RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592576.5

EFTUD2-223, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-223	ENST00000592576		Q6ZN92	141 aa		6.3	□□□□□ -1.4
EFTUD2-223	ENST00000592576	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	6.3	□□□□□ -1.4
EFTUD2-223	ENST00000592576	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	6.3	□□□□□ -1.4
EFTUD2-223	ENST00000592576	UBE2V1	Q13404	147 aa		6.3	□□□□□ -1.4
EFTUD2-223	ENST00000592576	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		6.3	□□□□□ -1.4
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMEM243	Q9BU79	118 aa		6.3	□□□□□ -1.4
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMEM238	C9JI98	176 aa		6.29	□□□□□ -1.4
EFTUD2-223	ENST00000592576		H0Y8G0	127 aa		6.29	□□□□□ -1.4
EFTUD2-223	ENST00000592576	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
EFTUD2-223	ENST00000592576	TIRAP	P58753	221 aa		6.29	□□□□□ -1.4
EFTUD2-223	ENST00000592576	LELP1	Q5T871	98 aa		6.29	□□□□□ -1.4
EFTUD2-223	ENST00000592576	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		6.29	□□□□□ -1.4
EFTUD2-223	ENST00000592576	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		6.29	□□□□□ -1.4
EFTUD2-223	ENST00000592576	HBD	P02042	147 aa		6.29	□□□□□ -1.4
EFTUD2-223	ENST00000592576	SPATA45	Q537H7	98 aa		6.29	□□□□□ -1.4
EFTUD2-223	ENST00000592576	CCL18	P55774	89 aa		6.28	□□□□□ -1.4
EFTUD2-223	ENST00000592576	CYSLTR1	Q9Y271	337 aa		6.28	□□□□□ -1.4
EFTUD2-223	ENST00000592576	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		6.28	□□□□□ -1.4
EFTUD2-223	ENST00000592576	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		6.28	□□□□□ -1.4
EFTUD2-223	ENST00000592576	TCTA	P57738	103 aa		6.28	□□□□□ -1.4
EFTUD2-223	ENST00000592576	GAGE6	Q13070	117 aa		6.28	□□□□□ -1.4
EFTUD2-223	ENST00000592576	UBE2L6	O14933	153 aa		6.27	□□□□□ -1.4
EFTUD2-223	ENST00000592576	CASC10	Q5T4H9	136 aa		6.27	□□□□□ -1.4
EFTUD2-223	ENST00000592576	TOMM6	Q96B49	74 aa		6.27	□□□□□ -1.4
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMEM262	E9PQX1	116 aa		6.27	□□□□□ -1.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		6.27	□□□□□ -1.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		6.27	□□□□□ -1.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	FGF6	P10767	208 aa		6.27	□□□□□ -1.41
EFTUD2-223	ENST00000592576		Q8N3U1	123 aa		6.27	□□□□□ -1.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	VPS25	Q9BRG1	176 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	LEPROTL1	O95214	131 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EFTUD2-223	ENST00000592576		Q8N976	141 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	COX11	Q9Y6N1	276 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	IGIP	A6NJ69	53 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	C3orf84	H3BNL1	204 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	MPV17L2	Q567V2	206 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
EFTUD2-223	ENST00000592576		H7C423	109 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFTUD2-223	ENST00000592576		A0A087WX48	190 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	ERAS	Q7Z444	233 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM104A	Q969W3	186 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	LINC01549	A6NIU2	74 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	VAMP3	Q15836	100 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	OCIAD2	Q56VL3	154 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	TIMM17A	Q99595	171 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	UPK3B	Q9BT76	320 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		6.23	□□□□□ -1.41
EFTUD2-223	ENST00000592576		A0A1B0GUV1	79 aa		6.23	□□□□□ -1.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	IGHV3-30	P01768	117 aa		6.23	□□□□□ -1.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	IGHV3-33	P01772	117 aa		6.23	□□□□□ -1.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		6.23	□□□□□ -1.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		6.23	□□□□□ -1.41
EFTUD2-223	ENST00000592576		Q6ZUT4	128 aa		6.23	□□□□□ -1.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	CST9L	Q9H4G1	147 aa		6.23	□□□□□ -1.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		6.23	□□□□□ -1.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		6.23	□□□□□ -1.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	SIVA1	O15304	175 aa		6.23	□□□□□ -1.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	ATP5L	O75964	103 aa		6.23	□□□□□ -1.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	C3orf79	P0CE67	100 aa		6.23	□□□□□ -1.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		6.23	□□□□□ -1.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMEM101	Q96IK0	257 aa		6.23	□□□□□ -1.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	IGLC3	P0DOY3	106 aa		6.23	□□□□□ -1.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		6.23	□□□□□ -1.41
EFTUD2-223	ENST00000592576		Q9H8V8	135 aa		6.23	□□□□□ -1.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		6.23	□□□□□ -1.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		6.22	□□□□□ -1.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMEM141	Q96I45	108 aa		6.22	□□□□□ -1.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		6.22	□□□□□ -1.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		6.22	□□□□□ -1.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	BAALC	Q8WXS3	180 aa		6.21	□□□□□ -1.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	PRSS1	P07477	247 aa		6.21	□□□□□ -1.42
EFTUD2-223	ENST00000592576	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		6.21	□□□□□ -1.42
EFTUD2-223	ENST00000592576	VCX2	Q9H322	139 aa		6.21	□□□□□ -1.42
EFTUD2-223	ENST00000592576	KLK12	Q9UKR0	248 aa		6.21	□□□□□ -1.42
EFTUD2-223	ENST00000592576	KMT2A	Q03164	3969 aa		6.21	□□□□□ -1.42
EFTUD2-223	ENST00000592576	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		6.21	□□□□□ -1.42
EFTUD2-223	ENST00000592576	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		6.2	□□□□□ -1.42
EFTUD2-223	ENST00000592576	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		6.2	□□□□□ -1.42
EFTUD2-223	ENST00000592576	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		6.2	□□□□□ -1.42
EFTUD2-223	ENST00000592576	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		6.2	□□□□□ -1.42

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 116.1 ms