RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 ESM1Q9NQ30 184 aa6.65□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 CENPEQ02224 2701 aa6.65□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 APOMO95445 188 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 TSPAN13O95857 204 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 PCP4P48539 62 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 PROK1P58294 105 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 C10orf126Q8N4M7 172 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 LINC01006Q8NI28 216 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 COPS9Q8WXC6 57 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 PRO1854Q9UHT4 67 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 ITPR2Q14571 2701 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 HILS1P60008 231 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 UBE2D3P61077 147 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 UBE2D2P62837 147 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP1-1Q07627 177 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 Q6ZUT4 128 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 C1orf158Q8N1D5 194 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 C11orf44Q8N8P7 122 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 UNC79Q9P2D8 2635 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 A0A0J9YXY3 114 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 H3BMG7 143 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 TIMM17BO60830 172 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 IGLV1-51P01701 117 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 TIRAPP58753 221 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 HERVK_113P63121 156 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 Q6ZSN1 163 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 LINC00482Q8N8I6 264 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 VSIG2Q96IQ7 327 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 SPANXCQ9NY87 97 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa6.61□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 H7C423 109 aa6.61□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 UBE2L6O14933 153 aa6.61□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 CFC1BP0CG36 223 aa6.61□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 CFC1P0CG37 223 aa6.61□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 PSMB2P49721 201 aa6.61□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 ZFAND6Q6FIF0 208 aa6.61□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM101Q96IK0 257 aa6.61□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 ERG28Q9UKR5 140 aa6.61□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 FBN2P35556 2912 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 CSMD1Q96PZ7 3565 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 ABCA12Q86UK0 2595 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 TRGV2A0A075B6R0 118 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 A4D1N5 150 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 IFITM1P13164 125 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 MIAQ16674 131 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 Q1RN00 199 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 RNF183Q96D59 192 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 GTSF1LQ9H1H1 148 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 CELSR2Q9HCU4 2923 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 NDUFA1O15239 70 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 PRM2P04554 102 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 SPINK8P0C7L1 97 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 WFDC2Q14508 124 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 Q6ZTI0 123 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM104AQ969W3 186 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM243Q9BU79 118 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 PRO0461Q9UI25 63 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 AGRNO00468 2067 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-222ENST00000592408 MAST4O15021 2626 aa6.59□□□□□ -1.36
EFTUD2-222ENST00000592408 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa6.58□□□□□ -1.36
EFTUD2-222ENST00000592408 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
EFTUD2-222ENST00000592408 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.58□□□□□ -1.36
EFTUD2-222ENST00000592408 OVOL2Q9BRP0 275 aa6.58□□□□□ -1.36
EFTUD2-222ENST00000592408 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
EFTUD2-222ENST00000592408 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-222ENST00000592408 GAGE12JA6NER3 117 aa6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-222ENST00000592408 B5MCH6 92 aa6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-222ENST00000592408 M0QXV9 152 aa6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-222ENST00000592408 IGHV3-33P01772 117 aa6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-222ENST00000592408 COX6CP09669 75 aa6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-222ENST00000592408 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-222ENST00000592408 GAGE4Q13068 117 aa6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-222ENST00000592408 GAGE5Q13069 117 aa6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-222ENST00000592408 ATXN8Q156A1 80 aa6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-222ENST00000592408 ETDBQ3ZM63 59 aa6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-222ENST00000592408 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-222ENST00000592408 APCP25054 2843 aa6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-222ENST00000592408 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-222ENST00000592408 POLQO75417 2590 aa6.56□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms