RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608107.1

ITGB5-211, Transcript of integrin subunit beta 5, humanhuman

TSL 3

Gene ITGB5, Length 548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB5-211ENST00000608107 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa6.9□□□□□ -1.3
ITGB5-211ENST00000608107 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa6.89□□□□□ -1.31
ITGB5-211ENST00000608107 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa6.89□□□□□ -1.31
ITGB5-211ENST00000608107 IGIPA6NJ69 53 aa6.89□□□□□ -1.31
ITGB5-211ENST00000608107 HSBP1O75506 76 aa6.89□□□□□ -1.31
ITGB5-211ENST00000608107 HBDP02042 147 aa6.89□□□□□ -1.31
ITGB5-211ENST00000608107 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
ITGB5-211ENST00000608107 PKIAP61925 76 aa6.89□□□□□ -1.31
ITGB5-211ENST00000608107 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa6.89□□□□□ -1.31
ITGB5-211ENST00000608107 LINC00173Q6ZV60 143 aa6.89□□□□□ -1.31
ITGB5-211ENST00000608107 ZNF664Q8N3J9 261 aa6.89□□□□□ -1.31
ITGB5-211ENST00000608107 UBE2WQ96B02 151 aa6.89□□□□□ -1.31
ITGB5-211ENST00000608107 TMEM101Q96IK0 257 aa6.89□□□□□ -1.31
ITGB5-211ENST00000608107 SCGB3A1Q96QR1 104 aa6.89□□□□□ -1.31
ITGB5-211ENST00000608107 SPANXA1Q9NS26 97 aa6.89□□□□□ -1.31
ITGB5-211ENST00000608107 DNAH6Q9C0G6 4158 aa6.89□□□□□ -1.31
ITGB5-211ENST00000608107 KMT2AQ03164 3969 aa6.88□□□□□ -1.31
ITGB5-211ENST00000608107 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa6.88□□□□□ -1.31
ITGB5-211ENST00000608107 PDZD11Q5EBL8 140 aa6.88□□□□□ -1.31
ITGB5-211ENST00000608107 TTC32Q5I0X7 151 aa6.88□□□□□ -1.31
ITGB5-211ENST00000608107 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
ITGB5-211ENST00000608107 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa6.88□□□□□ -1.31
ITGB5-211ENST00000608107 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
ITGB5-211ENST00000608107 G0S2P27469 103 aa6.87□□□□□ -1.31
ITGB5-211ENST00000608107 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
ITGB5-211ENST00000608107 REG3AQ06141 175 aa6.87□□□□□ -1.31
ITGB5-211ENST00000608107 ERASQ7Z444 233 aa6.87□□□□□ -1.31
ITGB5-211ENST00000608107 C10orf126Q8N4M7 172 aa6.87□□□□□ -1.31
ITGB5-211ENST00000608107 PRR34Q9NV39 138 aa6.87□□□□□ -1.31
ITGB5-211ENST00000608107 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa6.86□□□□□ -1.31
ITGB5-211ENST00000608107 FABP4P15090 132 aa6.86□□□□□ -1.31
ITGB5-211ENST00000608107 TMEM141Q96I45 108 aa6.86□□□□□ -1.31
ITGB5-211ENST00000608107 TIMM17AQ99595 171 aa6.86□□□□□ -1.31
ITGB5-211ENST00000608107 HYDINQ4G0P3 5121 aa6.86□□□□□ -1.31
ITGB5-211ENST00000608107 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa6.85□□□□□ -1.31
ITGB5-211ENST00000608107 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa6.85□□□□□ -1.31
ITGB5-211ENST00000608107 K7EP13 123 aa6.85□□□□□ -1.31
ITGB5-211ENST00000608107 CRPP02741 224 aa6.85□□□□□ -1.31
ITGB5-211ENST00000608107 SMAGPQ0VAQ4 97 aa6.85□□□□□ -1.31
ITGB5-211ENST00000608107 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.85□□□□□ -1.31
ITGB5-211ENST00000608107 AMELXQ99217 191 aa6.85□□□□□ -1.31
ITGB5-211ENST00000608107 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
ITGB5-211ENST00000608107 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa6.84□□□□□ -1.31
