RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000220888.9

TRPS1-201, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 5,480 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-201ENST00000220888 X6R8D5 127 aa7.7□□□□□ -1.18
TRPS1-201ENST00000220888 BRWD1-AS2P59051 145 aa7.69□□□□□ -1.18
TRPS1-201ENST00000220888 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
TRPS1-201ENST00000220888 Q8IZM0 81 aa7.69□□□□□ -1.18
TRPS1-201ENST00000220888 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa7.69□□□□□ -1.18
TRPS1-201ENST00000220888 MLST8Q9BVC4 326 aa7.69□□□□□ -1.18
TRPS1-201ENST00000220888 KLLNB2CW77 178 aa7.69□□□□□ -1.18
TRPS1-201ENST00000220888 TSHBP01222 138 aa7.69□□□□□ -1.18
TRPS1-201ENST00000220888 REG3GQ6UW15 175 aa7.69□□□□□ -1.18
TRPS1-201ENST00000220888 PRM2P04554 102 aa7.69□□□□□ -1.18
TRPS1-201ENST00000220888 ODF3L2Q3SX64 289 aa7.69□□□□□ -1.18
TRPS1-201ENST00000220888 C16orf95Q9H693 158 aa7.69□□□□□ -1.18
TRPS1-201ENST00000220888 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
TRPS1-201ENST00000220888 CDSNQ15517 529 aa7.68□□□□□ -1.18
TRPS1-201ENST00000220888 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
TRPS1-201ENST00000220888 MPLKIPQ8TAP9 179 aa7.68□□□□□ -1.18
TRPS1-201ENST00000220888 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
TRPS1-201ENST00000220888 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa7.68□□□□□ -1.18
TRPS1-201ENST00000220888 SERP2Q8N6R1 65 aa7.68□□□□□ -1.18
TRPS1-201ENST00000220888 MED12LQ86YW9 2145 aa7.67□□□□□ -1.18
TRPS1-201ENST00000220888 TIMM17BO60830 172 aa7.67□□□□□ -1.18
TRPS1-201ENST00000220888 IGF2RP11717 2491 aa7.67□□□□□ -1.18
TRPS1-201ENST00000220888 DENND4CQ5VZ89 1909 aa7.67□□□□□ -1.18
TRPS1-201ENST00000220888 A8MZ25 164 aa7.67□□□□□ -1.18
TRPS1-201ENST00000220888 C2CD3Q4AC94 2353 aa7.66□□□□□ -1.18
TRPS1-201ENST00000220888 ESRGQ1W209 222 aa7.66□□□□□ -1.18
TRPS1-201ENST00000220888 V9GYY9 64 aa7.66□□□□□ -1.18
TRPS1-201ENST00000220888 TRIAP1O43715 76 aa7.65□□□□□ -1.18
TRPS1-201ENST00000220888 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa7.65□□□□□ -1.18
TRPS1-201ENST00000220888 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
TRPS1-201ENST00000220888 CRIP1P50238 77 aa7.65□□□□□ -1.19
TRPS1-201ENST00000220888 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa7.65□□□□□ -1.19
TRPS1-201ENST00000220888 CDPF1Q6NVV7 123 aa7.65□□□□□ -1.19
TRPS1-201ENST00000220888 C11orf1Q9H5F2 150 aa7.65□□□□□ -1.19
TRPS1-201ENST00000220888 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa7.64□□□□□ -1.19
TRPS1-201ENST00000220888 PRR9Q5T870 116 aa7.64□□□□□ -1.19
TRPS1-201ENST00000220888 LIMD2Q9BT23 127 aa7.64□□□□□ -1.19
TRPS1-201ENST00000220888 RNF185Q96GF1 192 aa7.64□□□□□ -1.19
TRPS1-201ENST00000220888 C2orf48Q96LS8 159 aa7.64□□□□□ -1.19
TRPS1-201ENST00000220888 C2orf16Q68DN1 1984 aa7.63□□□□□ -1.19
TRPS1-201ENST00000220888 COX6A2Q02221 97 aa7.63□□□□□ -1.19
TRPS1-201ENST00000220888 Q6JHZ5 121 aa7.63□□□□□ -1.19
TRPS1-201ENST00000220888 SMIM11BQ8TCY0 68 aa7.63□□□□□ -1.19
TRPS1-201ENST00000220888 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
TRPS1-201ENST00000220888 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa7.62□□□□□ -1.19
TRPS1-201ENST00000220888 FAM229AH3BQW9 127 aa7.62□□□□□ -1.19
TRPS1-201ENST00000220888 PRR4Q16378 134 aa7.62□□□□□ -1.19
TRPS1-201ENST00000220888 MYO9AB2RTY4 2548 aa7.62□□□□□ -1.19
TRPS1-201ENST00000220888 RETNLBQ9BQ08 111 aa7.62□□□□□ -1.19
TRPS1-201ENST00000220888 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa7.62□□□□□ -1.19
