RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 UQCR10Q9UDW1 63 aa15.88■□□□□ 0.13
CAPNS1-212ENST00000591041 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa15.87■□□□□ 0.13
CAPNS1-212ENST00000591041 SEC11AP67812 179 aa15.87■□□□□ 0.13
CAPNS1-212ENST00000591041 PRO1933Q9H354 126 aa15.87■□□□□ 0.13
CAPNS1-212ENST00000591041 FGF6P10767 208 aa15.86■□□□□ 0.13
CAPNS1-212ENST00000591041 CHCHD5Q9BSY4 110 aa15.86■□□□□ 0.13
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A0J9YY99 117 aa15.85■□□□□ 0.13
CAPNS1-212ENST00000591041 MIEN1Q9BRT3 115 aa15.85■□□□□ 0.13
CAPNS1-212ENST00000591041 hDV102S1A0JD36 115 aa15.84■□□□□ 0.13
CAPNS1-212ENST00000591041 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa15.84■□□□□ 0.13
CAPNS1-212ENST00000591041 AMELXQ99217 191 aa15.84■□□□□ 0.13
CAPNS1-212ENST00000591041 B9D2Q9BPU9 175 aa15.84■□□□□ 0.13
CAPNS1-212ENST00000591041 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
CAPNS1-212ENST00000591041 DDTP30046 118 aa15.83■□□□□ 0.12
CAPNS1-212ENST00000591041 VSIG2Q96IQ7 327 aa15.83■□□□□ 0.12
CAPNS1-212ENST00000591041 TRAV10A0A0B4J240 114 aa15.81■□□□□ 0.12
CAPNS1-212ENST00000591041 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa15.81■□□□□ 0.12
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC25A34Q6PIV7 304 aa15.81■□□□□ 0.12
CAPNS1-212ENST00000591041 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa15.8■□□□□ 0.12
CAPNS1-212ENST00000591041 IGLC3P0DOY3 106 aa15.8■□□□□ 0.12
CAPNS1-212ENST00000591041 TIRAPP58753 221 aa15.8■□□□□ 0.12
CAPNS1-212ENST00000591041 Q6ZTC4 211 aa15.8■□□□□ 0.12
CAPNS1-212ENST00000591041 NFE4Q86UQ8 179 aa15.8■□□□□ 0.12
CAPNS1-212ENST00000591041 CHAC1Q9BUX1 264 aa15.78■□□□□ 0.12
CAPNS1-212ENST00000591041 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
CAPNS1-212ENST00000591041 C11orf86A6NJI1 115 aa15.77■□□□□ 0.12
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM262E9PQX1 116 aa15.77■□□□□ 0.12
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CAPNS1-212ENST00000591041 MAJINQ3KP22 176 aa15.77■□□□□ 0.12
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM170BQ5T4T1 132 aa15.77■□□□□ 0.12
CAPNS1-212ENST00000591041 LELP1Q5T871 98 aa15.77■□□□□ 0.12
CAPNS1-212ENST00000591041 Q6ZUT4 128 aa15.77■□□□□ 0.12
CAPNS1-212ENST00000591041 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa15.76■□□□□ 0.11
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CAPNS1-212ENST00000591041 COX8AP10176 69 aa15.76■□□□□ 0.11
CAPNS1-212ENST00000591041 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
CAPNS1-212ENST00000591041 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
CAPNS1-212ENST00000591041 STPG4Q8N801 248 aa15.76■□□□□ 0.11
CAPNS1-212ENST00000591041 C15orf53Q8NAA6 179 aa15.76■□□□□ 0.11
CAPNS1-212ENST00000591041 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
CAPNS1-212ENST00000591041 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa15.76■□□□□ 0.11
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A1B0GUV1 79 aa15.75■□□□□ 0.11
CAPNS1-212ENST00000591041 NMUP48645 174 aa15.75■□□□□ 0.11
CAPNS1-212ENST00000591041 HERVK_113P63121 156 aa15.75■□□□□ 0.11
CAPNS1-212ENST00000591041 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
CAPNS1-212ENST00000591041 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa15.74■□□□□ 0.11
CAPNS1-212ENST00000591041 CCL25O15444 150 aa15.74■□□□□ 0.11
CAPNS1-212ENST00000591041 DLEU1O43261 78 aa15.74■□□□□ 0.11
CAPNS1-212ENST00000591041 C14orf144Q96I85 54 aa15.74■□□□□ 0.11
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A096LPF7 62 aa15.73■□□□□ 0.11
