RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572078.1

SPNS3-202, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS3, Length 463 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-202ENST00000572078 LINC00587B1AMM8 73 aa9.24□□□□□ -0.93
SPNS3-202ENST00000572078 CRYGDP07320 174 aa9.24□□□□□ -0.93
SPNS3-202ENST00000572078 LINC01545Q5VT33 79 aa9.24□□□□□ -0.93
SPNS3-202ENST00000572078 LYPD5Q6UWN5 251 aa9.24□□□□□ -0.93
SPNS3-202ENST00000572078 KIR2DL4Q99706 377 aa9.24□□□□□ -0.93
SPNS3-202ENST00000572078 MIEN1Q9BRT3 115 aa9.24□□□□□ -0.93
SPNS3-202ENST00000572078 JPT2Q9H910 190 aa9.24□□□□□ -0.93
SPNS3-202ENST00000572078 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
SPNS3-202ENST00000572078 H0Y8G0 127 aa9.23□□□□□ -0.93
SPNS3-202ENST00000572078 PAX4O43316 350 aa9.23□□□□□ -0.93
SPNS3-202ENST00000572078 WFDC10BQ8IUB3 73 aa9.23□□□□□ -0.93
SPNS3-202ENST00000572078 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
SPNS3-202ENST00000572078 ICOSQ9Y6W8 199 aa9.23□□□□□ -0.93
SPNS3-202ENST00000572078 PRSS1P07477 247 aa9.22□□□□□ -0.93
SPNS3-202ENST00000572078 CRYBA4P53673 196 aa9.22□□□□□ -0.93
SPNS3-202ENST00000572078 FHL2Q14192 279 aa9.22□□□□□ -0.93
SPNS3-202ENST00000572078 UQCR10Q9UDW1 63 aa9.22□□□□□ -0.93
SPNS3-202ENST00000572078 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
SPNS3-202ENST00000572078 M0QY20 66 aa9.21□□□□□ -0.94
SPNS3-202ENST00000572078 EREGO14944 169 aa9.21□□□□□ -0.94
SPNS3-202ENST00000572078 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
SPNS3-202ENST00000572078 ZFP2Q6ZN57 461 aa9.21□□□□□ -0.94
SPNS3-202ENST00000572078 Q6ZN92 141 aa9.21□□□□□ -0.94
SPNS3-202ENST00000572078 ATOH7Q8N100 152 aa9.21□□□□□ -0.94
SPNS3-202ENST00000572078 SDHAF1A6NFY7 115 aa9.2□□□□□ -0.94
SPNS3-202ENST00000572078 RS1O15537 224 aa9.2□□□□□ -0.94
SPNS3-202ENST00000572078 CIDEAO60543 219 aa9.2□□□□□ -0.94
SPNS3-202ENST00000572078 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
SPNS3-202ENST00000572078 TOMM6Q96B49 74 aa9.2□□□□□ -0.94
SPNS3-202ENST00000572078 DNAJC30Q96LL9 226 aa9.2□□□□□ -0.94
SPNS3-202ENST00000572078 SCGB3A1Q96QR1 104 aa9.2□□□□□ -0.94
SPNS3-202ENST00000572078 PRO0255Q9UI72 69 aa9.2□□□□□ -0.94
SPNS3-202ENST00000572078 CYSLTR1Q9Y271 337 aa9.2□□□□□ -0.94
SPNS3-202ENST00000572078 HMCN2Q8NDA2 5059 aa9.19□□□□□ -0.94
SPNS3-202ENST00000572078 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa9.19□□□□□ -0.94
SPNS3-202ENST00000572078 RHOHQ15669 191 aa9.19□□□□□ -0.94
SPNS3-202ENST00000572078 HHLA3Q9XRX5 114 aa9.19□□□□□ -0.94
SPNS3-202ENST00000572078 I3L3M4 83 aa9.18□□□□□ -0.94
SPNS3-202ENST00000572078 K7EQD1 137 aa9.18□□□□□ -0.94
SPNS3-202ENST00000572078 IGLC3P0DOY3 106 aa9.18□□□□□ -0.94
SPNS3-202ENST00000572078 GCSHP23434 173 aa9.18□□□□□ -0.94
SPNS3-202ENST00000572078 CFAP126Q5VTH2 177 aa9.18□□□□□ -0.94
SPNS3-202ENST00000572078 C2orf66Q6UXQ4 117 aa9.18□□□□□ -0.94
SPNS3-202ENST00000572078 NFE4Q86UQ8 179 aa9.18□□□□□ -0.94
SPNS3-202ENST00000572078 OR4C5Q8NGB2 326 aa9.18□□□□□ -0.94
SPNS3-202ENST00000572078 PMCHL2Q9BQD1 86 aa9.18□□□□□ -0.94
SPNS3-202ENST00000572078 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa9.17□□□□□ -0.94
