RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637694.1

CNTNAP2-222, Transcript of contactin associated protein like 2, human

TSL 5

Gene CNTNAP2, Length 2,213 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KNCN	A6PVL3	124 aa		6.36	□□□□□ -1.39
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CD28	P10747	220 aa		6.36	□□□□□ -1.39
CNTNAP2-222	ENST00000637694	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		6.36	□□□□□ -1.39
CNTNAP2-222	ENST00000637694	LY6G5B	Q8NDX9	201 aa		6.36	□□□□□ -1.39
CNTNAP2-222	ENST00000637694	HELZ2	Q9BYK8	2649 aa	Known RBP	6.36	□□□□□ -1.39
CNTNAP2-222	ENST00000637694	NDUFA1	O15239	70 aa		6.35	□□□□□ -1.39
CNTNAP2-222	ENST00000637694	COL12A1	Q99715	3063 aa		6.35	□□□□□ -1.39
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PIEZO2	Q9H5I5	2752 aa		6.35	□□□□□ -1.39
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SS18	Q15532	418 aa		6.35	□□□□□ -1.39
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ROS1	P08922	2347 aa		6.35	□□□□□ -1.39
CNTNAP2-222	ENST00000637694		A0A087WYN8	130 aa		6.34	□□□□□ -1.39
CNTNAP2-222	ENST00000637694		A0A1W2PNU3	283 aa	Predicted RBP	6.34	□□□□□ -1.39
CNTNAP2-222	ENST00000637694	C15orf32	Q32M92	178 aa		6.34	□□□□□ -1.39
CNTNAP2-222	ENST00000637694	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		6.34	□□□□□ -1.39
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	6.34	□□□□□ -1.39
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		6.34	□□□□□ -1.39
CNTNAP2-222	ENST00000637694		F6UB75	175 aa		6.34	□□□□□ -1.39
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		6.34	□□□□□ -1.39
CNTNAP2-222	ENST00000637694	NCR3	O14931	201 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CCK	P06307	115 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CCDC140	Q96MF4	163 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CNTNAP2-222	ENST00000637694		U3KQE9	123 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CNTNAP2-222	ENST00000637694	POLE	Q07864	2286 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ABCA4	P78363	2273 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KLKP1	Q107X0	134 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CNTNAP2-222	ENST00000637694	HIST2H2BC	Q6DN03	193 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CNTNAP2-222	ENST00000637694	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ENHO	Q6UWT2	76 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	6.33	□□□□□ -1.4
CNTNAP2-222	ENST00000637694		Q9H8V8	135 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ZNF462	Q96JM2	2506 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CCL21	O00585	134 aa		6.32	□□□□□ -1.4
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ATP1A1-AS1	Q5TC04	95 aa		6.32	□□□□□ -1.4
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		6.32	□□□□□ -1.4
CNTNAP2-222	ENST00000637694	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	6.31	□□□□□ -1.4
CNTNAP2-222	ENST00000637694	RMI2	Q96E14	147 aa		6.31	□□□□□ -1.4
CNTNAP2-222	ENST00000637694	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		6.31	□□□□□ -1.4
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SNURF	Q9Y675	71 aa		6.31	□□□□□ -1.4
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ASH1L	Q9NR48	2969 aa	Known RBP	6.31	□□□□□ -1.4
CNTNAP2-222	ENST00000637694		F8WEM9	126 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SOCS3	O14543	225 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SIRPD	Q9H106	197 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CNTNAP2-222	ENST00000637694	FLNB	O75369	2602 aa	Known RBP	6.3	□□□□□ -1.4
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PKDREJ	Q9NTG1	2253 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TRAV7	A0A075B6U4	112 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CNTNAP2-222	ENST00000637694	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CNTNAP2-222	ENST00000637694	RBM3	P98179	157 aa	Known RBP	6.3	□□□□□ -1.4
CNTNAP2-222	ENST00000637694	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ATP5EP2	Q5VTU8	51 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CNTNAP2-222	ENST00000637694	DPM3	Q9P2X0	92 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CNTNAP2-222	ENST00000637694	RELN	P78509	3460 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ZFHX3	Q15911	3703 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CNTNAP2-222	ENST00000637694	RP1L1	Q8IWN7	2480 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
CNTNAP2-222	ENST00000637694	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KLLN	B2CW77	178 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ZNF843	Q8N446	348 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CNTNAP2-222	ENST00000637694	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CNTNAP2-222	ENST00000637694	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CNTNAP2-222	ENST00000637694	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CNTNAP2-222	ENST00000637694		A0A1W2PRX2	142 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CNTNAP2-222	ENST00000637694	COX6A2	Q02221	97 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ADGRG4	Q8IZF6	3080 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CNTNAP2-222	ENST00000637694	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		6.27	□□□□□ -1.4
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SLPI	P03973	132 aa		6.27	□□□□□ -1.4
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ECSCR	Q19T08	205 aa		6.27	□□□□□ -1.4
CNTNAP2-222	ENST00000637694	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		6.27	□□□□□ -1.4
CNTNAP2-222	ENST00000637694	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		6.27	□□□□□ -1.4
CNTNAP2-222	ENST00000637694	COPS9	Q8WXC6	57 aa		6.27	□□□□□ -1.4
CNTNAP2-222	ENST00000637694	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		6.27	□□□□□ -1.4
CNTNAP2-222	ENST00000637694	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CNTNAP2-222	ENST00000637694	LECT2	O14960	151 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CNTNAP2-222	ENST00000637694	IGKV2D-28	P01615	120 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PLA2G2A	P14555	144 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CFHR3	Q02985	330 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CNTNAP2-222	ENST00000637694		Q8N6K4	173 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SMIM11B	Q8TCY0	68 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CNTNAP2-222	ENST00000637694	COL6A6	A6NMZ7	2263 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CNTNAP2-222	ENST00000637694	UTP20	O75691	2785 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CNTNAP2-222	ENST00000637694	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PMAIP1	Q13794	54 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CNTNAP2-222	ENST00000637694	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CNTNAP2-222	ENST00000637694	IGFL2	Q6UWQ7	119 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CNTNAP2-222	ENST00000637694	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CRP	P02741	224 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PF4	P02776	101 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CNTNAP2-222	ENST00000637694		Q9UF83	564 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CNTNAP2-222	ENST00000637694	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		6.25	□□□□□ -1.41

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