RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590105.1

EFTUD2-216, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-216ENST00000590105 CXCL1P09341 107 aa5.11□□□□□ -1.59
EFTUD2-216ENST00000590105 RPS20P60866 119 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
EFTUD2-216ENST00000590105 REG3AQ06141 175 aa5.11□□□□□ -1.59
EFTUD2-216ENST00000590105 RHOHQ15669 191 aa5.11□□□□□ -1.59
EFTUD2-216ENST00000590105 ALKAL2Q6UX46 152 aa5.11□□□□□ -1.59
EFTUD2-216ENST00000590105 SMIM12Q96EX1 92 aa5.11□□□□□ -1.59
EFTUD2-216ENST00000590105 SFRP2Q96HF1 295 aa5.11□□□□□ -1.59
EFTUD2-216ENST00000590105 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa5.1□□□□□ -1.59
EFTUD2-216ENST00000590105 M0R381 172 aa5.1□□□□□ -1.59
EFTUD2-216ENST00000590105 IGLV2-8P01709 118 aa5.1□□□□□ -1.59
EFTUD2-216ENST00000590105 CRYGDP07320 174 aa5.1□□□□□ -1.59
EFTUD2-216ENST00000590105 BCL2P10415 239 aa5.1□□□□□ -1.59
EFTUD2-216ENST00000590105 GNG4P50150 75 aa5.1□□□□□ -1.59
EFTUD2-216ENST00000590105 ZFP82Q8N141 532 aa5.1□□□□□ -1.59
EFTUD2-216ENST00000590105 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa5.1□□□□□ -1.59
EFTUD2-216ENST00000590105 DERL1Q9BUN8 251 aa5.1□□□□□ -1.59
EFTUD2-216ENST00000590105 SAMD10Q9BYL1 202 aa5.1□□□□□ -1.59
EFTUD2-216ENST00000590105 DNAH2Q9P225 4427 aa5.1□□□□□ -1.59
EFTUD2-216ENST00000590105 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-216ENST00000590105 A0A1B0GVY2 172 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-216ENST00000590105 EVI2AP22794 236 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-216ENST00000590105 RPL19P84098 196 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-216ENST00000590105 CENPWQ5EE01 88 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-216ENST00000590105 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-216ENST00000590105 GTSF1LQ9H1H1 148 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-216ENST00000590105 LY96Q9Y6Y9 160 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-216ENST00000590105 C19orf71A6NCJ1 209 aa5.08□□□□□ -1.6
EFTUD2-216ENST00000590105 F2Z2F3 143 aa5.08□□□□□ -1.6
EFTUD2-216ENST00000590105 TMEM250H0YL14 139 aa5.08□□□□□ -1.6
EFTUD2-216ENST00000590105 RAB4BP61018 213 aa5.08□□□□□ -1.6
EFTUD2-216ENST00000590105 HIGD2BQ4VC39 106 aa5.08□□□□□ -1.6
EFTUD2-216ENST00000590105 LELP1Q5T871 98 aa5.08□□□□□ -1.6
EFTUD2-216ENST00000590105 SPANXN1Q5VSR9 72 aa5.08□□□□□ -1.6
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
EFTUD2-216ENST00000590105 OR2D3Q8NGH3 330 aa5.08□□□□□ -1.6
EFTUD2-216ENST00000590105 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
EFTUD2-216ENST00000590105 BIRC6Q9NR09 4857 aa5.07□□□□□ -1.6
EFTUD2-216ENST00000590105 A0A087WWC5 75 aa5.07□□□□□ -1.6
EFTUD2-216ENST00000590105 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa5.07□□□□□ -1.6
EFTUD2-216ENST00000590105 IFITM10A6NMD0 228 aa5.07□□□□□ -1.6
EFTUD2-216ENST00000590105 DNAH10OSP0CZ25 163 aa5.07□□□□□ -1.6
EFTUD2-216ENST00000590105 PSMB2P49721 201 aa5.07□□□□□ -1.6
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM74A4Q5TZK3 123 aa5.07□□□□□ -1.6
EFTUD2-216ENST00000590105 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa5.07□□□□□ -1.6
EFTUD2-216ENST00000590105 C10orf126Q8N4M7 172 aa5.07□□□□□ -1.6
EFTUD2-216ENST00000590105 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
EFTUD2-216ENST00000590105 OR10AG1Q8NH19 301 aa5.07□□□□□ -1.6
EFTUD2-216ENST00000590105 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa5.06□□□□□ -1.6
EFTUD2-216ENST00000590105 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa5.06□□□□□ -1.6