ITGB5-211ENST00000608107 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.84□□□□□ -1.31
ITGB5-211ENST00000608107 IFITM10A6NMD0 228 aa6.84□□□□□ -1.31
ITGB5-211ENST00000608107 C1orf134Q5TEV5 83 aa6.84□□□□□ -1.31
ITGB5-211ENST00000608107 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
ITGB5-211ENST00000608107 C6orf223Q8N319 242 aa6.84□□□□□ -1.31
ITGB5-211ENST00000608107 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa6.84□□□□□ -1.31
ITGB5-211ENST00000608107 BAALCQ8WXS3 180 aa6.84□□□□□ -1.31
ITGB5-211ENST00000608107 IFI27L1Q96BM0 104 aa6.84□□□□□ -1.31
ITGB5-211ENST00000608107 VCX2Q9H322 139 aa6.84□□□□□ -1.31
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ITGB5-211ENST00000608107 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
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ITGB5-211ENST00000608107 TEX43Q6ZNM6 134 aa6.83□□□□□ -1.32
ITGB5-211ENST00000608107 CCL25O15444 150 aa6.82□□□□□ -1.32
ITGB5-211ENST00000608107 NPSP0C0P6 89 aa6.82□□□□□ -1.32
ITGB5-211ENST00000608107 XCL1P47992 114 aa6.82□□□□□ -1.32
ITGB5-211ENST00000608107 UBE2D1P51668 147 aa6.82□□□□□ -1.32
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ITGB5-211ENST00000608107 HIST3H2BBQ8N257 126 aa6.82□□□□□ -1.32
ITGB5-211ENST00000608107 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
ITGB5-211ENST00000608107 C1orf43Q9BWL3 253 aa6.82□□□□□ -1.32
ITGB5-211ENST00000608107 CST9LQ9H4G1 147 aa6.82□□□□□ -1.32
ITGB5-211ENST00000608107 DNAH10Q8IVF4 4471 aa6.82□□□□□ -1.32
ITGB5-211ENST00000608107 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa6.81□□□□□ -1.32
ITGB5-211ENST00000608107 GAGE12HA6NDE8 117 aa6.81□□□□□ -1.32
ITGB5-211ENST00000608107 S100A6P06703 90 aa6.81□□□□□ -1.32
ITGB5-211ENST00000608107 PRSS1P07477 247 aa6.81□□□□□ -1.32
ITGB5-211ENST00000608107 PMVKQ15126 192 aa6.81□□□□□ -1.32
ITGB5-211ENST00000608107 SS18Q15532 418 aa6.81□□□□□ -1.32
ITGB5-211ENST00000608107 LINC00242Q5T6M2 205 aa6.81□□□□□ -1.32
ITGB5-211ENST00000608107 DNAH2Q9P225 4427 aa6.81□□□□□ -1.32
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ITGB5-211ENST00000608107 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa6.8□□□□□ -1.32
ITGB5-211ENST00000608107 SPATA12Q7Z6I5 190 aa6.8□□□□□ -1.32
ITGB5-211ENST00000608107 NFE4Q86UQ8 179 aa6.8□□□□□ -1.32
ITGB5-211ENST00000608107 RMI2Q96E14 147 aa6.8□□□□□ -1.32
ITGB5-211ENST00000608107 C2orf88Q9BSF0 95 aa6.8□□□□□ -1.32
ITGB5-211ENST00000608107 DNAH17Q9UFH2 4485 aa6.79□□□□□ -1.32
ITGB5-211ENST00000608107 C5orf52A6NGY3 159 aa6.79□□□□□ -1.32
ITGB5-211ENST00000608107 H0Y8G0 127 aa6.79□□□□□ -1.32
ITGB5-211ENST00000608107 LECT2O14960 151 aa6.79□□□□□ -1.32
ITGB5-211ENST00000608107 PSCAO43653 123 aa6.79□□□□□ -1.32
ITGB5-211ENST00000608107 TNP2Q05952 138 aa6.79□□□□□ -1.32
ITGB5-211ENST00000608107 FOXI1Q12951 378 aa6.79□□□□□ -1.32
ITGB5-211ENST00000608107 C5orf38Q86SI9 138 aa6.79□□□□□ -1.32
ITGB5-211ENST00000608107 HSPB8Q9UJY1 196 aa6.79□□□□□ -1.32
ITGB5-211ENST00000608107 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa6.78□□□□□ -1.32
ITGB5-211ENST00000608107 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa6.78□□□□□ -1.32
ITGB5-211ENST00000608107 HIST1H2BLQ99880 126 aa6.78□□□□□ -1.32
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