SETX-201ENST00000224140 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
SETX-201ENST00000224140 LINC00269Q8N2A0 174 aa4.62□□□□□ -1.67
SETX-201ENST00000224140 C4orf48Q5BLP8 95 aa4.62□□□□□ -1.67
SETX-201ENST00000224140 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa4.62□□□□□ -1.67
SETX-201ENST00000224140 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
SETX-201ENST00000224140 NRGNQ92686 78 aa4.62□□□□□ -1.67
SETX-201ENST00000224140 B9D2Q9BPU9 175 aa4.62□□□□□ -1.67
SETX-201ENST00000224140 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
SETX-201ENST00000224140 DAND5Q8N907 189 aa4.62□□□□□ -1.67
SETX-201ENST00000224140 COX7BP24311 80 aa4.62□□□□□ -1.67
SETX-201ENST00000224140 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa4.61□□□□□ -1.67
SETX-201ENST00000224140 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa4.61□□□□□ -1.67
SETX-201ENST00000224140 C2orf91Q6ZV80 131 aa4.61□□□□□ -1.67
SETX-201ENST00000224140 LST1O00453 97 aa4.61□□□□□ -1.67
SETX-201ENST00000224140 INAFM1C9JVW0 142 aa4.6□□□□□ -1.67
SETX-201ENST00000224140 M0R378 163 aa4.6□□□□□ -1.67
SETX-201ENST00000224140 C2orf48Q96LS8 159 aa4.6□□□□□ -1.67
SETX-201ENST00000224140 Q8N976 141 aa4.6□□□□□ -1.67
SETX-201ENST00000224140 ODF3L2Q3SX64 289 aa4.6□□□□□ -1.67
SETX-201ENST00000224140 LINC00173Q6ZV60 143 aa4.6□□□□□ -1.67
SETX-201ENST00000224140 IGF2RP11717 2491 aa4.6□□□□□ -1.67
SETX-201ENST00000224140 FSHBP01225 129 aa4.6□□□□□ -1.67
SETX-201ENST00000224140 RBX1P62877 108 aa4.6□□□□□ -1.67
SETX-201ENST00000224140 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa4.6□□□□□ -1.67
SETX-201ENST00000224140 Q6ZQT7 251 aa4.6□□□□□ -1.67
SETX-201ENST00000224140 LRRK2Q5S007 2527 aa4.6□□□□□ -1.67
SETX-201ENST00000224140 CHD9Q3L8U1 2897 aa4.59□□□□□ -1.67
SETX-201ENST00000224140 PROK1P58294 105 aa4.59□□□□□ -1.67
SETX-201ENST00000224140 SERP1Q9Y6X1 66 aa4.59□□□□□ -1.67
SETX-201ENST00000224140 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa4.59□□□□□ -1.67
SETX-201ENST00000224140 TCL1BO95988 128 aa4.59□□□□□ -1.67
SETX-201ENST00000224140 CDSNQ15517 529 aa4.59□□□□□ -1.68
SETX-201ENST00000224140 C20orf197Q8N268 126 aa4.59□□□□□ -1.68
SETX-201ENST00000224140 SERP2Q8N6R1 65 aa4.59□□□□□ -1.68
SETX-201ENST00000224140 RPL37AP8A6NKH3 93 aa4.59□□□□□ -1.68
SETX-201ENST00000224140 A8MTW9 85 aa4.59□□□□□ -1.68
SETX-201ENST00000224140 LECT2O14960 151 aa4.59□□□□□ -1.68
SETX-201ENST00000224140 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
SETX-201ENST00000224140 CLPSL2Q6UWE3 100 aa4.58□□□□□ -1.68
SETX-201ENST00000224140 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa4.58□□□□□ -1.68
SETX-201ENST00000224140 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
SETX-201ENST00000224140 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa4.58□□□□□ -1.68
SETX-201ENST00000224140 AVPP01185 164 aa4.58□□□□□ -1.68
SETX-201ENST00000224140 OXLD1Q5BKU9 147 aa4.58□□□□□ -1.68
SETX-201ENST00000224140 XIRP2A4UGR9 3374 aa4.57□□□□□ -1.68
SETX-201ENST00000224140 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa4.57□□□□□ -1.68
SETX-201ENST00000224140 BPY2O14599 106 aa4.57□□□□□ -1.68
SETX-201ENST00000224140 SYCNQ0VAF6 134 aa4.57□□□□□ -1.68
SETX-201ENST00000224140 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
SETX-201ENST00000224140 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa4.57□□□□□ -1.68
SETX-201ENST00000224140 SDIM1Q6ZPB5 146 aa4.57□□□□□ -1.68
SETX-201ENST00000224140 C11orf21Q9P2W6 132 aa4.57□□□□□ -1.68
SETX-201ENST00000224140 A0A1W2PPR1 153 aa4.57□□□□□ -1.68
SETX-201ENST00000224140 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa4.57□□□□□ -1.68
SETX-201ENST00000224140 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa4.56□□□□□ -1.68
SETX-201ENST00000224140 A0A096LPF7 62 aa4.56□□□□□ -1.68
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SETX-201ENST00000224140 SMIM1B2RUZ4 78 aa4.56□□□□□ -1.68
SETX-201ENST00000224140 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa4.56□□□□□ -1.68
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SETX-201ENST00000224140 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa4.56□□□□□ -1.68
SETX-201ENST00000224140 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa4.56□□□□□ -1.68
SETX-201ENST00000224140 FHL2Q14192 279 aa4.56□□□□□ -1.68
SETX-201ENST00000224140 CLEC2BQ92478 149 aa4.55□□□□□ -1.68
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SETX-201ENST00000224140 WFDC2Q14508 124 aa4.55□□□□□ -1.68
SETX-201ENST00000224140 C7orf33Q8WU49 177 aa4.55□□□□□ -1.68
SETX-201ENST00000224140 TRIAP1O43715 76 aa4.55□□□□□ -1.68
SETX-201ENST00000224140 MT-ATP8P03928 68 aa4.55□□□□□ -1.68
SETX-201ENST00000224140 PRR9Q5T870 116 aa4.55□□□□□ -1.68
SETX-201ENST00000224140 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa4.55□□□□□ -1.68
SETX-201ENST00000224140 NCOR2Q9Y618 2525 aa4.55□□□□□ -1.68
SETX-201ENST00000224140 DNAH14Q0VDD8 3507 aa4.55□□□□□ -1.68
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