CAPNS1-212ENST00000591041 E9PLD3 99 aa15.72■□□□□ 0.11
CAPNS1-212ENST00000591041 ANKRD39Q53RE8 183 aa15.72■□□□□ 0.11
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A0J9YXV3 536 aa15.71■□□□□ 0.11
CAPNS1-212ENST00000591041 UBE2D1P51668 147 aa15.71■□□□□ 0.11
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa15.7■□□□□ 0.1
CAPNS1-212ENST00000591041 PLEKHB2Q96CS7 222 aa15.7■□□□□ 0.1
CAPNS1-212ENST00000591041 DNAH3Q8TD57 4116 aa15.7■□□□□ 0.1
CAPNS1-212ENST00000591041 SIVA1O15304 175 aa15.69■□□□□ 0.1
CAPNS1-212ENST00000591041 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
CAPNS1-212ENST00000591041 LINC00469Q8N7U9 141 aa15.68■□□□□ 0.1
CAPNS1-212ENST00000591041 SS18Q15532 418 aa15.67■□□□□ 0.1
CAPNS1-212ENST00000591041 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
CAPNS1-212ENST00000591041 LYPD5Q6UWN5 251 aa15.67■□□□□ 0.1
CAPNS1-212ENST00000591041 BOD1L2Q8IYS8 172 aa15.67■□□□□ 0.1
CAPNS1-212ENST00000591041 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa15.66■□□□□ 0.1
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
CAPNS1-212ENST00000591041 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
CAPNS1-212ENST00000591041 RBX1P62877 108 aa15.66■□□□□ 0.1
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM104AQ969W3 186 aa15.65■□□□□ 0.1
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM223A0PJW6 202 aa15.64■□□□□ 0.09
CAPNS1-212ENST00000591041 LEPROTO15243 131 aa15.64■□□□□ 0.09
CAPNS1-212ENST00000591041 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa15.62■□□□□ 0.09
CAPNS1-212ENST00000591041 LINC00587B1AMM8 73 aa15.62■□□□□ 0.09
CAPNS1-212ENST00000591041 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa15.61■□□□□ 0.09
CAPNS1-212ENST00000591041 M0R143 59 aa15.61■□□□□ 0.09
CAPNS1-212ENST00000591041 MPV17L2Q567V2 206 aa15.61■□□□□ 0.09
CAPNS1-212ENST00000591041 LINC00242Q5T6M2 205 aa15.61■□□□□ 0.09
CAPNS1-212ENST00000591041 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa15.6■□□□□ 0.09
CAPNS1-212ENST00000591041 ANGP03950 147 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
CAPNS1-212ENST00000591041 TCTAP57738 103 aa15.6■□□□□ 0.09
CAPNS1-212ENST00000591041 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa15.59■□□□□ 0.09
CAPNS1-212ENST00000591041 J3QQQ9 107 aa15.59■□□□□ 0.09
CAPNS1-212ENST00000591041 HIGD1BQ9P298 99 aa15.59■□□□□ 0.09
CAPNS1-212ENST00000591041 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
CAPNS1-212ENST00000591041 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa15.58■□□□□ 0.08
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF815PA8K554 130 aa15.58■□□□□ 0.08
CAPNS1-212ENST00000591041 CTAG1AP78358 180 aa15.58■□□□□ 0.08
CAPNS1-212ENST00000591041 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
CAPNS1-212ENST00000591041 PCP2Q8IVA1 136 aa15.58■□□□□ 0.08
CAPNS1-212ENST00000591041 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa15.57■□□□□ 0.08
CAPNS1-212ENST00000591041 CCL18P55774 89 aa15.57■□□□□ 0.08
CAPNS1-212ENST00000591041 SCGB1D4Q6XE38 83 aa15.57■□□□□ 0.08
CAPNS1-212ENST00000591041 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa15.56■□□□□ 0.08
CAPNS1-212ENST00000591041 CRPP02741 224 aa15.56■□□□□ 0.08
CAPNS1-212ENST00000591041 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa15.55■□□□□ 0.08
CAPNS1-212ENST00000591041 REG3AQ06141 175 aa15.54■□□□□ 0.08
CAPNS1-212ENST00000591041 HSD52Q0P140 79 aa15.54■□□□□ 0.08
CAPNS1-212ENST00000591041 LINC01561Q8N1V8 128 aa15.54■□□□□ 0.08
CAPNS1-212ENST00000591041 LINC00269Q8N2A0 174 aa15.54■□□□□ 0.08
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