RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576691.5

TBCD-223, Transcript of tubulin folding cofactor D, human

TSL 3

Gene TBCD, Length 929 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TBCD-223	ENST00000576691	ERAS	Q7Z444	233 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TBCD-223	ENST00000576691		Q8N976	141 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TBCD-223	ENST00000576691	IGIP	A6NJ69	53 aa		11.38	□□□□□ -0.59
TBCD-223	ENST00000576691	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		11.38	□□□□□ -0.59
TBCD-223	ENST00000576691	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
TBCD-223	ENST00000576691	NDUFA6	P56556	154 aa		11.38	□□□□□ -0.59
TBCD-223	ENST00000576691	LINC00310	P59036	64 aa		11.38	□□□□□ -0.59
TBCD-223	ENST00000576691	TMEM141	Q96I45	108 aa		11.38	□□□□□ -0.59
TBCD-223	ENST00000576691	TIMM17A	Q99595	171 aa		11.38	□□□□□ -0.59
TBCD-223	ENST00000576691	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		11.38	□□□□□ -0.59
TBCD-223	ENST00000576691	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TBCD-223	ENST00000576691	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TBCD-223	ENST00000576691	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TBCD-223	ENST00000576691	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TBCD-223	ENST00000576691		A0A096LNJ9	63 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TBCD-223	ENST00000576691		Q8N3U1	123 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TBCD-223	ENST00000576691	PRR34	Q9NV39	138 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TBCD-223	ENST00000576691	KLK12	Q9UKR0	248 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TBCD-223	ENST00000576691	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TBCD-223	ENST00000576691	NUPR1	O60356	82 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TBCD-223	ENST00000576691	ATP5L	O75964	103 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TBCD-223	ENST00000576691	PDZD11	Q5EBL8	140 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TBCD-223	ENST00000576691		Q6ZR54	194 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TBCD-223	ENST00000576691	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
TBCD-223	ENST00000576691	S100A6	P06703	90 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TBCD-223	ENST00000576691	PMCHL1	Q16048	86 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TBCD-223	ENST00000576691		Q6ZN92	141 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TBCD-223	ENST00000576691	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TBCD-223	ENST00000576691	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TBCD-223	ENST00000576691	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TBCD-223	ENST00000576691	CCL25	O15444	150 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TBCD-223	ENST00000576691	REG3A	Q06141	175 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TBCD-223	ENST00000576691	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TBCD-223	ENST00000576691	VCX2	Q9H322	139 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TBCD-223	ENST00000576691	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TBCD-223	ENST00000576691	CRP	P02741	224 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TBCD-223	ENST00000576691	MIA	Q16674	131 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TBCD-223	ENST00000576691	ENHO	Q6UWT2	76 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TBCD-223	ENST00000576691	NFE4	Q86UQ8	179 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TBCD-223	ENST00000576691	FAM104A	Q969W3	186 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TBCD-223	ENST00000576691	UBE2W	Q96B02	151 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TBCD-223	ENST00000576691	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
TBCD-223	ENST00000576691	LEPROTL1	O95214	131 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TBCD-223	ENST00000576691		Q6ZUT4	128 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TBCD-223	ENST00000576691	RMI2	Q96E14	147 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TBCD-223	ENST00000576691	AMELX	Q99217	191 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TBCD-223	ENST00000576691	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TBCD-223	ENST00000576691	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TBCD-223	ENST00000576691		M0R2N4	97 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TBCD-223	ENST00000576691	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TBCD-223	ENST00000576691	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
TBCD-223	ENST00000576691	COX11	Q9Y6N1	276 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TBCD-223	ENST00000576691	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TBCD-223	ENST00000576691	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TBCD-223	ENST00000576691	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TBCD-223	ENST00000576691	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TBCD-223	ENST00000576691	SS18	Q15532	418 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TBCD-223	ENST00000576691	TM2D2	Q9BX73	214 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TBCD-223	ENST00000576691	PMVK	Q15126	192 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TBCD-223	ENST00000576691	BAALC	Q8WXS3	180 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TBCD-223	ENST00000576691	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TBCD-223	ENST00000576691	IFITM10	A6NMD0	228 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TBCD-223	ENST00000576691	PRSS1	P07477	247 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TBCD-223	ENST00000576691	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
TBCD-223	ENST00000576691	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TBCD-223	ENST00000576691	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TBCD-223	ENST00000576691	C6orf223	Q8N319	242 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TBCD-223	ENST00000576691	CST9L	Q9H4G1	147 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TBCD-223	ENST00000576691		Q9HAA7	133 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TBCD-223	ENST00000576691	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TBCD-223	ENST00000576691	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TBCD-223	ENST00000576691	C5orf52	A6NGY3	159 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TBCD-223	ENST00000576691	FABP4	P15090	132 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TBCD-223	ENST00000576691	SEC11A	P67812	179 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TBCD-223	ENST00000576691	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TBCD-223	ENST00000576691	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TBCD-223	ENST00000576691	KMT2A	Q03164	3969 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TBCD-223	ENST00000576691	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TBCD-223	ENST00000576691	S100A2	P29034	98 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TBCD-223	ENST00000576691	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
TBCD-223	ENST00000576691	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TBCD-223	ENST00000576691	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TBCD-223	ENST00000576691	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TBCD-223	ENST00000576691	UBE2D1	P51668	147 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TBCD-223	ENST00000576691	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
TBCD-223	ENST00000576691	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TBCD-223	ENST00000576691	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TBCD-223	ENST00000576691	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TBCD-223	ENST00000576691	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TBCD-223	ENST00000576691	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TBCD-223	ENST00000576691		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
TBCD-223	ENST00000576691	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TBCD-223	ENST00000576691	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TBCD-223	ENST00000576691	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TBCD-223	ENST00000576691	PSCA	O43653	123 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TBCD-223	ENST00000576691	XCL1	P47992	114 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TBCD-223	ENST00000576691	HERVK_113	P63121	156 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TBCD-223	ENST00000576691	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TBCD-223	ENST00000576691	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TBCD-223	ENST00000576691	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		11.19	□□□□□ -0.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 102.6 ms