EFTUD2-216ENST00000590105 MUC21A0A140T8X8 626 aa5.06□□□□□ -1.6
EFTUD2-216ENST00000590105 IGLC6P0CF74 106 aa5.06□□□□□ -1.6
EFTUD2-216ENST00000590105 SMIM17P0DL12 118 aa5.06□□□□□ -1.6
EFTUD2-216ENST00000590105 GZMBP10144 247 aa5.06□□□□□ -1.6
EFTUD2-216ENST00000590105 WFDC10BQ8IUB3 73 aa5.06□□□□□ -1.6
EFTUD2-216ENST00000590105 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa5.06□□□□□ -1.6
EFTUD2-216ENST00000590105 TMEM101Q96IK0 257 aa5.06□□□□□ -1.6
EFTUD2-216ENST00000590105 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa5.05□□□□□ -1.6
EFTUD2-216ENST00000590105 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa5.05□□□□□ -1.6
EFTUD2-216ENST00000590105 NDUFS5O43920 106 aa5.05□□□□□ -1.6
EFTUD2-216ENST00000590105 SRP19P09132 144 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
EFTUD2-216ENST00000590105 NTF3P20783 257 aa5.05□□□□□ -1.6
EFTUD2-216ENST00000590105 LINC00315P59091 139 aa5.05□□□□□ -1.6
EFTUD2-216ENST00000590105 ORMDL2Q53FV1 153 aa5.05□□□□□ -1.6
EFTUD2-216ENST00000590105 LINC01556Q5JQF7 62 aa5.05□□□□□ -1.6
EFTUD2-216ENST00000590105 TEX261Q6UWH6 196 aa5.05□□□□□ -1.6
EFTUD2-216ENST00000590105 LYZL1Q6UWQ5 148 aa5.05□□□□□ -1.6
EFTUD2-216ENST00000590105 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM104AQ969W3 186 aa5.05□□□□□ -1.6
EFTUD2-216ENST00000590105 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa5.05□□□□□ -1.6
EFTUD2-216ENST00000590105 SMIM26A0A096LP01 95 aa5.04□□□□□ -1.6
EFTUD2-216ENST00000590105 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa5.04□□□□□ -1.6
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF727A8MUV8 499 aa5.04□□□□□ -1.6
EFTUD2-216ENST00000590105 A8MWL6 223 aa5.04□□□□□ -1.6
EFTUD2-216ENST00000590105 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
EFTUD2-216ENST00000590105 UBE2D3P61077 147 aa5.04□□□□□ -1.6
EFTUD2-216ENST00000590105 UBE2D2P62837 147 aa5.04□□□□□ -1.6
EFTUD2-216ENST00000590105 PEA15Q15121 130 aa5.04□□□□□ -1.6
EFTUD2-216ENST00000590105 TMEM241Q24JQ0 296 aa5.04□□□□□ -1.6
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM231DQ6ZW35 169 aa5.04□□□□□ -1.6
EFTUD2-216ENST00000590105 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
EFTUD2-216ENST00000590105 PRO0628Q9UI54 55 aa5.04□□□□□ -1.6
EFTUD2-216ENST00000590105 IGHV3-30P01768 117 aa5.03□□□□□ -1.6
EFTUD2-216ENST00000590105 IGHV3-33P01772 117 aa5.03□□□□□ -1.6
EFTUD2-216ENST00000590105 TRGC1P0CF51 173 aa5.03□□□□□ -1.6
EFTUD2-216ENST00000590105 LINC00694P0DN24 101 aa5.03□□□□□ -1.6
EFTUD2-216ENST00000590105 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa5.03□□□□□ -1.6
EFTUD2-216ENST00000590105 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa5.03□□□□□ -1.6
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF56Q15929 161 aa5.03□□□□□ -1.6
EFTUD2-216ENST00000590105 TMEM97Q5BJF2 176 aa5.03□□□□□ -1.6
EFTUD2-216ENST00000590105 DNAJC30Q96LL9 226 aa5.03□□□□□ -1.6
EFTUD2-216ENST00000590105 SMIM7Q9BQ49 75 aa5.03□□□□□ -1.6
EFTUD2-216ENST00000590105 SMDT1Q9H4I9 107 aa5.03□□□□□ -1.6
EFTUD2-216ENST00000590105 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
EFTUD2-216ENST00000590105 FAT2Q9NYQ8 4349 aa5.03□□□□□ -1.6
EFTUD2-216ENST00000590105 TMEM262E9PQX1 116 aa5.02□□□□□ -1.61
EFTUD2-216ENST00000590105 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
EFTUD2-216ENST00000590105 ELOBQ15370 118 aa5.02□□□□□ -1.61
EFTUD2-216ENST00000590105 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
EFTUD2-216ENST00000590105 SMIM15Q7Z3B0 74 aa5.02□□□□□ -1.61
EFTUD2-216ENST00000590105 SPATA12Q7Z6I5 190 aa5.02□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms