RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617928.4

CYFIP1-208, Transcript of cytoplasmic FMR1 interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CYFIP1, Length 6,793 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP1-208ENST00000617928 MED13LQ71F56 2210 aa6.47□□□□□ -1.37
CYFIP1-208ENST00000617928 SDIM1Q6ZPB5 146 aa6.47□□□□□ -1.37
CYFIP1-208ENST00000617928 PLAC8L1A1L4L8 177 aa6.46□□□□□ -1.37
CYFIP1-208ENST00000617928 A6NED7 52 aa6.46□□□□□ -1.37
CYFIP1-208ENST00000617928 C3orf84H3BNL1 204 aa6.46□□□□□ -1.37
CYFIP1-208ENST00000617928 ZNF702PQ9H963 129 aa6.46□□□□□ -1.37
CYFIP1-208ENST00000617928 DENND4CQ5VZ89 1909 aa6.46□□□□□ -1.38
CYFIP1-208ENST00000617928 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa6.46□□□□□ -1.38
CYFIP1-208ENST00000617928 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa6.46□□□□□ -1.38
CYFIP1-208ENST00000617928 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa6.46□□□□□ -1.38
CYFIP1-208ENST00000617928 HIVEP2P31629 2446 aa6.46□□□□□ -1.38
CYFIP1-208ENST00000617928 Q6ZSR3 168 aa6.46□□□□□ -1.38
CYFIP1-208ENST00000617928 C22orf34Q6ZV56 151 aa6.45□□□□□ -1.38
CYFIP1-208ENST00000617928 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CYFIP1-208ENST00000617928 SHANK1Q9Y566 2161 aa6.45□□□□□ -1.38
CYFIP1-208ENST00000617928 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa6.45□□□□□ -1.38
CYFIP1-208ENST00000617928 HIGD1BQ9P298 99 aa6.45□□□□□ -1.38
CYFIP1-208ENST00000617928 FAM208BQ5VWN6 2430 aa6.45□□□□□ -1.38
CYFIP1-208ENST00000617928 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa6.45□□□□□ -1.38
CYFIP1-208ENST00000617928 H3BT86 120 aa6.45□□□□□ -1.38
CYFIP1-208ENST00000617928 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa6.45□□□□□ -1.38
CYFIP1-208ENST00000617928 PIEZO1Q92508 2521 aa6.44□□□□□ -1.38
CYFIP1-208ENST00000617928 LTBP2Q14767 1821 aa6.44□□□□□ -1.38
CYFIP1-208ENST00000617928 TCL1BO95988 128 aa6.44□□□□□ -1.38
CYFIP1-208ENST00000617928 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa6.44□□□□□ -1.38
CYFIP1-208ENST00000617928 C19orf71A6NCJ1 209 aa6.44□□□□□ -1.38
CYFIP1-208ENST00000617928 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa6.44□□□□□ -1.38
CYFIP1-208ENST00000617928 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa6.44□□□□□ -1.38
CYFIP1-208ENST00000617928 SMIM26A0A096LP01 95 aa6.44□□□□□ -1.38
CYFIP1-208ENST00000617928 MUC6Q6W4X9 2439 aa6.44□□□□□ -1.38
CYFIP1-208ENST00000617928 CCKP06307 115 aa6.43□□□□□ -1.38
CYFIP1-208ENST00000617928 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa6.43□□□□□ -1.38
CYFIP1-208ENST00000617928 WFDC13Q8IUB5 93 aa6.43□□□□□ -1.38
CYFIP1-208ENST00000617928 C6orf99Q4VX62 202 aa6.43□□□□□ -1.38
CYFIP1-208ENST00000617928 C11orf71Q6IPW1 123 aa6.43□□□□□ -1.38
CYFIP1-208ENST00000617928 ENHOQ6UWT2 76 aa6.43□□□□□ -1.38
CYFIP1-208ENST00000617928 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.42□□□□□ -1.38
CYFIP1-208ENST00000617928 PRR15LQ9BU68 103 aa6.42□□□□□ -1.38
CYFIP1-208ENST00000617928 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.42□□□□□ -1.38
CYFIP1-208ENST00000617928 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa6.42□□□□□ -1.38
CYFIP1-208ENST00000617928 XGP55808 180 aa6.42□□□□□ -1.38
CYFIP1-208ENST00000617928 LELP1Q5T871 98 aa6.42□□□□□ -1.38
CYFIP1-208ENST00000617928 COX7CP15954 63 aa6.42□□□□□ -1.38
CYFIP1-208ENST00000617928 SNURFQ9Y675 71 aa6.42□□□□□ -1.38
CYFIP1-208ENST00000617928 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa6.42□□□□□ -1.38
CYFIP1-208ENST00000617928 LINC00474Q9P2X8 69 aa6.42□□□□□ -1.38
CYFIP1-208ENST00000617928 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
CYFIP1-208ENST00000617928 PRM2P04554 102 aa6.42□□□□□ -1.38