TRPS1-201ENST00000220888 CHD8Q9HCK8 2581 aa7.61□□□□□ -1.19
TRPS1-201ENST00000220888 F8WDY8 70 aa7.61□□□□□ -1.19
TRPS1-201ENST00000220888 A6NED7 52 aa7.61□□□□□ -1.19
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa7.61□□□□□ -1.19
TRPS1-201ENST00000220888 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa7.61□□□□□ -1.19
TRPS1-201ENST00000220888 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa7.6□□□□□ -1.19
TRPS1-201ENST00000220888 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
TRPS1-201ENST00000220888 Q9BRP9 147 aa7.6□□□□□ -1.19
TRPS1-201ENST00000220888 UQCRQO14949 82 aa7.6□□□□□ -1.19
TRPS1-201ENST00000220888 NDUFC1O43677 76 aa7.6□□□□□ -1.19
TRPS1-201ENST00000220888 C11orf21Q9P2W6 132 aa7.6□□□□□ -1.19
TRPS1-201ENST00000220888 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa7.59□□□□□ -1.19
TRPS1-201ENST00000220888 Q6ZPA2 131 aa7.59□□□□□ -1.19
TRPS1-201ENST00000220888 LRRK2Q5S007 2527 aa7.59□□□□□ -1.19
TRPS1-201ENST00000220888 FHL3Q13643 280 aa7.59□□□□□ -1.19
TRPS1-201ENST00000220888 FAM30AQ9NZY2 134 aa7.59□□□□□ -1.19
TRPS1-201ENST00000220888 MDFIQ99750 246 aa7.59□□□□□ -1.19
TRPS1-201ENST00000220888 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
TRPS1-201ENST00000220888 FHL2Q14192 279 aa7.58□□□□□ -1.2
TRPS1-201ENST00000220888 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa7.58□□□□□ -1.2
TRPS1-201ENST00000220888 NRACQ8N912 160 aa7.58□□□□□ -1.2
TRPS1-201ENST00000220888 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
TRPS1-201ENST00000220888 OBSL1O75147 1896 aa7.58□□□□□ -1.2
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF462Q96JM2 2506 aa7.58□□□□□ -1.2
TRPS1-201ENST00000220888 EDN2P20800 178 aa7.58□□□□□ -1.2
TRPS1-201ENST00000220888 SPINK1P00995 79 aa7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-201ENST00000220888 LYPD5Q6UWN5 251 aa7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-201ENST00000220888 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-201ENST00000220888 SNURFQ9Y675 71 aa7.57□□□□□ -1.2
TRPS1-201ENST00000220888 XGP55808 180 aa7.56□□□□□ -1.2
TRPS1-201ENST00000220888 LINC00242Q5T6M2 205 aa7.56□□□□□ -1.2
TRPS1-201ENST00000220888 J3QL48 77 aa7.56□□□□□ -1.2
TRPS1-201ENST00000220888 Q6Q795 121 aa7.56□□□□□ -1.2
TRPS1-201ENST00000220888 COL4A3Q01955 1670 aa7.56□□□□□ -1.2
TRPS1-201ENST00000220888 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-201ENST00000220888 POM121L12Q8N7R1 296 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-201ENST00000220888 TP73-AS1Q9UF72 201 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-201ENST00000220888 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-201ENST00000220888 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-201ENST00000220888 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-201ENST00000220888 Q8N2B8 174 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-201ENST00000220888 CELA1Q9UNI1 258 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-201ENST00000220888 LINC00208Q96KT6 92 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-201ENST00000220888 ALPK3Q96L96 1907 aa7.54□□□□□ -1.2
TRPS1-201ENST00000220888 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
TRPS1-201ENST00000220888 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
TRPS1-201ENST00000220888 LTBP2Q14767 1821 aa7.53□□□□□ -1.2
TRPS1-201ENST00000220888 PLXNB1O43157 2135 aa7.53□□□□□ -1.2
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF580Q9UK33 172 aa7.53□□□□□ -1.2
TRPS1-201ENST00000220888 A0A087WSZ3 146 aa7.53□□□□□ -1.2
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