RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579527.5

TSPOAP1-AS1-203, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TSPOAP1-AS1, Length 2,042 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 SH2D6Q7Z4S9 175 aa18.36■□□□□ 0.53
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 SMR3AQ99954 134 aa18.36■□□□□ 0.53
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 K7EQD1 137 aa18.35■□□□□ 0.53
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 Q6ZTI0 123 aa18.35■□□□□ 0.53
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 WFDC10AQ9H1F0 79 aa18.35■□□□□ 0.53
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 UNC79Q9P2D8 2635 aa18.35■□□□□ 0.53
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa18.35■□□□□ 0.53
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 SFTA2Q6UW10 78 aa18.35■□□□□ 0.53
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 MTURNQ8N3F0 131 aa18.35■□□□□ 0.53
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 LITAFQ99732 161 aa18.35■□□□□ 0.53
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 NDUFA12Q9UI09 145 aa18.35■□□□□ 0.53
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa18.33■□□□□ 0.53
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.53
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.53
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa18.33■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 C16orf74Q96GX8 76 aa18.33■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa18.33■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 SPANXDQ9BXN6 97 aa18.33■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 SPANXCQ9NY87 97 aa18.33■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 IGHV3-33P01772 117 aa18.32■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 SPINK8P0C7L1 97 aa18.32■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 TCL1BO95988 128 aa18.32■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 ZFAND6Q6FIF0 208 aa18.32■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 ERG28Q9UKR5 140 aa18.3■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 PLAC8L1A1L4L8 177 aa18.29■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 SCGB1C2P0DMR2 95 aa18.29■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 SMAGPQ0VAQ4 97 aa18.29■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa18.29■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa18.29■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 MTORP42345 2549 aa18.29■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa18.28■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 LY6G6DO95868 133 aa18.28■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 KRTAP10-3P60369 221 aa18.28■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 HERVK_113P63121 156 aa18.28■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 CIDEAO60543 219 aa18.27■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 TIMM17BO60830 172 aa18.27■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 MIAQ16674 131 aa18.27■□□□□ 0.51
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 SBSPONQ8IVN8 264 aa18.25■□□□□ 0.51
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa18.25■□□□□ 0.51
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa18.25■□□□□ 0.51
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 RNF183Q96D59 192 aa18.25■□□□□ 0.51
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 OVOL2Q9BRP0 275 aa18.25■□□□□ 0.51
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 A8MZ25 164 aa18.24■□□□□ 0.51
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 NDUFA1O15239 70 aa18.24■□□□□ 0.51
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 LINC00694P0DN24 101 aa18.24■□□□□ 0.51
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 TMEM101Q96IK0 257 aa18.24■□□□□ 0.51
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 PRSS2P07478 247 aa18.23■□□□□ 0.51
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 GTSF1LQ9H1H1 148 aa18.23■□□□□ 0.51
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 PF4P02776 101 aa18.23■□□□□ 0.51
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 FOXI1Q12951 378 aa18.23■□□□□ 0.51
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 LINC00242Q5T6M2 205 aa18.23■□□□□ 0.51
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 LINC00482Q8N8I6 264 aa18.23■□□□□ 0.51
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 GAGE12JA6NER3 117 aa18.22■□□□□ 0.51
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 GAGE4Q13068 117 aa18.22■□□□□ 0.51
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 GAGE5Q13069 117 aa18.22■□□□□ 0.51
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 COX6A2Q02221 97 aa18.22■□□□□ 0.51
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa18.21■□□□□ 0.51
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 GAGE12HA6NDE8 117 aa18.21■□□□□ 0.51
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 GAGE7O76087 117 aa18.21■□□□□ 0.51
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 GAGE12FP0CL80 117 aa18.21■□□□□ 0.51
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 GAGE12GP0CL81 117 aa18.21■□□□□ 0.51
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 GAGE12IP0CL82 117 aa18.21■□□□□ 0.51
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 IFITM1P13164 125 aa18.21■□□□□ 0.51
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 SPATA25Q9BR10 227 aa18.21■□□□□ 0.51
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 TRGV2A0A075B6R0 118 aa18.2■□□□□ 0.5
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 FASNP49327 2511 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 HIVEP2P31629 2446 aa18.2■□□□□ 0.5
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa18.2■□□□□ 0.5
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 Q1RN00 199 aa18.2■□□□□ 0.5
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 INSL3P51460 131 aa18.19■□□□□ 0.5
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 TEN1Q86WV5 123 aa18.19■□□□□ 0.5
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa18.19■□□□□ 0.5
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa18.18■□□□□ 0.5
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 H7C2G1 150 aa18.18■□□□□ 0.5
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 M0QXV9 152 aa18.18■□□□□ 0.5
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 H7C423 109 aa18.17■□□□□ 0.5
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 SIGMAR1Q99720 223 aa18.17■□□□□ 0.5
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 TMEM243Q9BU79 118 aa18.17■□□□□ 0.5
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 UBE2L6O14933 153 aa18.16■□□□□ 0.5
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 PPDPFLQ8WWR9 84 aa18.16■□□□□ 0.5
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP18.16■□□□□ 0.5
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 JMJD1CQ15652 2540 aa18.14■□□□□ 0.49
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 ATXN8Q156A1 80 aa18.14■□□□□ 0.49
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa18.13■□□□□ 0.49
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 SMIM1B2RUZ4 78 aa18.13■□□□□ 0.49
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa18.12■□□□□ 0.49
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 Q9H8V8 135 aa18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 92.2 ms