CYFIP1-208ENST00000617928 SERP2Q8N6R1 65 aa6.42□□□□□ -1.38
CYFIP1-208ENST00000617928 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa6.42□□□□□ -1.38
CYFIP1-208ENST00000617928 CUL9Q8IWT3 2517 aa6.41□□□□□ -1.38
CYFIP1-208ENST00000617928 TMEM223A0PJW6 202 aa6.41□□□□□ -1.38
CYFIP1-208ENST00000617928 DSCAML1Q8TD84 2053 aa6.41□□□□□ -1.38
CYFIP1-208ENST00000617928 C2orf16Q68DN1 1984 aa6.41□□□□□ -1.38
CYFIP1-208ENST00000617928 FSHBP01225 129 aa6.41□□□□□ -1.38
CYFIP1-208ENST00000617928 M0R378 163 aa6.41□□□□□ -1.38
CYFIP1-208ENST00000617928 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.41□□□□□ -1.38
CYFIP1-208ENST00000617928 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.41□□□□□ -1.38
CYFIP1-208ENST00000617928 OBSL1O75147 1896 aa6.4□□□□□ -1.38
CYFIP1-208ENST00000617928 IGLV2-8P01709 118 aa6.4□□□□□ -1.38
CYFIP1-208ENST00000617928 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
CYFIP1-208ENST00000617928 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
CYFIP1-208ENST00000617928 M0QY20 66 aa6.4□□□□□ -1.38
CYFIP1-208ENST00000617928 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.4□□□□□ -1.38
CYFIP1-208ENST00000617928 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa6.4□□□□□ -1.38
CYFIP1-208ENST00000617928 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.4□□□□□ -1.38
CYFIP1-208ENST00000617928 Q6ZS46 218 aa6.4□□□□□ -1.39
CYFIP1-208ENST00000617928 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
CYFIP1-208ENST00000617928 ZFAND3Q9H8U3 227 aa6.4□□□□□ -1.39
CYFIP1-208ENST00000617928 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
CYFIP1-208ENST00000617928 Q6ZVQ6 151 aa6.39□□□□□ -1.39
CYFIP1-208ENST00000617928 PRR4Q16378 134 aa6.39□□□□□ -1.39
CYFIP1-208ENST00000617928 PRO0628Q9UI54 55 aa6.39□□□□□ -1.39
CYFIP1-208ENST00000617928 A8MZ25 164 aa6.39□□□□□ -1.39
CYFIP1-208ENST00000617928 BRI3O95415 125 aa6.39□□□□□ -1.39
CYFIP1-208ENST00000617928 TP73-AS1Q9UF72 201 aa6.39□□□□□ -1.39
CYFIP1-208ENST00000617928 IGLV2-11P01706 119 aa6.39□□□□□ -1.39
CYFIP1-208ENST00000617928 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa6.39□□□□□ -1.39
CYFIP1-208ENST00000617928 DSCAMO60469 2012 aa6.39□□□□□ -1.39
CYFIP1-208ENST00000617928 TECTAO75443 2155 aa6.39□□□□□ -1.39
CYFIP1-208ENST00000617928 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa6.38□□□□□ -1.39
CYFIP1-208ENST00000617928 RETNLBQ9BQ08 111 aa6.38□□□□□ -1.39
CYFIP1-208ENST00000617928 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa6.38□□□□□ -1.39
CYFIP1-208ENST00000617928 X6R8D5 127 aa6.38□□□□□ -1.39
CYFIP1-208ENST00000617928 COL4A3Q01955 1670 aa6.38□□□□□ -1.39
CYFIP1-208ENST00000617928 C10orf25Q5T742 122 aa6.38□□□□□ -1.39
CYFIP1-208ENST00000617928 LINC00574Q9H8X3 128 aa6.38□□□□□ -1.39
CYFIP1-208ENST00000617928 EBI3Q14213 229 aa6.37□□□□□ -1.39
CYFIP1-208ENST00000617928 Q6ZQY7 126 aa6.37□□□□□ -1.39
CYFIP1-208ENST00000617928 RPL28P46779 137 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
CYFIP1-208ENST00000617928 Q8N9L7 120 aa6.37□□□□□ -1.39
CYFIP1-208ENST00000617928 NDUFC1O43677 76 aa6.37□□□□□ -1.39
CYFIP1-208ENST00000617928 U3KQK5 164 aa6.36□□□□□ -1.39
CYFIP1-208ENST00000617928 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa6.36□□□□□ -1.39
CYFIP1-208ENST00000617928 KRTAP10-9P60411 292 aa6.36□□□□□ -1.39
CYFIP1-208ENST00000617928 BDP1A6H8Y1 2624 aa6.36□□□□□ -1.39
CYFIP1-208ENST00000617928 FSTL3O95633 263 aa6.35□□□□□ -1.39
CYFIP1-208ENST00000617928 IMUPQ9GZP8 106 aa6.35□□□□□ -1.39
CYFIP1-208ENST00000617928 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.35□□□□□ -1.39
CYFIP1-208ENST00000617928 A0A1B0GXF2 115 aa6.35□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 90.6 ms