RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-222ENST00000639501 LINC00308Q8TCZ7 52 aa14.85□□□□□ -0.03
PMS1-222ENST00000639501 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
PMS1-222ENST00000639501 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa14.85□□□□□ -0.03
PMS1-222ENST00000639501 PSMB8P28062 276 aa14.84□□□□□ -0.03
PMS1-222ENST00000639501 Q9H8V8 135 aa14.83□□□□□ -0.04
PMS1-222ENST00000639501 COX7A2LO14548 114 aa14.83□□□□□ -0.04
PMS1-222ENST00000639501 SYNJ2BPP57105 145 aa14.83□□□□□ -0.04
PMS1-222ENST00000639501 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
PMS1-222ENST00000639501 C22orf24Q9Y442 160 aa14.82□□□□□ -0.04
PMS1-222ENST00000639501 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
PMS1-222ENST00000639501 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
PMS1-222ENST00000639501 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
PMS1-222ENST00000639501 CSPG4Q6UVK1 2322 aa14.81□□□□□ -0.04
PMS1-222ENST00000639501 CREBBPQ92793 2442 aa14.8□□□□□ -0.04
PMS1-222ENST00000639501 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa14.8□□□□□ -0.04
PMS1-222ENST00000639501 BEAN1Q3B7T3 259 aa14.8□□□□□ -0.04
PMS1-222ENST00000639501 PPDPFQ9H3Y8 114 aa14.8□□□□□ -0.04
PMS1-222ENST00000639501 FAM218AQ96MZ4 157 aa14.79□□□□□ -0.04
PMS1-222ENST00000639501 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa14.79□□□□□ -0.04
PMS1-222ENST00000639501 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
PMS1-222ENST00000639501 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
PMS1-222ENST00000639501 NDUFA7O95182 113 aa14.79□□□□□ -0.04
PMS1-222ENST00000639501 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
PMS1-222ENST00000639501 VPREB3Q9UKI3 123 aa14.79□□□□□ -0.04
PMS1-222ENST00000639501 TMEM126AQ9H061 195 aa14.78□□□□□ -0.04
PMS1-222ENST00000639501 CUBNO60494 3623 aa14.78□□□□□ -0.04
PMS1-222ENST00000639501 ACYP1P07311 99 aa14.77□□□□□ -0.04
PMS1-222ENST00000639501 RNF152Q8N8N0 203 aa14.77□□□□□ -0.04
PMS1-222ENST00000639501 IMUPQ9GZP8 106 aa14.77□□□□□ -0.04
PMS1-222ENST00000639501 AVPP01185 164 aa14.77□□□□□ -0.05
PMS1-222ENST00000639501 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa14.76□□□□□ -0.05
PMS1-222ENST00000639501 TIRAPP58753 221 aa14.76□□□□□ -0.05
PMS1-222ENST00000639501 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PMS1-222ENST00000639501 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa14.76□□□□□ -0.05
PMS1-222ENST00000639501 LINC00643Q86TS7 51 aa14.75□□□□□ -0.05
PMS1-222ENST00000639501 LINC00242Q5T6M2 205 aa14.75□□□□□ -0.05
PMS1-222ENST00000639501 FBN2P35556 2912 aa14.74□□□□□ -0.05
PMS1-222ENST00000639501 C9orf153Q5TBE3 101 aa14.74□□□□□ -0.05
PMS1-222ENST00000639501 SDIM1Q6ZPB5 146 aa14.74□□□□□ -0.05
PMS1-222ENST00000639501 PTPN13Q12923 2485 aa14.74□□□□□ -0.05
PMS1-222ENST00000639501 BAALC-AS2P0C853 105 aa14.74□□□□□ -0.05
PMS1-222ENST00000639501 POLQO75417 2590 aa14.74□□□□□ -0.05
PMS1-222ENST00000639501 ABCA12Q86UK0 2595 aa14.74□□□□□ -0.05
PMS1-222ENST00000639501 LINC00694P0DN24 101 aa14.73□□□□□ -0.05
PMS1-222ENST00000639501 DEFB131AP59861 70 aa14.73□□□□□ -0.05
PMS1-222ENST00000639501 C3orf22Q8N5N4 141 aa14.73□□□□□ -0.05
PMS1-222ENST00000639501 SMIM1B2RUZ4 78 aa14.73□□□□□ -0.05
PMS1-222ENST00000639501 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
PMS1-222ENST00000639501 IGHV4-59P01825 116 aa14.72□□□□□ -0.05
PMS1-222ENST00000639501 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa14.72□□□□□ -0.05
PMS1-222ENST00000639501 IGHV3-53P01767 116 aa14.71□□□□□ -0.05
PMS1-222ENST00000639501 PLA2G2AP14555 144 aa14.71□□□□□ -0.05
PMS1-222ENST00000639501 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa14.71□□□□□ -0.05
PMS1-222ENST00000639501 PIMREGQ9BSJ6 248 aa14.71□□□□□ -0.05
PMS1-222ENST00000639501 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
PMS1-222ENST00000639501 Q9HAA7 133 aa14.71□□□□□ -0.05
PMS1-222ENST00000639501 TRACP01848 142 aa14.7□□□□□ -0.06
PMS1-222ENST00000639501 ZNF415Q09FC8 603 aa14.7□□□□□ -0.06
PMS1-222ENST00000639501 C11orf72Q8NBR9 251 aa14.7□□□□□ -0.06
PMS1-222ENST00000639501 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PMS1-222ENST00000639501 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa14.69□□□□□ -0.06
PMS1-222ENST00000639501 PRIMA1Q86XR5 153 aa14.69□□□□□ -0.06
PMS1-222ENST00000639501 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa14.69□□□□□ -0.06
PMS1-222ENST00000639501 HERVK_113P63121 156 aa14.69□□□□□ -0.06
PMS1-222ENST00000639501 C10orf105Q8TEF2 133 aa14.69□□□□□ -0.06
PMS1-222ENST00000639501 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PMS1-222ENST00000639501 J3QKU1 62 aa14.68□□□□□ -0.06
PMS1-222ENST00000639501 CCL19Q99731 98 aa14.68□□□□□ -0.06
PMS1-222ENST00000639501 GAGE2AQ6NT46 116 aa14.68□□□□□ -0.06
PMS1-222ENST00000639501 C5orf38Q86SI9 138 aa14.68□□□□□ -0.06
PMS1-222ENST00000639501 PEMTQ9UBM1 199 aa14.68□□□□□ -0.06
PMS1-222ENST00000639501 UQCRQO14949 82 aa14.67□□□□□ -0.06
PMS1-222ENST00000639501 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa14.67□□□□□ -0.06
PMS1-222ENST00000639501 NRGNQ92686 78 aa14.67□□□□□ -0.06
PMS1-222ENST00000639501 MSMBP08118 114 aa14.66□□□□□ -0.06
PMS1-222ENST00000639501 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PMS1-222ENST00000639501 LINC00526Q96FQ7 95 aa14.66□□□□□ -0.06
PMS1-222ENST00000639501 TMEM89A2RUT3 159 aa14.66□□□□□ -0.06
PMS1-222ENST00000639501 DNAJC30Q96LL9 226 aa14.66□□□□□ -0.06
PMS1-222ENST00000639501 DEFB136Q30KP8 78 aa14.65□□□□□ -0.06
PMS1-222ENST00000639501 F5H768 121 aa14.65□□□□□ -0.06
PMS1-222ENST00000639501 DEFB112Q30KQ8 113 aa14.65□□□□□ -0.06
PMS1-222ENST00000639501 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa14.65□□□□□ -0.06
PMS1-222ENST00000639501 A8MTW9 85 aa14.64□□□□□ -0.07
PMS1-222ENST00000639501 C18orf65Q6ZTR6 163 aa14.64□□□□□ -0.07
PMS1-222ENST00000639501 FASNP49327 2511 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PMS1-222ENST00000639501 C2orf48Q96LS8 159 aa14.64□□□□□ -0.07
PMS1-222ENST00000639501 RS1O15537 224 aa14.63□□□□□ -0.07
PMS1-222ENST00000639501 SLURP1P55000 103 aa14.63□□□□□ -0.07
PMS1-222ENST00000639501 FAM222AQ5U5X8 452 aa14.63□□□□□ -0.07
PMS1-222ENST00000639501 Q96MF0 132 aa14.63□□□□□ -0.07
PMS1-222ENST00000639501 APCP25054 2843 aa14.63□□□□□ -0.07
PMS1-222ENST00000639501 ZANQ9Y493 2812 aa14.62□□□□□ -0.07
PMS1-222ENST00000639501 MALP21145 153 aa14.62□□□□□ -0.07
PMS1-222ENST00000639501 CXCL5P42830 114 aa14.62□□□□□ -0.07
PMS1-222ENST00000639501 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa14.62□□□□□ -0.07
PMS1-222ENST00000639501 CYSTM1Q9H1C7 97 aa14.62□□□□□ -0.07
PMS1-222ENST00000639501 AKAP9Q99996 3911 aa14.61□□□□□ -0.07
PMS1-222ENST00000639501 LINC00337Q8N6G1 96 aa14.61□□□□□ -0.07
PMS1-222ENST00000639501 NAV2Q8IVL1 2488 aa14.61□□□□□ -0.07
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