SPNS3-202ENST00000572078 LRCOL1A6NCL2 159 aa9.17□□□□□ -0.94
SPNS3-202ENST00000572078 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
SPNS3-202ENST00000572078 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
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SPNS3-202ENST00000572078 ERASQ7Z444 233 aa9.17□□□□□ -0.94
SPNS3-202ENST00000572078 TMEM141Q96I45 108 aa9.17□□□□□ -0.94
SPNS3-202ENST00000572078 ZNF479Q96JC4 524 aa9.17□□□□□ -0.94
SPNS3-202ENST00000572078 DPM2O94777 84 aa9.16□□□□□ -0.94
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SPNS3-202ENST00000572078 UFSP1Q6NVU6 142 aa9.16□□□□□ -0.94
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SPNS3-202ENST00000572078 A0A087WX48 190 aa9.15□□□□□ -0.94
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SPNS3-202ENST00000572078 Q6ZSN1 163 aa9.15□□□□□ -0.94
SPNS3-202ENST00000572078 C14orf144Q96I85 54 aa9.15□□□□□ -0.94
SPNS3-202ENST00000572078 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa9.14□□□□□ -0.95
SPNS3-202ENST00000572078 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa9.14□□□□□ -0.95
SPNS3-202ENST00000572078 hDV102S1A0JD36 115 aa9.14□□□□□ -0.95
SPNS3-202ENST00000572078 M0R143 59 aa9.14□□□□□ -0.95
SPNS3-202ENST00000572078 IGKCP01834 107 aa9.14□□□□□ -0.95
SPNS3-202ENST00000572078 GYPEP15421 78 aa9.14□□□□□ -0.95
SPNS3-202ENST00000572078 PLNP26678 52 aa9.14□□□□□ -0.95
SPNS3-202ENST00000572078 ODF1Q14990 250 aa9.14□□□□□ -0.95
SPNS3-202ENST00000572078 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa9.14□□□□□ -0.95
SPNS3-202ENST00000572078 TIMM17AQ99595 171 aa9.14□□□□□ -0.95
SPNS3-202ENST00000572078 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa9.13□□□□□ -0.95
SPNS3-202ENST00000572078 MAJINQ3KP22 176 aa9.13□□□□□ -0.95
SPNS3-202ENST00000572078 UBR4Q5T4S7 5183 aa9.13□□□□□ -0.95
SPNS3-202ENST00000572078 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa9.12□□□□□ -0.95
SPNS3-202ENST00000572078 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa9.12□□□□□ -0.95
SPNS3-202ENST00000572078 FAM229AH3BQW9 127 aa9.12□□□□□ -0.95
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SPNS3-202ENST00000572078 F8VRH5 84 aa9.11□□□□□ -0.95
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SPNS3-202ENST00000572078 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
SPNS3-202ENST00000572078 K7EP13 123 aa9.1□□□□□ -0.95
SPNS3-202ENST00000572078 NPSP0C0P6 89 aa9.1□□□□□ -0.95
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SPNS3-202ENST00000572078 COTL1Q14019 142 aa9.1□□□□□ -0.95
SPNS3-202ENST00000572078 WFDC2Q14508 124 aa9.1□□□□□ -0.95
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SPNS3-202ENST00000572078 Q8N814 137 aa9.1□□□□□ -0.95
SPNS3-202ENST00000572078 C20orf203Q8NBC4 194 aa9.1□□□□□ -0.95
SPNS3-202ENST00000572078 J3QL48 77 aa9.09□□□□□ -0.95
SPNS3-202ENST00000572078 CTAG1AP78358 180 aa9.09□□□□□ -0.95
SPNS3-202ENST00000572078 BAALCQ8WXS3 180 aa9.09□□□□□ -0.95
SPNS3-202ENST00000572078 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
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